| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一部分 肺炎链球菌HtrA蛋白PDZ结构域的溶液结构及其功能研究 | 第11-83页 |
| 第一章 研究背景介绍 | 第11-41页 |
| ·HtrA 蛋白酶 | 第11-21页 |
| ·蛋白质质量控制 | 第11-13页 |
| ·HtrA 蛋白酶的功能 | 第13-19页 |
| ·HtrA 蛋白酶的结构 | 第19-21页 |
| ·PDZ 结构域 | 第21-34页 |
| ·蛋白质-蛋白质相互作用的结构基础 | 第21-23页 |
| ·PDZ 结构域与底物的结合 | 第23-27页 |
| ·PDZ 结构域识别底物的结构基础 | 第27-29页 |
| ·PDZ 蛋白的功能 | 第29-34页 |
| ·HtrA 蛋白的 PDZ 结构域 | 第34-39页 |
| ·HtrA 蛋白酶的激活机制 | 第34-36页 |
| ·HtrA 蛋白酶的PDZ 结构域 | 第36-39页 |
| ·肺炎链球菌中的 HtrA 蛋白 | 第39-41页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第41-58页 |
| ·肺炎链球菌 HtrA 蛋白 PDZ 结构域基因的克隆 | 第41-45页 |
| ·肺炎链球菌HtrA 蛋白PDZ 结构域基因的引物设计及PCR 扩增 | 第41-42页 |
| ·肺炎链球菌HtrA 蛋白PDZ 结构域表达质粒的构建 | 第42-44页 |
| ·肺炎链球菌HtrA PDZ 结构域点突变表达质粒的构建 | 第44-45页 |
| ·肺炎链球菌 HtrA PDZ 结构域蛋白的表达和纯化 | 第45-47页 |
| ·肺炎链球菌HtrA PDZ 结构域蛋白的表达 | 第45页 |
| ·肺炎链球菌HtrA PDZ 结构域蛋白的纯化 | 第45-46页 |
| ·蛋白分子量的测定 | 第46页 |
| ·蛋白浓度的测定 | 第46-47页 |
| ·蛋白透析，浓缩和保存 | 第47页 |
| ·蛋白质稳定性测验 | 第47页 |
| ·小肽的合成与纯化 | 第47-48页 |
| ·表面等离子共振（surface plasmon resonance，SPR） | 第48-49页 |
| ·核磁共振波谱（NMR）结构测定 | 第49-57页 |
| ·15N 单标记和15N,13C 双标记蛋白质样品的制备 | 第49-50页 |
| ·NMR 实验和数据变换 | 第50-51页 |
| ·谱峰的认证 | 第51-54页 |
| ·二级结构预测 | 第54-55页 |
| ·三维溶液结构的计算 | 第55-57页 |
| ·NMR 化学位移扰动实验 | 第57-58页 |
| 第三章 实验结果与讨论 | 第58-71页 |
| ·序列比对 | 第58页 |
| ·肺炎链球菌 HtrA PDZ 结构域的溶液结构解析 | 第58-65页 |
| ·肺炎链球菌HtrA PDZ 结构域的化学位移的认证 | 第58-60页 |
| ·二级结构预测 | 第60-61页 |
| ·肺炎链球菌HtrA PDZ 结构域的三维溶液结构 | 第61-64页 |
| ·与经典PDZ 结构域以及同源HtrA 蛋白PDZ 结构域的结构比较 | 第64-65页 |
| ·肺炎链球菌 HtrA PDZ 结构域与小肽配体的结合 | 第65-66页 |
| ·肺炎链球菌 HtrA PDZ 结构域通过β1 和α3 形成的沟与小肽结合 | 第66-68页 |
| ·肺炎链球菌 HtrA PDZ 结构域部分残基点突变对结合的影响 | 第68-70页 |
| ·总结 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-83页 |
| 第二部分 古细菌 Haloferax volcanii 中 SAMPs 蛋白的溶液结构与功能研究 | 第83-116页 |
| 第四章 Ubiquitin 系统背景介绍 | 第83-94页 |
| ·蛋白质的翻译后修饰 | 第83-85页 |
| ·真核生物中的Ubiquitin 系统 | 第85-88页 |
| ·细菌中的Ubiquitin-like 蛋白 | 第88-90页 |
| ·古细菌Haloferax volcanii 中的SAMPs 蛋白 | 第90-94页 |
| ·古细菌 | 第90-92页 |
| ·SAMPs 蛋白 | 第92-94页 |
| 第五章 实验方法与步骤 | 第94-96页 |
| ·Haloferax volcanii SAMPs 和PanA,PanB 全基因的合成 | 第94页 |
| ·质粒的构建和重组蛋白的表达与纯化 | 第94-95页 |
| ·核磁共振波谱（NMR）实验 | 第95页 |
| ·NMR 化学位移扰动实验 | 第95-96页 |
| 第六章 实验结果与讨论 | 第96-112页 |
| ·在低盐环境下，SAMP1 与SAMP2 均具有两套构象 | 第96-100页 |
| ·在低盐环境下，SAMPs 与PanA 及PanB 的相互作用 | 第100-103页 |
| ·在高盐环境下，SAMP1 与SAMP2 只保留有序的一套构象 | 第103-107页 |
| ·在高盐环境下，SAMPs 与PanA 及PanB 的相互作用 | 第107-110页 |
| ·分析与讨论 | 第110-112页 |
| 参考文献 | 第112-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第117-118页 |
