| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 1 前言 | 第10-23页 |
| ·番茄黄化曲叶病毒病研究进展 | 第10-14页 |
| ·寄主范围、症状和分布 | 第10-11页 |
| ·分子生物学特性 | 第11-12页 |
| ·TYLCV检测技术 | 第12-14页 |
| ·生物学方法 | 第12页 |
| ·血清学方法 | 第12-13页 |
| ·分子生物学方法 | 第13-14页 |
| ·植物免疫研究现状 | 第14-17页 |
| ·病原相关分子模式触发的免疫（PAMP-triggeredimmunity，PTI） | 第15-16页 |
| ·效应因子触发的免疫反应（ETI） | 第16-17页 |
| ·miRNA研究进展 | 第17-20页 |
| ·植物miRNA来源和生物合成 | 第17-18页 |
| ·miRNA作用机制 | 第18页 |
| ·miRNA植物生长发育的关系 | 第18-19页 |
| ·miRNA对根的影响 | 第19页 |
| ·miRNA对花发育的影响 | 第19页 |
| ·miRNA对植物形态建成的影响 | 第19页 |
| ·miRNA发现与验证 | 第19-20页 |
| ·miRNA与植物免疫 | 第20-21页 |
| ·miRNA与PTI | 第20页 |
| ·miRNA与ETI | 第20-21页 |
| ·病毒侵染与寄主miRNA | 第21页 |
| ·研究目的和意义 | 第21-23页 |
| 2 番茄黄化曲叶病毒病应答小分子RNA深度测序和生物学分析 | 第23-39页 |
| ·试验材料 | 第23页 |
| ·试验方法 | 第23-29页 |
| ·番茄幼苗的培育 | 第23页 |
| ·侵染性农杆菌的培养及接种 | 第23页 |
| ·TY病毒的RT-PCR检测 | 第23-25页 |
| ·总RNA的提取 | 第23-24页 |
| ·RT-PCR检测 | 第24-25页 |
| ·番茄叶片内TY相关基因引物设计 | 第25页 |
| ·小RNA测序流程 | 第25-26页 |
| ·测序结果的生物信息学分析 | 第26-29页 |
| ·小RNA数据处理 | 第27-28页 |
| ·miRNA表达谱分析 | 第28-29页 |
| ·候选miRNA预测 | 第29页 |
| ·结果与分析 | 第29-37页 |
| ·深度测序植物样品的获得 | 第29-31页 |
| ·植物症状表现与TY病毒RT-PCR检测 | 第30页 |
| ·植物样品的获得以及检测 | 第30-31页 |
| ·番茄小RNA高通量测序与生物学信息学分析 | 第31-36页 |
| ·测序结果的基本生物学分析 | 第31-32页 |
| ·测序结果的高级生物学分析 | 第32-34页 |
| ·sRNA的注释 | 第34-35页 |
| ·CK和TY处理公共及特有序列统计 | 第35-36页 |
| ·miRNA比对结果 | 第36-37页 |
| ·讨论 | 第37-39页 |
| 3 番茄幼叶中响应TY侵染miRNA表达谱分析及靶基因验证 | 第39-54页 |
| ·实验材料 | 第39页 |
| ·试验方法 | 第39-42页 |
| ·miRNA的分析 | 第39-41页 |
| ·miRNA差异分析miRNA | 第39页 |
| ·miRNA靶基因预测 | 第39-40页 |
| ·GO富集分析 | 第40-41页 |
| ·KEGG通路分析 | 第41页 |
| ·miR869.2和miR0155靶基因的验证 | 第41-42页 |
| ·结果与分析 | 第42-52页 |
| ·miRNA的表达谱分析 | 第42-47页 |
| ·已知miRNA差异表达分析 | 第42-43页 |
| ·新miRNA表达差异分析 | 第43-44页 |
| ·新miRNA靶基因预测 | 第44-45页 |
| ·miRNAGo分析和KEGG代谢通路分析 | 第45-47页 |
| ·表达差异显著miRNA靶基因的分析与验证 | 第47-52页 |
| ·部分差异极显著miRNA靶基因注释 | 第47-49页 |
| ·miR869.2生物信息学分析及验证 | 第49-50页 |
| ·miR0155生物信息学分析及验证 | 第50-52页 |
| ·讨论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 附录 | 第60-66页 |
