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EIN3/EIL家族的系统进化

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第一章 文献综述第9-23页
    1.1 引言第9页
    1.2 植物基因组学研究进展第9-13页
        1.2.1 植物基因组测序研究进展第9-10页
        1.2.2 植物比较基因组学和系统发育分析第10-12页
        1.2.3 功能基因组学研究进展第12-13页
    1.3 植物成花调控基因研究进展第13-17页
        1.3.1 植物成花基因国内外研究现状和进展第13-15页
        1.3.2 植物花器官发育的分子机理研究进展第15-16页
        1.3.3 EIN3/EIL家族基因概述第16-17页
    1.4 生物信息学研究进展第17-21页
        1.4.1 生物信息学在基因序列研究中的应用第18页
        1.4.2 生物信息学在蛋白质序列研究中的应用第18页
        1.4.3 TAIR数据库第18-19页
        1.4.4 Phytozome数据库第19页
        1.4.5 系统发育分析软件第19-21页
    1.5 本研究的目的和意义第21-23页
第二章 材料与方法第23-27页
    2.1 数据的收集及本地数据库的构建第23页
    2.2 成花调控相关基因的选取及鉴定第23-24页
    2.3 EIN3/EIL转录因子家族蛋白的同源查找第24页
    2.4 多序列比对和系统发育分析第24页
    2.5 EIN3/EIL转录因子家族基因和蛋白质结构及基序分析第24-25页
    2.6 染色体定位及一级结构和理化性质的分析第25页
    2.7 串联重复和共线性分析第25页
    2.8 EIN3/EIL转录因子家族基因的表达分析第25-27页
第三章 结果与分析第27-51页
    3.1 EIN3/EIL转录因子基因家族成员的鉴定第27-29页
    3.2 EIN3/EIL转录因子基因家族分子进化分析第29-32页
    3.3 禾本科EIN3/EIL亚家族基因序列及结构分析第32-38页
        3.3.1 禾本科各个亚家族成员蛋白的一级结构和理化性质分析第33-34页
        3.3.2 禾本科EIN3/EIL亚家族成员蛋白磷酸化位点分析第34-36页
        3.3.3 禾本科EIN3/EIL亚家族内含子-外显子结构分析第36页
        3.3.4 禾本科EIN3/EIL亚家族蛋白结构和非EIN3结构域保守基序分析第36-38页
    3.4 双子叶植物EIN3/EIL亚家族基因序列及结构分析第38-41页
        3.4.1 S5、S6亚家族成员蛋白一级结构和理化性质分析第38-39页
        3.4.2 S5、S6亚家族成员蛋白磷酸化位点分析第39-40页
        3.4.3 双子叶植物EIN3/EIL亚家族内含子-外显子结构分析第40页
        3.4.4 双子叶植物EIN3/EIL蛋白结构和非EIN3结构域保守基序分析第40-41页
    3.5 EIN3/EIL基因家族共线性分析和基因复制事件第41-46页
        3.5.1 水稻和高粱中EIN3/EIL基因家族染色体定位和基因复制事件第41-44页
        3.5.2 EIN3/EIL家族基因基因组重复事件和共线性分析第44-46页
    3.6 EIN3/EIL家族基因的表达和功能分化第46-51页
第四章 讨论第51-54页
第五章 结论第54-55页
参考文献第55-62页
附录第62-84页
致谢第84-85页
作者简介第85页

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