| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 创新点 | 第12-13页 |
| 目录 | 第13-15页 |
| 引言 | 第15-18页 |
| 第一部分 中国—四代家庭成员肠道菌群多样性分析 | 第18-34页 |
| ·材料和方法 | 第18-24页 |
| ·研究对象 | 第18-19页 |
| ·采样、样品前处理、DNA提取 | 第19-20页 |
| ·16S rDNA全长扩增,克隆文库构建 | 第20-21页 |
| ·克隆文库测序 | 第21页 |
| ·克隆文库分析 | 第21-24页 |
| ·多变量分析 | 第24页 |
| ·实验结果 | 第24-34页 |
| ·16S rDNA全长扩增,克隆文库构建 | 第24-25页 |
| ·克隆文库测序 | 第25页 |
| ·克隆文库分析 | 第25-32页 |
| ·核酸序列登录号(Accession number) | 第32页 |
| ·多变量分析 | 第32-34页 |
| 第二部分 中国—四代家庭成员肠道菌群和尿液代谢谱动态变化监测 | 第34-52页 |
| ·材料和方法 | 第34-41页 |
| ·S rDNA V3区扩增及各类群特异性扩增 | 第34-36页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)电泳 | 第36-37页 |
| ·DGGE电泳图谱分析 | 第37-38页 |
| ·尿液~1H NMR谱分析 | 第38-39页 |
| ·GC-MS分析 | 第39-40页 |
| ·GC-MS分析前样品处理 | 第39-40页 |
| ·GC-MS分析上机分析过程 | 第40页 |
| ·代谢组学数据多变量分析 | 第40-41页 |
| ·实验结果 | 第41-52页 |
| ·PCR-DGGE指纹图谱分析参数 | 第41-42页 |
| ·DGGE指纹图谱胶梯度范围的确定 | 第41页 |
| ·DGGE泳道(Lane)安排 | 第41-42页 |
| ·16S rDNA V3区及各类群特异性DGGE图谱分析结果 | 第42-52页 |
| 第三部分 肠道微生物与代谢谱的关联分析 | 第52-62页 |
| ·材料和方法 | 第52-55页 |
| ·数据前处理 | 第52页 |
| ·多变量分析: | 第52-54页 |
| ·代谢物鉴定 | 第54页 |
| ·关键功能菌的鉴定 | 第54-55页 |
| ·核酸序列登录号(Accession number) | 第55页 |
| ·肠道菌群结构组成与代谢的关联分析结果 | 第55-62页 |
| ·V3区与尿液~1HNMR代谢谱的关联 | 第55-57页 |
| ·梭菌属与尿液NMR代谢谱关联分析 | 第57-59页 |
| ·与代谢表型显著相关的功能菌及相关代谢物 | 第59-62页 |
| 第四部分 讨论 | 第62-71页 |
| ·人体肠道微生物多样性 | 第62-63页 |
| ·肠道菌群的个体特异性 | 第63-64页 |
| ·肠道微生物组与性别 | 第64页 |
| ·肠道微生物研究策略 | 第64-65页 |
| ·本研究策略 | 第65-66页 |
| ·肠道微生物研究意义 | 第66-68页 |
| 参考文献 References | 第68-71页 |
| 第五部分 综述 | 第71-92页 |
| ·肠道微生物研究进展 | 第71-87页 |
| ·肠道微生物研究概述 | 第71-72页 |
| ·人体肠道微生物的分布 | 第72-73页 |
| ·肠道微生物的多样性 | 第73-74页 |
| ·肠道微生物的功能 | 第74-77页 |
| ·肠道微生物的主要影响因素 | 第77-79页 |
| ·研究现况、研究方法及最新研究技术进展 | 第79-84页 |
| ·微生物与人体健康和疾病 | 第84-86页 |
| ·肠道微生态的研究前景 | 第86-87页 |
| 参考文献 References: | 第87-92页 |
| 附录1、简称缩写 | 第92-93页 |
| 附录2.溶液试剂及培养基 | 第93-94页 |
| 附录3.实验中所用的仪器设备 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 已(待)发表的学术论文及参与的科研项目 | 第96-97页 |
