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中华雏蝗雌雄虫的比较转录组和miRNA研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第1章 绪论第10-20页
    1.1 转录组简介第10-14页
        1.1.1 转录组概述第10页
        1.1.2 转录组研究方法第10-11页
        1.1.3 转录组生物信息学分析第11-14页
    1.2 miRNA简介第14-18页
        1.2.1 miRNA概述第14页
        1.2.2 miRNA的产生及作用机制第14-16页
        1.2.3 miRNA的研究方法第16-18页
    1.3 雏蝗研究简介第18页
    1.4 本研究的目的和意义第18-20页
第2章 中华雏蝗的转录组分析第20-38页
    2.1 样本采集第20页
    2.2 实验方法第20-25页
        2.2.1 总RNA的提取第20-21页
        2.2.2 总RNA样品质量检测第21-22页
        2.2.3 转录组文库构建及测序第22页
        2.2.4 数据处理第22页
        2.2.5 All-Unigene的功能注释及COG分类第22-23页
        2.2.6 中华雏蝗雌雄两个样本的基因差异表达分析第23页
        2.2.7 实时荧光定量PCR法验证测序结果第23-25页
    2.3 实验结果第25-35页
        2.3.1 总RNA样品质量检测第25-26页
        2.3.2 原始数据统计第26页
        2.3.3 数据组装第26-28页
        2.3.4 All-Unigene的功能注释及COG分类第28-30页
        2.3.5 中华雏蝗两个样本差异表达基因的鉴别第30页
        2.3.6 差异表达基因的GO功能分析及KEGG代谢通路分析第30-34页
        2.3.7 部分生殖相关基因的qRT-PCR验证第34-35页
    2.4 讨论第35-38页
第3章 中华雏蝗的小RNA分析第38-48页
    3.1 实验方法第38-40页
        3.1.1 sRNA文库构建及测序第38-39页
        3.1.2 生物信息学分析第39-40页
    3.2 实验结果第40-46页
        3.2.1 测序数据质量及长度分布第40-42页
        3.2.2 与参考基因组比对及分类注释第42页
        3.2.3 与已知miRNA比对第42-43页
        3.2.4 两样本间已知miRNA的差异表达分析第43-45页
        3.2.5 新miRNA分析第45-46页
    3.3 讨论第46-48页
第4章 miRNA与转录组联合分析第48-56页
    4.1 实验方法第48页
        4.1.1 差异表达的已知miRNA靶基因预测及分析第48页
        4.1.2 miRNA-mRNA调控关系分析第48页
    4.2 实验结果第48-52页
    4.3 讨论第52-56页
第5章 结论第56-60页
参考文献第60-68页
致谢第68-70页
攻读硕士学位期间研究成果第70页

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