摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 文献综述 | 第9-23页 |
1.1 引言 | 第9页 |
1.2 植物基因组学研究进展 | 第9-13页 |
1.2.1 植物基因组测序研究进展 | 第9-10页 |
1.2.2 植物比较基因组学和系统发育分析 | 第10-12页 |
1.2.3 功能基因组学研究进展 | 第12-13页 |
1.3 植物成花调控基因研究进展 | 第13-17页 |
1.3.1 植物成花基因国内外研究现状和进展 | 第13-15页 |
1.3.2 植物花器官发育的分子机理研究进展 | 第15-16页 |
1.3.3 EIN3/EIL家族基因概述 | 第16-17页 |
1.4 生物信息学研究进展 | 第17-21页 |
1.4.1 生物信息学在基因序列研究中的应用 | 第18页 |
1.4.2 生物信息学在蛋白质序列研究中的应用 | 第18页 |
1.4.3 TAIR数据库 | 第18-19页 |
1.4.4 Phytozome数据库 | 第19页 |
1.4.5 系统发育分析软件 | 第19-21页 |
1.5 本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
第二章 材料与方法 | 第23-27页 |
2.1 数据的收集及本地数据库的构建 | 第23页 |
2.2 成花调控相关基因的选取及鉴定 | 第23-24页 |
2.3 EIN3/EIL转录因子家族蛋白的同源查找 | 第24页 |
2.4 多序列比对和系统发育分析 | 第24页 |
2.5 EIN3/EIL转录因子家族基因和蛋白质结构及基序分析 | 第24-25页 |
2.6 染色体定位及一级结构和理化性质的分析 | 第25页 |
2.7 串联重复和共线性分析 | 第25页 |
2.8 EIN3/EIL转录因子家族基因的表达分析 | 第25-27页 |
第三章 结果与分析 | 第27-51页 |
3.1 EIN3/EIL转录因子基因家族成员的鉴定 | 第27-29页 |
3.2 EIN3/EIL转录因子基因家族分子进化分析 | 第29-32页 |
3.3 禾本科EIN3/EIL亚家族基因序列及结构分析 | 第32-38页 |
3.3.1 禾本科各个亚家族成员蛋白的一级结构和理化性质分析 | 第33-34页 |
3.3.2 禾本科EIN3/EIL亚家族成员蛋白磷酸化位点分析 | 第34-36页 |
3.3.3 禾本科EIN3/EIL亚家族内含子-外显子结构分析 | 第36页 |
3.3.4 禾本科EIN3/EIL亚家族蛋白结构和非EIN3结构域保守基序分析 | 第36-38页 |
3.4 双子叶植物EIN3/EIL亚家族基因序列及结构分析 | 第38-41页 |
3.4.1 S5、S6亚家族成员蛋白一级结构和理化性质分析 | 第38-39页 |
3.4.2 S5、S6亚家族成员蛋白磷酸化位点分析 | 第39-40页 |
3.4.3 双子叶植物EIN3/EIL亚家族内含子-外显子结构分析 | 第40页 |
3.4.4 双子叶植物EIN3/EIL蛋白结构和非EIN3结构域保守基序分析 | 第40-41页 |
3.5 EIN3/EIL基因家族共线性分析和基因复制事件 | 第41-46页 |
3.5.1 水稻和高粱中EIN3/EIL基因家族染色体定位和基因复制事件 | 第41-44页 |
3.5.2 EIN3/EIL家族基因基因组重复事件和共线性分析 | 第44-46页 |
3.6 EIN3/EIL家族基因的表达和功能分化 | 第46-51页 |
第四章 讨论 | 第51-54页 |
第五章 结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-62页 |
附录 | 第62-84页 |
致谢 | 第84-85页 |
作者简介 | 第85页 |