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巨大芽孢杆菌丙氨酸脱氢酶的复合物结构研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
1 前言第8-18页
   ·丙氨酸脱氢酶的来源第8-9页
   ·丙氨酸脱氢酶的功能第9页
   ·丙氨酸脱氢酶空间结构的研究第9-12页
     ·空间结构第9-10页
     ·丙酮酸的结合位点第10-11页
     ·NAD~+的结合位点第11-12页
   ·丙氨酸脱氢酶的催化机理第12-13页
     ·正反应-氧化脱氨第12页
     ·逆反应-氨化生成氨基酸第12-13页
   ·蛋白质晶体的研究第13-16页
     ·蛋白质结晶方法的研究进展第13页
     ·提高蛋白质结晶筛选成功率的方法第13-15页
     ·蛋白质构象的方法研究第15-16页
   ·丙氨酸脱氢酶研究的现状及意义第16-18页
2 材料与方法第18-34页
   ·实验材料第18-21页
     ·基因、菌株和载体第18页
     ·实验仪器第18-19页
     ·实验试剂第19页
     ·常用的培养基和缓冲液第19-21页
   ·实验方法第21-34页
     ·丙氨酸脱氢酶(Ald)重组质粒的构建第21-24页
     ·丙氨酸脱氢酶(Ald)的表达纯化及酶活性测定第24-27页
     ·丙氨酸脱氢酶(Ald)单晶的结晶条件筛选及优化第27-30页
     ·Ald和NAD~+二元共晶的结晶条件筛选及优化第30-31页
     ·Ald、NAD~+和丙酮酸三元共晶的结晶条件筛选及优化第31-32页
     ·Ald、NAD~+、NADH和丙酮酸四元共晶的结晶条件筛选及优化第32-33页
     ·丙氨酸脱氢酶(Ald)的晶体结构解析第33-34页
3 结果与讨论第34-57页
   ·丙氨酸脱氢酶(Ald)重组质粒构建结果第34-35页
     ·重组质粒构建的结果第34页
     ·重组质粒鉴定的结果第34-35页
   ·丙氨酸脱氢酶(Ald)的表达纯化及酶活性测定结果第35-39页
     ·Ald试表达和可溶性检测结果第35-37页
     ·Ald初步分离及纯化结果第37-38页
     ·Ald阴离子交换层析结果第38-39页
     ·Ald活性测定结果第39页
   ·丙氨酸脱氢酶(Ald)单晶的结晶条件筛选及优化结果第39-41页
     ·Ald单晶的结晶条件初步筛选第39-40页
     ·Ald单晶的结晶条件优化第40-41页
   ·丙氨酸脱氢酶(Ald)单晶的数据收集和处理及结构解析第41-44页
     ·Ald单晶的数据收集及处理第41-43页
     ·Ald单晶的结构解析第43-44页
   ·Ald和NAD~+二元共晶的结晶条件筛选及优化结果第44-46页
     ·二元共晶的结晶条件初步筛选第44-45页
     ·二元共晶的结晶条件优化第45-46页
   ·Ald和NAD~+二元共晶的晶体数据收集和处理及结构解析第46-50页
     ·Ald和NAD~+二元结晶的晶体数据收集及处理第46-47页
     ·Ald和NAD~+二元结晶的结构解析第47-50页
   ·Ald、NAD~+和丙酮酸三元共晶的结晶条件筛选及优化结果第50-52页
     ·三元共晶的结晶条件初步筛选第50-51页
     ·三元共晶的结晶条件优化第51-52页
   ·Ald、NAD~+和丙酮酸三元共晶的晶体数据收集及处理第52-53页
   ·Ald、NAD~+、丙酮酸和NADH四元共晶的结晶条件筛选及优化结果第53-54页
     ·四元共晶的结晶条件初步筛选第53页
     ·四元共晶的结晶条件优化第53-54页
   ·不同来源的丙氨酸脱氢酶(Ald)比较第54-57页
4 结论第57-58页
5 展望第58-59页
6 参考文献第59-65页
7 攻读学位期间发表的文章第65-66页
8 致谢第66-67页
附录第67页

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