| 致谢 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-25页 |
| 1 真核藻类特异性 PCR 体系及其研究进展 | 第11-22页 |
| ·真核藻类特异性 PCR 体系 | 第11页 |
| ·真核藻类分子鉴定常用基因 | 第11-20页 |
| ·真核藻类特异性 PCR 引物设计 | 第20-22页 |
| 2 沉积物真核藻类对长江口水域生态系统的意义 | 第22-23页 |
| 3 沉积物真核藻类多样性研究存在的不足 | 第23页 |
| 4 本论文的研究目标与内容 | 第23-25页 |
| 第二章 真核藻类特异性 18S rDNA 引物的设计与评估 | 第25-49页 |
| 1 前言 | 第25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-31页 |
| ·实验材料 | 第25-26页 |
| ·实验方法 | 第26-31页 |
| 3 实验结果 | 第31-44页 |
| ·Primrose 生成备选引物 | 第31-33页 |
| ·TestProbe 分析引物-模板错配位点 | 第33-41页 |
| ·引物扩增区间高变性分析 | 第41-44页 |
| 4 讨论 | 第44-49页 |
| ·真核藻类特异性引物与通用引物敏感性与特异性的比较 | 第44-47页 |
| ·高通量测序时代对引物设计的新要求 | 第47-49页 |
| 第三章 真核藻类特异性 18S rDNA 体系的优化与验证 | 第49-60页 |
| 1 前言 | 第49页 |
| 2 材料与方法 | 第49-53页 |
| ·实验材料 | 第49-50页 |
| ·实验方法 | 第50-53页 |
| 3 实验结果 | 第53-57页 |
| ·纯种验证实验结果 | 第53-56页 |
| ·沉积物验证实验结果 | 第56-57页 |
| 4 讨论 | 第57-60页 |
| ·引物-模板错配对纯种样品扩增效率的影响 | 第57-59页 |
| ·引物-模板偏好性对环境样品扩增效率的影响 | 第59-60页 |
| 第四章 真核藻类特异性 PCR 体系在长江口水域的应用 | 第60-72页 |
| 1 前言 | 第60页 |
| 2 材料与方法 | 第60-63页 |
| ·实验材料 | 第60-62页 |
| ·实验方法 | 第62-63页 |
| 3 结果与讨论 | 第63-72页 |
| ·DNA 提取结果 | 第63-64页 |
| ·沉积物克隆文库克隆与 OTU 结果 | 第64页 |
| ·沉积物真核藻类多样性分析 | 第64-66页 |
| ·各站位群落结构 | 第66-70页 |
| ·各站位 OTU 聚类分析 | 第70-72页 |
| 第五章 总结 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-84页 |
| Internet 资源 | 第84-85页 |
| 附表 | 第85-94页 |
| 作者简历 | 第94-95页 |
| 研究生期间文章撰写与发表情况 | 第95页 |
