| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 1 引言 | 第8-16页 |
| ·达尔文进化论 | 第8-10页 |
| ·进化论的发展 | 第10-14页 |
| ·中性学说对达尔文进化论的冲击和完善 | 第10-11页 |
| ·自组织理论对达尔文进化论的冲击和完善 | 第11-13页 |
| ·分子生物学对进化论的影响 | 第13-14页 |
| ·本文概述 | 第14-16页 |
| 2 Eigen 模型 | 第16-24页 |
| ·Eigen 进化方程 | 第16-19页 |
| ·理论建立 | 第16-17页 |
| ·Eigen 进化方程 | 第17-19页 |
| ·Eigen 模型的成就与发展 | 第19-22页 |
| ·Eigne 模型的成就 | 第19-20页 |
| ·Eigen 模型的发展 | 第20-22页 |
| ·Eigen 模型的局限性及与其它模型的关系和区别 | 第22-23页 |
| ·Eigen 模型的局限性 | 第22页 |
| ·与其他模型的关系和区别 | 第22-23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 3 复杂网络 | 第24-39页 |
| ·网络的定义 | 第24-26页 |
| ·网络分类及特征 | 第26-27页 |
| ·几个典型的网络模型的介绍 | 第27-36页 |
| ·生物网络的发展及已取得的成果 | 第36-39页 |
| 4 相似度网络 | 第39-43页 |
| ·生物序列比对 | 第39-40页 |
| ·生物序列比对的基本概念及作用 | 第39-40页 |
| ·生物序列比对的意义 | 第40页 |
| ·相似度网络 | 第40-43页 |
| 5 几种适应度景观 | 第43-60页 |
| ·静止均匀适应度景观 | 第43-47页 |
| ·静止单峰适应度景观（SPL） | 第47-53页 |
| ·动态单峰适应度景观 | 第53-60页 |
| 6 小结 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第69-71页 |