| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第一章 Taf14 YEATS domain 的溶液结构以及在酵母细胞生长中的作用 | 第13-45页 |
| ·摘要 | 第13页 |
| ·背景介绍 | 第13-17页 |
| ·实验材料和方法 | 第17-30页 |
| ·Taf14 YEATS domain 的克隆 | 第17-20页 |
| ·Taf14 YEATS domain 的表达 | 第20-21页 |
| ·a 检测Taf14 YEATS domain 是否表达 | 第20-21页 |
| ·b 检测Taf14 YEATS domain 是否在上清中表达及纯化 | 第21页 |
| ·Taf14 YEATS domain 的透析和浓缩 | 第21-22页 |
| ·Taf14 YEATS domain 的无机培养 | 第22-23页 |
| ·Taf14，C-terminus of Taf14 和Sth1 的克隆，表达和纯化 | 第23页 |
| ·核磁共振实验和结构计算 | 第23-25页 |
| ·酵母细胞株, 质粒，培养基和基因的方法 | 第25-27页 |
| ·Taf14 YEATS domain 与组蛋白的GST-pull-down 实验 | 第27-28页 |
| ·a 酵母组蛋白的提取 | 第27-28页 |
| ·b GST-pull-down 和western 实验 | 第28页 |
| ·SPR(表面等离子共振)实验 | 第28-30页 |
| ·实验结果 | 第30-40页 |
| ·Taf14 和Taf14 YEATS domain 的氨基酸序列分析 | 第30页 |
| ·Taf14 YEATS domain 的溶液结构 | 第30-33页 |
| ·Taf14 YEATS domain 结构的特点 | 第33-34页 |
| ·Taf14 YEATS domain 的动力学分析 | 第34-36页 |
| ·Taf14 和Yaf9 YEATS domains 的结构比较 | 第36-37页 |
| ·Taf14 YEATS domain 对酵母细胞生长的作用 | 第37-38页 |
| ·C-terminus of Taf14 负责Taf14 与Sth1 的相互作用 | 第38-40页 |
| ·讨论 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 第二章 酵母细胞中 Rap1 BRCT domain 的溶液结构 | 第45-67页 |
| ·摘要 | 第45页 |
| ·背景介绍 | 第45-50页 |
| ·实验材料和方法 | 第50-58页 |
| ·Rap1 BRCT domain 的克隆 | 第50-53页 |
| ·Rap1 BRCT domain 的表达 | 第53-54页 |
| ·a 检测Rap1 BRCT domain 是否表达 | 第53-54页 |
| ·b 检测Rap1 BRCT domain 是否在上清中表达及纯化 | 第54页 |
| ·Rap1 BRCT domain 的透析和浓缩 | 第54-55页 |
| ·Rap1 BRCT domain 的无机培养 | 第55-56页 |
| ·核磁共振实验和结构计算 | 第56-57页 |
| ·EMSA 实验 | 第57-58页 |
| ·实验结果 | 第58-63页 |
| ·BRCT domain家族成员的氨基酸序列分析 | 第58页 |
| ·Rap1 BRCT domain的溶液结构 | 第58-61页 |
| ·Rap1 BRCT domain和其它BRCT domain的结构比较 | 第61-63页 |
| ·讨论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-67页 |
| 第三章 锥体虫 Urm1蛋白的溶液结构 | 第67-85页 |
| ·摘要 | 第67页 |
| ·背景介绍 | 第67-71页 |
| ·实验材料和方法 | 第71-79页 |
| ·TbUrm1 的克隆 | 第71-74页 |
| ·TbUrm1 的表达 | 第74-75页 |
| ·a 检测TbUrm1 是否表达 | 第74-75页 |
| ·b 检测TbUrm1 是否在上清中表达及纯化 | 第75页 |
| ·TbUrm1 的透析和浓缩 | 第75-76页 |
| ·TbUrm1 的无机培养 | 第76-77页 |
| ·核磁共振实验和结构计算 | 第77-79页 |
| ·实验结果 | 第79-83页 |
| ·锥体虫细胞基因组中Urm1 蛋白的辨认 | 第79页 |
| ·TbUrm1 的溶液结构 | 第79-81页 |
| ·TbUrm1 和其它泛素家族成员的结构比较 | 第81-83页 |
| ·讨论 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-85页 |
| 第四章 古细菌中的泛素类似蛋白 SAMP1和SAMP2拥有两种构象以及在蛋白降解中的作用 | 第85-105页 |
| ·摘要 | 第85页 |
| ·背景介绍 | 第85-89页 |
| ·实验材料和方法 | 第89-94页 |
| ·SAMP1 和SAMP2 的克隆 | 第89-91页 |
| ·SAMP1 和SAMP2 的表达和纯化 | 第91-92页 |
| ·SAMP1 和SAMP2 的透析和浓缩 | 第92页 |
| ·SAMP1 和SAMP2 的无机培养 | 第92-93页 |
| ·SAMP1 和SAMP2 NMR 实验和结构计算 | 第93-94页 |
| ·实验结果 | 第94-103页 |
| ·低盐条件下SAMP1 和SAMP2 均拥有两种构象 | 第94-95页 |
| ·SAMP1 和SAMP2 均拥有一个类似其它泛素家族成员的构象 | 第95-98页 |
| ·SAMP1 和SAMP2 均拥有一种无规构象 | 第98-100页 |
| ·SAMP2 在高盐条件下的溶液结构 | 第100-103页 |
| ·讨论 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-105页 |
| 第五章 Pdp1 PWWP domain 的溶液结构以及与H4K20me3 和 DNA的结合 | 第105-129页 |
| ·摘要 | 第105页 |
| ·背景介绍 | 第105-110页 |
| ·实验材料和方法 | 第110-117页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 的克隆 | 第110-111页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 的表达 | 第111-112页 |
| ·a 检测Pdp1 PWWP domain 是否表达 | 第111页 |
| ·b 检测Pdp1 PWWP domain 是否在上清中表达及纯化 | 第111-112页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 的透析和浓缩 | 第112页 |
| ·定点突变实验 | 第112页 |
| ·核磁共振实验和结构计算 | 第112-113页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 弛豫实验 | 第113页 |
| ·酵母细胞株，质粒，培养基和基因方法 | 第113-116页 |
| ·Western blot 实验和相关抗体 | 第116-117页 |
| ·实验结果 | 第117-124页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 的序列分析 | 第117页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 的溶液结构和动力学分析 | 第117-119页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 与其它PWWP domains 的结构比较 | 第119-120页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 通过芳香族氨基酸结合H4K20me3 | 第120-121页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 结合非特异性的DNA | 第121-122页 |
| ·Pdp1 PWWP domain 与DNA 结合对H4K20 的甲基化是必须的 | 第122-124页 |
| ·讨论 | 第124-125页 |
| 参考文献 | 第125-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 博士期间发表的论文 | 第130-131页 |
