| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 模型符号说明 | 第10-11页 |
| 英文缩略词 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| ·植物数量性状遗传体系 | 第12-17页 |
| ·植物数量性状遗传体系的认识 | 第12-13页 |
| ·植物数量性状主基因+多基因混合遗传模型的研究进展 | 第13-16页 |
| ·数量性状分离分析的基本思路 | 第16-17页 |
| ·植物数量性状分离分析软件研究进展 | 第17页 |
| ·QTL定位的原理与方法 | 第17-19页 |
| ·区间作图法 | 第17-18页 |
| ·多区间作图法 | 第18-19页 |
| ·印记数量性状基因座定位 | 第19-22页 |
| ·印记数量性状基因座的概念 | 第19-20页 |
| ·印记数量性状基因座的研究进展 | 第20-22页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第22-24页 |
| 第二章 分离分析Windows软件包的原理与方法 | 第24-32页 |
| ·数量性状分离分析原理与方法 | 第24-29页 |
| ·基本理论概念 | 第24页 |
| ·样本似然函数 | 第24-25页 |
| ·AIC(Akaike's information criterion)准则 | 第25页 |
| ·适合性检验 | 第25-26页 |
| ·极大似然估计 | 第26-27页 |
| ·混合模型中参数极大似然估计的EM算法 | 第27-28页 |
| ·分离世代个体与家系的后验概率计算 | 第28-29页 |
| ·编程语言与环境 | 第29-32页 |
| ·NET Framework系统平台 | 第29页 |
| ·C++编程语言 | 第29-32页 |
| 第三章 数量性状分离分析Windows软件包的改进 | 第32-42页 |
| ·界面设计 | 第32页 |
| ·功能模块 | 第32-34页 |
| ·模型选择的功能模块 | 第32-33页 |
| ·遗传参数计算的功能模块 | 第33页 |
| ·分离群体个体或家系主基因型的后验概率 | 第33-34页 |
| ·结果的输出格式 | 第34页 |
| ·程序算法 | 第34-42页 |
| ·算法包Clapack V3.1.1 | 第34-37页 |
| ·函数库Boost V1.51.0 | 第37-42页 |
| 第四章 分离分析Windows软件研发分析与系统设计 | 第42-52页 |
| ·软件研发分析 | 第42-43页 |
| ·原有课题组研究基础 | 第42页 |
| ·软件研发环境 | 第42-43页 |
| ·软件系统设计 | 第43-52页 |
| ·设计目标 | 第43页 |
| ·运算框图 | 第43页 |
| ·极大似然估计框图 | 第43页 |
| ·核心技术 | 第43-44页 |
| ·使用系统要求 | 第44-45页 |
| ·数据文件格式 | 第45-46页 |
| ·软件功能 | 第46页 |
| ·软件界面设计 | 第46-49页 |
| ·软件系统类图 | 第49-52页 |
| 第五章 分离分析Windows软件包功能介绍与模拟研究 | 第52-68页 |
| ·软件的界面与功能 | 第52-62页 |
| ·单世代分离分析软件功能 | 第52-56页 |
| ·多世代分离分析软件功能 | 第56-58页 |
| ·分离世代个体后验概率分析软件(GClasser)功能 | 第58-62页 |
| ·Monte Carlo模拟研究 | 第62-68页 |
| ·DH单世代分离分析(SEA-DH) | 第62-63页 |
| ·B_1和B_2世代分离分析(SEA-BC) | 第63-64页 |
| ·P_1、P_2和DH三世代联合分离分析(SEA-G3DH) | 第64页 |
| ·P_1、P_2、F_1、B_1和B_2五世代联合分离分析(SEA-G5BC) | 第64-65页 |
| ·P_1、P_2、F_1、B_1、B_2和F_2六世代联合分离分析(SEA-G6) | 第65-66页 |
| ·P_1、P_2、F_1、B_(1:2)、B_(2:2)和F_(2:3)六家系世代联合分离分析(SEA-G6F) | 第66-68页 |
| 第六章 印记QTL检测与Monte Carlo模拟研究 | 第68-74页 |
| ·印记QTL的检测 | 第68-70页 |
| ·印记QTL的区间作图 | 第68-69页 |
| ·印记QTL的多区间作图 | 第69-70页 |
| ·Monte Carlo模拟研究 | 第70-74页 |
| ·遗传率和样本容量大小对印记QTL区间作图的影响 | 第70-71页 |
| ·遗传率和样本容量大小对印记QTL多区间作图的影响 | 第71-72页 |
| ·全基因组中印记QTL的多区间作图 | 第72-74页 |
| 第七章 讨论 | 第74-78页 |
| ·关于数量性状遗传体系分离分析法和QTL定位分析法的比较 | 第74-75页 |
| ·关于软件的编译环境 | 第75页 |
| ·关于软件使用的注意事项 | 第75-76页 |
| ·数据导入 | 第76页 |
| ·数据质量 | 第76页 |
| ·结果分析 | 第76页 |
| ·关于印记QTL的多区间作图检测 | 第76-78页 |
| 全文结论与创新点 | 第78-80页 |
| 全文结论 | 第78页 |
| 创新点 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-88页 |
| 致谢 | 第88-90页 |
| 硕士期间已发表和待发表的相关论文 | 第90页 |
