| 中文摘要 | 第4-5页 |
| 英文摘要 | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-16页 |
| 1.1 鸮形目鸟类概述 | 第8-9页 |
| 1.2 鸮形目鸟类视觉的生物学概述 | 第9-11页 |
| 1.3 脊椎动物视蛋白基因适应性进化研究进展 | 第11-14页 |
| 1.3.1 Rh1基因 | 第12-13页 |
| 1.3.2 Rh2基因 | 第13页 |
| 1.3.3 Sws1和Sws2基因 | 第13-14页 |
| 1.3.4 Lws/Mws基因 | 第14页 |
| 1.4 脊椎动物视觉基因的研究现状 | 第14-15页 |
| 1.5 本研究拟解决的问题 | 第15页 |
| 1.6 研究意义 | 第15-16页 |
| 第二章 材料和方法 | 第16-23页 |
| 2.1 实验材料 | 第16-18页 |
| 2.1.1 研究对象的基本信息 | 第16页 |
| 2.1.2 实验仪器及设备 | 第16-17页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第17页 |
| 2.1.4 实验耗材 | 第17-18页 |
| 2.2 实验方法 | 第18-20页 |
| 2.2.1 获取用于转录组测序的组织样 | 第18页 |
| 2.2.1.1 DEPC(焦炭酸二乙酯)水的配置 | 第18页 |
| 2.2.1.2 取样前实验用具的准备 | 第18页 |
| 2.2.1.3 提取视网膜组织 | 第18页 |
| 2.2.2 转录组测序实验流程 | 第18-19页 |
| 2.2.3 转录组测序生物信息分析流程 | 第19-20页 |
| 2.2.3.1 转录组测序产量统计 | 第19页 |
| 2.2.3.2 基因功能注释 | 第19-20页 |
| 2.3 数据处理与分析 | 第20-23页 |
| 2.3.1 视觉基因的获取 | 第20页 |
| 2.3.2 视觉基因的序列处理 | 第20页 |
| 2.3.3 系统发育关系分析 | 第20页 |
| 2.3.4 正选择压力分析 | 第20-23页 |
| 第三章 结果与分析 | 第23-48页 |
| 3.1 Rh1基因系统发育分析 | 第23-26页 |
| 3.2 Rh1基因选择压力分析 | 第26-28页 |
| 3.2.1 Rh1基因数据的采集 | 第26页 |
| 3.2.2 Rh1基因正选择分析结果 | 第26-28页 |
| 3.2.2.1 枝模型结果分析 | 第26-27页 |
| 3.2.2.2 枝位点模型结果分析 | 第27页 |
| 3.2.2.3 Clade Model C模型结果分析 | 第27-28页 |
| 3.3 Sws2基因系统发育分析 | 第28-31页 |
| 3.4 Sws2基因选择压力分析 | 第31-33页 |
| 3.4.1 枝模型结果分析 | 第31-32页 |
| 3.4.2 枝位点模型结果分析 | 第32-33页 |
| 3.4.3 Clade Model C模型结果分析 | 第33页 |
| 3.5 Rh2基因系统发育分析 | 第33-36页 |
| 3.6 Rh2基因选择压力分析 | 第36-38页 |
| 3.6.1 枝模型结果分析 | 第36-37页 |
| 3.6.2 枝位点模型结果分析 | 第37-38页 |
| 3.6.3 Clade Model C模型结果分析 | 第38页 |
| 3.7 Lws基因系统发育分析 | 第38-41页 |
| 3.8 Lws基因选择压力分析 | 第41-43页 |
| 3.8.1 枝模型结果分析 | 第41-42页 |
| 3.8.2 枝位点模型结果分析 | 第42-43页 |
| 3.8.3 Clade Model C模型结果分析 | 第43页 |
| 3.9 其它视觉基因正选择压力分析结果 | 第43-48页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第48-50页 |
| 4.1 讨论 | 第48-49页 |
| 4.1.1 鸮形目暗视觉 | 第48页 |
| 4.1.2 鸮形目鸟类彩色视觉 | 第48-49页 |
| 4.1.3 ABCA4与PCDH15基因对鸮视觉的影响 | 第49页 |
| 4.2 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
