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家蚕细胞中RISC复合物结合小RNA的分离、鉴定与分析

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
缩略词第9-12页
第一章 绪论第12-17页
 1 RISC 复合物的研究现状第12-13页
   ·RISC 复合物第12页
   ·Dicer 酶第12页
   ·AGO 蛋白家族第12-13页
 2 小 RNA 的研究进展第13-16页
   ·miRNA第14页
   ·siRNA第14-15页
   ·piRNA第15页
   ·tRFs(tRNA-derived fragments)第15页
   ·其他小 RNA第15-16页
 3 展望第16-17页
第二章 实验设计方案第17-19页
 1 实验目的和意义第17页
 2 实验内容第17-18页
 3 实验流程图第18-19页
第三章 ie1-bacmid 表达系统的构建第19-31页
 1 材料与试剂及仪器设备第19页
 2 方法第19-27页
   ·重组载体 pIEx-1-BmAGO2 的构建第19-22页
   ·重组载体 pFastBacHTb-pIEx-1-EGFP/BmAGO2 的构建第22-25页
   ·重组表达病毒载体 ie1-bacmid-EGFP/BmAGO2 的构建第25-27页
 3 结果第27-30页
   ·重组病毒载体 ie1-bacmid-EGFP/BmAGO2 构建流程图第27页
   ·重组载体 pIEx-1-BmAGO2 的鉴定第27-28页
   ·重组转移载体 pFastBacHTb-pIEx-1-EGFP/BmAGO2 的鉴定第28-29页
   ·重组病毒基因组 ie1-bacmid-EGFP/BmAGO2 的 PCR 鉴定第29-30页
 4 讨论第30-31页
第四章 EGFP 和 BmAGO2 蛋白在 ie1-bacmid 表达系统中的表达分析第31-43页
 1 材料与试剂及设备仪器第31-33页
 2 方法第33-36页
   ·家蚕 BmN 细胞的培养、冻存与复苏第33-34页
   ·转染试剂介导的 ie1-bacmid-EGFP/BmAGO2 基因组 DNA 的转染第34-35页
   ·病毒的培养第35页
   ·病毒滴度测定(终点稀释法)第35页
   ·Bradford 法测定蛋白浓度第35-36页
   ·Western blotting 检测 EGFP 和 BmAGO2 在家蚕 BmN 细胞中的表达第36页
   ·MTT 检测细胞活力第36页
 3 结果第36-42页
   ·病毒滴度测定(终点稀释法)第36-38页
   ·融合蛋白在家蚕 BmN 细胞中的表达及 Western blotting 鉴定第38-40页
   ·Western blotting 鉴定蛋白的时序表达及细胞活力第40-42页
 4 讨论第42-43页
第五章 免疫共沉淀分离 RISC 复合物及结合 RNA第43-49页
 1 材料与试剂及设备仪器第43-44页
 2 方法第44-46页
   ·家蚕细胞中重组 HIS 融合 BmAGO2 蛋白的免疫共沉淀第44-45页
   ·Western blotting 检测免疫共沉淀分离出的 BmAGO2 蛋白第45页
   ·免疫共沉淀分离 BmAGO2 蛋白及结合 RNA第45页
   ·免疫共沉淀结合 RNA 的提取第45-46页
   ·15%尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定提取的 RNA第46页
 3 结果第46-48页
   ·免疫共沉淀分离 BmAGO2 蛋白第46-47页
   ·BmAGO2 蛋白结合 RNA 的分离第47-48页
 4 讨论第48-49页
第六章 家蚕细胞 RISC 复合物结合小 RNA 的高通量测序及生物信息学分析第49-61页
 1 材料与方法第49-51页
   ·深度测序数据来源第49页
   ·测序数据的分析第49-51页
   ·Stem-loop qRT-PCR 法检测细胞中 miRNA 的表达水平第51页
 2 结果与分析第51-60页
   ·小 RNA 序列的基本情况第51-54页
   ·BmAGO2 蛋白相关 miRNA第54-57页
   ·BmNPV 编码的 small RNAs 和 miRNAs第57-59页
   ·来源于 rRNAs, snoRNAs 和 snRNAs 的新小 RNA第59-60页
 3 讨论第60-61页
第七章 家蚕细胞 tRF 小 RNA 的 Northern blotting 鉴定与剪切模式的分析第61-72页
 1 材料与试剂及仪器第61-65页
 2 方法第65-67页
   ·细胞的收集和细胞总 RNA 的提取第65页
   ·RNA 浓度及纯度测定第65页
   ·探针的制备与纯化第65-66页
   ·Northern blotting 鉴定第66-67页
 3 结果与分析第67-71页
   ·tRFs 的 Northern blotting 鉴定第67-69页
   ·tRFs 的剪切分析第69-71页
 4 讨论第71-72页
结论第72-73页
附录第73-84页
参考文献第84-89页
致谢第89页

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