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大肠杆菌氮代谢调节蛋白GlnG对假单胞菌固氮岛表达的调控

附件第1-6页
摘要第6-7页
Abstract第7-15页
英文缩略表第15-16页
第一章 文献综述第16-31页
   ·前言第16页
   ·固氮的遗传基础——固氮基因簇第16-17页
   ·共有固氮基因的鉴定第17-18页
   ·不同固氮菌中固氮基因簇结构与进化分析第18-23页
     ·变形菌门(Proteobacteria)微生物中的固氮基因簇第18-19页
     ·蓝细菌门(Cyanobacteria)微生物中的固氮基因簇第19-20页
     ·放线菌门(Actinobacteria)微生物中的固氮基因簇第20-21页
     ·厚壁菌门(Firmicutes)微生物中的固氮基因簇第21-22页
     ·绿弯菌门(Chloroflexi)微生物中的固氮基因簇第22页
     ·绿菌门(Chlorobi)微生物中的固氮基因簇第22-23页
     ·广古菌门(Euryarchaeota)微生物中的固氮基因簇第23页
   ·固氮基因水平转移第23-25页
   ·氮代谢调节第25-29页
     ·肠杆菌中一般氮代谢调节第26页
     ·生物固氮的调控第26-29页
   ·立题依据和技术路线第29-31页
     ·立题依据及本研究的目的意义第29-30页
     ·技术路线第30-31页
第二章 DH10B GlnG 与 A1501 NtrC 结构的生物信息学分析第31-38页
   ·材料与方法第31页
     ·数据库第31页
     ·应用软件第31页
   ·结果与讨论第31-36页
     ·DH10B GlnG 与 A1501 NtrC 进化分析第31-32页
     ·DH10B GlnG 与 A1501 NtrC 结构比较第32-35页
     ·DH10B GlnG 与 A1501 NtrC 结构域分析第35页
     ·肠杆菌 GlnG 与假单胞菌 NtrC 结合的 DNA 序列分析第35-36页
   ·讨论第36-38页
第三章 DH10B GlnG 与 A1501 NtrC 在一般氮代谢过程中的功能互补研究第38-67页
   ·材料与方法第38-54页
     ·菌株、质粒来源第38页
     ·培养基及溶液第38-40页
     ·抗生素、酶类及生化试剂第40页
     ·试剂盒第40-41页
     ·仪器设备第41页
     ·基因组及质粒 DNA 的提取第41-44页
     ·PCR 反应及产物纯化第44-46页
     ·目的片段连接 T 载体第46页
     ·目的片段的酶切及纯化第46-48页
     ·DNA 片段与目的载体的连接第48页
     ·大肠杆菌的热击转化第48-49页
     ·三亲结合实验第49-50页
     ·以硝酸钾或尿素为唯一氮源条件下的生长曲线测定第50页
     ·施氏假单胞菌固氮酶活测定第50-51页
     ·大肠杆菌 GlnG 突变株的构建第51-52页
     ·大肠杆菌的电击转化第52-53页
     ·以精氨酸为唯一氮源条件下的生长曲线测定第53-54页
   ·结果第54-64页
     ·DH10B GlnG 互补 A1501 △NtrC 功能互补株的构建第54-59页
     ·DH10B GlnG 互补 A1501 △NtrC 功能互补株的表型测定第59-61页
     ·A1501 NtrC 互补 DH10B △GlnG 功能互补株的构建第61-63页
     ·A1501 NtrC 回补 DH10B △GlnG 的功能互补株的表型测定第63-64页
   ·讨论第64-67页
第四章 DH10B GlnG 与 A1501 nifA 基因启动子区互作研究第67-102页
   ·材料与方法第67-83页
     ·菌株、质粒来源第67页
     ·培养基及溶液第67-69页
     ·抗生素、酶类及生化试剂第69-70页
     ·试剂盒第70页
     ·仪器设备第70页
     ·试剂盒法提取质粒 DNA第70-71页
     ·PCR 反应及产物纯化第71-74页
     ·目的片段连接 T 载体第74页
     ·目的片段的酶切及纯化第74-75页
     ·DNA 片段与目的载体的连接第75页
     ·大肠杆菌的热击转化第75-76页
     ·GlnG-P 蛋白的表达与纯化第76-79页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第79-80页
     ·凝胶阻滞实验第80-82页
     ·高效液相色谱法鉴定 EN-01 固氮条件下产生的有机酸第82-83页
   ·结果第83-99页
     ·通过融合 PCR 的方式实现 DH10B glnG 基因片段的定点突变第83-87页
     ·磷酸化 DH10B GlnG(GlnG-P)克隆载体的构建第87-89页
     ·磷酸化 DH10B GlnG(GlnG-P)表达载体的构建第89-92页
     ·共表达蛋白 GlnG-P-Mxe-CBD 的诱导表达第92-95页
     ·共表达蛋白 GlnG-P-Mxe-CBD 的纯化第95-96页
     ·A1501 nifA 基因启动子区可能的 GlnG 结合位点分析第96-97页
     ·凝胶阻滞实验探针的制备第97页
     ·凝胶阻滞实验分析磷酸化 GlnG 蛋白与 nifA 基因启动子区的结合第97-98页
     ·重组大肠杆菌 EN-01 固氮过程中产有机酸分析第98-99页
   ·讨论第99-102页
     ·凝胶阻滞实验分析磷酸化 GlnG 蛋白与目的基因启动子区的结合第99-100页
     ·EN-01 固氮过程中产有机酸与能量代谢之间的关系分析第100-102页
第五章 全文结论第102-103页
参考文献第103-110页
致谢第110-111页
作者简历第111页

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