| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-17页 |
| 1.1 引言 | 第8-9页 |
| 1.2 基因组拷贝变异研究进展 | 第9-13页 |
| 1.2.1 CNV的定义和常见形式 | 第9页 |
| 1.2.2 CNV形成机制 | 第9-10页 |
| 1.2.3 CNV作用机制 | 第10-12页 |
| 1.2.4 CNV的检测方法 | 第12-13页 |
| 1.3 CNV在家畜基因组中的研究进展 | 第13-15页 |
| 1.3.1 猪CNV的研究进展 | 第14页 |
| 1.3.2 CNV在其它家畜基因组中研究进展 | 第14-15页 |
| 1.4 猪四肢骨骼长度的研究进展 | 第15页 |
| 1.5 巴马香猪概况 | 第15-16页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第16-17页 |
| 第二章 研究正文 | 第17-39页 |
| 2.1 前言 | 第17页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第17-22页 |
| 2.2.1 实验动物 | 第17页 |
| 2.2.2 表型的测定 | 第17-18页 |
| 2.2.3 描述性统计分析 | 第18页 |
| 2.2.4 基因分型和质量控制 | 第18页 |
| 2.2.5 CNV的检测 | 第18-20页 |
| 2.2.6 CNVR的定义 | 第20页 |
| 2.2.7 CNVR中基因及其功能的发掘 | 第20-21页 |
| 2.2.8 全基因组关联分析对CNVR的验证 | 第21-22页 |
| 2.2.9 标记密度对CNV检验的影响 | 第22页 |
| 2.2.10 CNVR对5个骨骼性状影响的统计检验 | 第22页 |
| 2.3 结果 | 第22-36页 |
| 2.3.1 表型数据统计结果 | 第22页 |
| 2.3.2 芯片质控结果 | 第22-23页 |
| 2.3.3 拷贝数变异区域图谱的构建 | 第23-31页 |
| 2.3.4 标记密度对CNV检测的影响 | 第31页 |
| 2.3.5 CNVR包含的基因及其功能分析 | 第31-32页 |
| 2.3.6 全基因组关联分析对CNVR的验证 | 第32页 |
| 2.3.7 CNVR与5个四肢骨骼长度关联分析结果 | 第32-36页 |
| 2.4 讨论 | 第36-38页 |
| 2.4.1 高密度SNP芯片的优势 | 第36页 |
| 2.4.2 CNV不同检测方法的比较 | 第36页 |
| 2.4.3 CNV的验证效率比较低 | 第36页 |
| 2.4.4 SNP芯片密度对CNV检测率和准确性的影响 | 第36-37页 |
| 2.4.5 关联的CNVR区域与前人研究结果的比较 | 第37-38页 |
| 2.5 小结 | 第38-39页 |
| 参考文献 | 第39-45页 |
| 致谢 | 第45-47页 |
| 附录 Appendix | 第47-55页 |
| 文章发表 | 第55页 |
