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嗜酸氧化亚铁硫杆菌铁硫簇生物合成机理研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
縮略词表第10-11页
目录第11-15页
第一章 绪论第15-38页
   ·生物冶金概述第15页
   ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌能量代谢介绍第15-21页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌简介第15-16页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌基因组信息第16-18页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌铁氧化系统介绍第18-19页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化系统介绍第19-21页
   ·铁硫簇生物合成第21-36页
     ·铁硫簇的结构第22-23页
     ·铁硫簇的功能第23-24页
     ·铁硫簇的系统组成第24-30页
     ·铁硫簇的生物合成机理第30-34页
     ·ISC铁硫簇传递机理第34-35页
     ·ISC铁硫簇生物合成的调节机制第35-36页
   ·论文研究目的及意义第36-37页
   ·论文研究的主要内容第37页
   ·论文课题来源第37-38页
第二章 实验材料与方法第38-53页
   ·实验材料第38-41页
       ·菌种与载体第38-39页
     ·工具酶及试剂盒第39页
     ·其它试剂第39页
     ·培养基第39-41页
   ·实验方法第41-51页
     ·细菌的培养第41-42页
     ·基因组的提取第42页
     ·基因组DNA凝胶纯化第42-43页
     ·PCR扩增第43-44页
     ·PCR产物及载体pET28b的酶切第44页
     ·载体和目的片段连接反应第44页
     ·转化第44-45页
     ·阳性克隆的筛选第45-46页
     ·蛋白质的条件表达第46-47页
     ·蛋白的纯化第47页
     ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第47-50页
     ·Western blotting第50-51页
   ·测试分析方法第51-53页
     ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第51页
     ·紫外分光光度计(UV Scanning)第51页
     ·电子顺磁共振(EPR)第51页
     ·Bradford法测定蛋白质浓度第51-52页
     ·蛋白样品中铁含量和无机硫含量的测定第52-53页
第三章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌IscU的克隆表达及性质鉴定第53-69页
   ·引言第53-54页
   ·材料与方法第54-57页
     ·细菌的培养第54页
     ·pET28b-IscU表达载体的构建第54页
     ·IscU蛋白的表达第54-55页
     ·IscU蛋白的纯化第55-56页
     ·IscU蛋白结合铁的能力的测定第56-57页
     ·IscU上铁硫簇组装的测定第57页
   ·结果与讨论第57-67页
     ·细菌的培养第57-58页
     ·IscU基因的克隆与表达载体的构建第58页
     ·IscU蛋白的表达第58-60页
     ·IscU蛋白的纯化第60-61页
     ·IscU蛋白结构的模拟第61-63页
     ·IscU蛋白铁结合能力的研究第63-64页
     ·IscU蛋白铁硫簇组装的研究第64-67页
   ·本章小结第67-69页
第四章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌IscS的克隆表达及性质鉴定第69-83页
   ·引言第69页
   ·材料与方法第69-72页
     ·pET28b-IscS表达载体的构建第69-70页
     ·IscS蛋白的表达与纯化第70-71页
     ·IscS蛋白半胱氨酸脱硫酶活性的测定第71页
     ·不同pH和温度条件对IscS半胱氨酸脱硫酶活性的影响第71页
     ·IscS对铁硫簇组装作用的研究第71-72页
     ·IscS蛋白结合铁及铁硫复合物的能力的测定第72页
   ·结果与讨论第72-82页
     ·IscS基因的克隆与表达载体的构建第72-73页
     ·IscS蛋白的表达、纯化与鉴定第73-74页
     ·IscS蛋白结构的模拟第74-76页
     ·IscS半胱氨酸脱硫酶活性的检测第76-78页
     ·IscS参与铁硫簇的生物组装第78-81页
     ·IscS蛋白结合铁及铁硫复合物的能力第81-82页
   ·本章小结第82-83页
第五章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌IscA的克隆表达及性质鉴定第83-103页
   ·引言第83页
   ·材料与方法第83-86页
     ·pET28b-IscA表达载体的构建第83-84页
     ·IscA蛋白的表达与纯化第84-85页
     ·不同形式的IscA蛋白的制备第85页
     ·IscA蛋白铁结合能力的测定第85页
     ·不同形式的IscA蛋白之间的转换第85页
     ·A.ferrooxidans IscA对E.coli体内铁硫簇合成的替代作用第85-86页
     ·IscA蛋白参与IscU上铁硫簇的生物合成第86页
   ·结果与讨论第86-101页
     ·IscA基因的克隆与表达载体的构建第86-87页
     ·IscA蛋白的表达、纯化与鉴定第87-88页
     ·IscA蛋白结构的模拟第88-90页
     ·IscA铁结合能力的测定第90-95页
     ·IscA对大肠杆菌体内铁硫簇合成的替代作用第95-97页
     ·不同形式的IscA蛋白之间的转换第97-100页
     ·IscA作为铁供体参与IscU上铁硫簇的生物组装第100-101页
   ·本章小结第101-103页
第六章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌铁硫簇组装及其传递机理研究第103-120页
   ·引言第103-104页
   ·材料与方法第104-106页
     ·蛋白样品的制备第104页
     ·低铁离子浓度下IscU上铁硫簇的生物组装第104页
     ·L-半胱氨酸在铁硫簇生物合成中的作用第104-105页
     ·ISC铁硫簇系统中IscA和IscU上铁硫簇合成的竞争机制第105页
     ·铁硫簇中支架蛋白和apo-形式铁硫蛋白之间的传递机制第105-106页
   ·结果与讨论第106-118页
     ·在低铁离子条件下IscU上铁硫簇的生物组装第106-109页
     ·L-半胱氨酸可以修饰IscA中铁的结合中心第109-110页
     ·Iron-loaded IscA为铁硫簇在支架蛋白IscU上的组装提供铁第110-112页
     ·IscU是ISC操纵子中优先被选择的支架蛋白第112-115页
     ·IscA是ISC操纵子中优先被选择的铁结合蛋白第115-116页
     ·铁硫簇在IscA和apo-形式铁硫蛋白之间的传递第116-118页
   ·本章小结第118-120页
第七章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌ATP硫酸化酶的表达、纯化及性质研究第120-134页
   ·引言第120页
   ·材料与方法第120-123页
     ·pET28b-CysD1表达载体的构建第120-121页
     ·CysD1蛋白的表达与纯化第121-122页
     ·CysD1突变体蛋白的构建第122-123页
     ·重组ATPS的酶活测定第123页
   ·结果与讨论第123-133页
     ·ATPS基因的克隆与表达载体的构建第123-124页
     ·CysD1蛋白的表达与纯化第124-125页
     ·CysD1的ATPS酶活性分析第125-127页
     ·CysD1蛋白结构的模拟第127-129页
     ·CysD1 ATP硫酸化酶结合关键位点第129-133页
   ·本章小结第133-134页
第八章 总结与展望第134-138页
   ·全文总结第134-136页
   ·研究展望第136-138页
参考文献第138-150页
攻读学位期间主要的研究成果第150-151页
致谢第151页

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