| 符号说明 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-16页 |
| 第一部分 文献综述 | 第16-50页 |
| 第一章 水稻抗纹枯病接种鉴定方法(体系)的研究进展 | 第16-31页 |
| ·纹枯病病原菌发现、分类及其为害 | 第16-20页 |
| ·纹枯病病原菌的发现、分类 | 第16页 |
| ·纹枯病病原菌在水稻上的为害特点 | 第16-18页 |
| ·纹枯病病原菌致病机理 | 第18-20页 |
| 1)胞壁降解酶的致病机理 | 第18-19页 |
| 2)毒素的致病机理 | 第19-20页 |
| ·纹枯病近年来在我国发生危害不断加重的原因 | 第20页 |
| ·水稻纹枯病的接种鉴定体系(方法)研究 | 第20-25页 |
| ·田间条件下接种鉴定方法 | 第21-23页 |
| ·受控条件下接种鉴定方法 | 第23-25页 |
| ·离体接种鉴定方法 | 第25页 |
| ·参考文献 | 第25-31页 |
| 第二章 水稻对纹枯病的抗性遗传及其QTL定位研究进展 | 第31-50页 |
| ·采用经典遗传学的水稻纹枯病抗性遗传研究 | 第31-32页 |
| ·基于分子标记的水稻抗纹枯病QTL定位研究 | 第32-46页 |
| ·分子标记的兴起及其类型 | 第32页 |
| ·分子标记定位QTL的原理及方法 | 第32-34页 |
| ·基于分子标记的水稻抗纹枯病QTL的定位的发展历程 | 第34-39页 |
| ·水稻纹枯病抗性QTL定位的验证以及成功实例 | 第39-40页 |
| ·不同研究者有关水稻纹枯病抗性QTL的汇总 | 第40页 |
| ·不同染色体上水稻纹枯病抗性QTL的整合 | 第40页 |
| ·水稻纹枯病抗性QTL的精细定位研究进展 | 第40-46页 |
| ·参考文献 | 第46-50页 |
| 第二部分 研究报告 | 第50-122页 |
| 第三章 水稻纹枯病接种鉴定体系的新探索 | 第50-82页 |
| (一) 水稻苗期接种鉴定体系的建立 | 第50-61页 |
| ·材料与方法 | 第50-53页 |
| ·试验材料 | 第50页 |
| ·试验设计 | 第50-52页 |
| ·大田成株期验证试验 | 第52-53页 |
| ·结果与分析 | 第53-56页 |
| ·纹枯病菌入侵和发病最适宜相对湿度 | 第53页 |
| ·水稻苗期对纹枯病抗性的鉴定 | 第53-54页 |
| ·不同苗龄的稻苗接种后病情发展的差异 | 第54-55页 |
| ·大田成株期接种验证试验 | 第55-56页 |
| ·小结与讨论 | 第56-60页 |
| ·建立水稻抗纹枯病苗期快速鉴定技术体系的意义 | 第56-57页 |
| ·关于水稻纹枯病苗期接种鉴定技术的局限性 | 第57-58页 |
| ·对水稻纹枯病苗期接种鉴定主要技术环节的认识 | 第58-60页 |
| ·参考文献 | 第60-61页 |
| (二) 水稻成株期接种鉴定方法的发展 | 第61-70页 |
| ·材料与方法 | 第61-63页 |
| ·试验材料 | 第61-62页 |
| ·试验设计 | 第62页 |
| ·统计分析 | 第62-63页 |
| ·结果与分析 | 第63-66页 |
| ·分蘖末期不同水稻品种对纹枯病的抗性表现 | 第63-64页 |
| ·小孕穗期不同水稻品种对纹枯病抗性的表现 | 第64-66页 |
| ·抽穗后30 d不同水稻品种对纹枯病的抗性表现 | 第66页 |
| ·小结与讨论 | 第66-68页 |
| ·以病斑长度为调查指标的适用范围 | 第67-68页 |
| ·田间2种不同成株期(小孕穗期、分蘖末期)接种的小区抽穗后30 d结果比校 | 第68页 |
| ·参考文献 | 第68-70页 |
| (三) 水稻抽穗后30 d病级调查标准的探索 | 第70-82页 |
| ·材料与方法 | 第71-72页 |
| ·试验材料 | 第71页 |
| ·试验设计和方法 | 第71-72页 |
| ·统计分析 | 第72页 |
| ·结果与分析 | 第72-77页 |
| ·Rush调查标准与叶鞘位调查标准的差异分析 | 第72页 |
| ·Rush调查标准及叶鞘位调查标准的相关性分析 | 第72-74页 |
| ·相对病级调查标准区分品种抗性差异的能力 | 第74-75页 |
| ·相对病级调查标准区分品种抗性差异的合理性 | 第75-77页 |
| ·小结与讨论 | 第77-79页 |
| ·叶鞘位调查标准是一个相对客观且高效的指标 | 第77-78页 |
| ·小孕穗期接种需要采取合适的调查标准,其适用范围目前有限 | 第78-79页 |
| ·参考文献 | 第79-82页 |
| 第四章 水稻抗病新种质YSBR1的纹枯病抗性QTL定位 | 第82-102页 |
| ·材料与方法 | 第82-84页 |
| ·植物材料 | 第82-83页 |
| ·田间设计 | 第83页 |
| ·纹枯病接种和病级调查 | 第83页 |
| ·农艺性状调查 | 第83-84页 |
| ·分子标记的发展 | 第84页 |
| ·数据分析 | 第84页 |
| ·结果与分析 | 第84-96页 |
| ·亲本及F_2CP群体纹枯病抗性表现 | 第84-85页 |
| ·亲本及F_2CP群体农艺性状表现 | 第85页 |
| ·连锁图谱的构建 | 第85页 |
| ·F_2CP抗纹枯病QTL定位 | 第85-90页 |
| ·农艺性状QTL定位 | 第90-94页 |
| ·水稻纹枯病病级与农艺性状间的表型相关分析及QTL区间比较 | 第94-96页 |
| ·小结与讨论 | 第96-100页 |
| ·抗纹枯病QTL定位结果与前人比较 | 第96-97页 |
| ·抗性基因与农艺性状基因的关系 | 第97页 |
| ·不同隔离行对纹枯病发病的影响 | 第97-98页 |
| ·关于大效应QTL的检测和进一步研究工作 | 第98-99页 |
| ·YSBR1中抗纹枯病QTL的育种利用 | 第99-100页 |
| ·参考文献 | 第100-102页 |
| 第五章 水稻抗病新种质YSBRl的基因芯片表达分析及其与QTL定位结果的整合 | 第102-122页 |
| ·材料与方法 | 第102-105页 |
| ·水稻材料 | 第102页 |
| ·试验方法 | 第102-105页 |
| 1)水稻材料的栽培管理、选择 | 第102-103页 |
| 2)纹枯病病原菌菌株的培养 | 第103页 |
| 3)试验设计 | 第103-104页 |
| 4)水稻组织材料的采集处理 | 第104页 |
| 5)组织材料的总RNA的提取和纯化 | 第104页 |
| 6)芯片杂交数据的获取和数据分析方法 | 第104-105页 |
| 7)芯片杂交结果的生物信息学分析方法 | 第105页 |
| ·数据分析软件及生物信息学注释工具 | 第105页 |
| ·结果与分析 | 第105-117页 |
| ·抗感材料在接种后短期内的病情差异分析 | 第105-106页 |
| ·接种后10h样品的侵染垫观察 | 第106-108页 |
| ·芯片试验质量分析 | 第108-110页 |
| 1)不同生物学重复间的相关系数 | 第108页 |
| 2)差异表达基因的聚类分析 | 第108-110页 |
| ·水稻全基因组差异表达的基因数 | 第110-112页 |
| 1)差异表达基因的筛选 | 第110-111页 |
| 2)部分差异基因的Quantitative PCR验证 | 第111页 |
| 3)差异表达基因在品种间的相似性及YSBR1中特异差异表达基因 | 第111-112页 |
| 4)特异差异表达基因的pathway和GO功能分析 | 第112页 |
| ·YSBR1中特异差异表达基因的染色体分布及主效QTL定位区间整合 | 第112-117页 |
| 1)YSBR1中的特异差异表达基因在水稻染色体分布 | 第112-114页 |
| 2)落入YSBR1中已检测到的QTL区间的差异基因数 | 第114-115页 |
| 3)主效QTL(qSB-2~Y)初步定位区间的特异差异表达基因 | 第115页 |
| 4)主效QTL(qSB-12~Y)初步定位区间的特异差异表达基因 | 第115-117页 |
| ·小结与讨论 | 第117-119页 |
| ·基因芯片的可靠性取决于样品的一致性 | 第117页 |
| ·差异表达基因筛选标准放宽的比较和影响 | 第117-118页 |
| ·如何尽快确认已定位的主效QTL的可能候选基因 | 第118-119页 |
| ·参考文献 | 第119-122页 |
| 附录 | 第122-123页 |
| 致谢 | 第123-124页 |
| 博士研究生期间发表文章 | 第124-125页 |
