| 中文摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-9页 |
| 前言 | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-29页 |
| ·后基因组时代的有力工具――蛋白质组学 | 第11-17页 |
| ·蛋白质组学的出现是后基因组时代的必然 | 第11-12页 |
| ·蛋白质组学的支撑技术 | 第12-16页 |
| ·蛋白质组学的发展趋势 | 第16-17页 |
| ·蛋白质组研究策略的对比：“2D-gel”vs“Shotgun” | 第17-19页 |
| ·蛋白质组研究中的预分离技术 | 第19-20页 |
| ·亚细胞蛋白质组学 | 第20-23页 |
| ·亚细胞蛋白质组学的相关技术及进展 | 第21-22页 |
| ·细胞核蛋白质组学 | 第22-23页 |
| ·定量蛋白质组学 | 第23-26页 |
| ·定量蛋白质组的相关技术 | 第24-25页 |
| ·蛋白酶解过程的~(18)O标记 | 第25-26页 |
| ·蛋白质组与肿瘤的诊断和治疗 | 第26-28页 |
| ·阐释肿瘤发生与发展的分子机制 | 第26-27页 |
| ·分子标志物的寻找与药物分子靶标的预测 | 第27-28页 |
| ·本课题的研究意义和研究内容 | 第28-29页 |
| ·研究意义 | 第28页 |
| ·研究内容 | 第28-29页 |
| 第二章 2D LC-MS/MS 蛋白质组研究方法的建立 | 第29-40页 |
| ·引言 | 第29页 |
| ·材料与方法 | 第29-33页 |
| ·主要仪器 | 第29-30页 |
| ·主要试剂 | 第30页 |
| ·蛋白浓度的测定 | 第30页 |
| ·标准蛋白的胰蛋白酶溶液酶解 | 第30-31页 |
| ·已知蛋白混合物的胰蛋白酶溶液酶解 | 第31页 |
| ·肽混合物的二维液相色谱串联质谱（2D LC-MS/MS）分析 | 第31-32页 |
| ·质谱数据处理与蛋白的搜索鉴定 | 第32-33页 |
| ·结果与讨论 | 第33-38页 |
| ·蛋白的溶液内酶解 | 第33-34页 |
| ·标准蛋白的2D LC-MS/MS 分析与鉴定 | 第34-37页 |
| ·已知蛋白混合物的2D LC MS/MS 分离鉴定 | 第37-38页 |
| ·小结 | 第38-40页 |
| 第三章 基于“shotgun”研究策略探讨抗生素生物合成途径 | 第40-60页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·材料与方法 | 第40-45页 |
| ·主要仪器与试剂 | 第40-41页 |
| ·菌种及培养条件 | 第41-42页 |
| ·菌体总蛋白的提取与胰蛋白酶溶液酶解 | 第42-43页 |
| ·肽混合物的2D LC-MS/MS 分析与鉴定 | 第43-44页 |
| ·鉴定蛋白的生物信息学统计分析 | 第44-45页 |
| ·结果与讨论 | 第45-59页 |
| ·菌体总蛋白提取方法的选择 | 第45页 |
| ·分离与过滤条件对2D LC MS/MS 分析结果的影响 | 第45-48页 |
| ·鉴定蛋白的理化性质与亚细胞定位分析 | 第48-51页 |
| ·鉴定蛋白的功能分析 | 第51-55页 |
| ·抗生素合成相关酶类分析及对合成途径的启示 | 第55-59页 |
| ·小结 | 第59-60页 |
| 第四章 基于预分离策略预测白血病细胞系k562 生物标志物 | 第60-83页 |
| ·引言 | 第60-61页 |
| ·材料与方法 | 第61-65页 |
| ·主要仪器与试剂 | 第61-62页 |
| ·细胞系与细胞培养 | 第62-63页 |
| ·细胞总蛋白的提取与溶液酶解 | 第63页 |
| ·细胞总蛋白SDS-PAGE 分离与胶内酶解 | 第63-64页 |
| ·酶解产物的分离鉴定与生物信息学分析 | 第64-65页 |
| ·结果与讨论 | 第65-82页 |
| ·SDS-PAGE 预分离策略与“shotgun”策略的对比 | 第65-67页 |
| ·鉴定蛋白的理化性质分析 | 第67-69页 |
| ·蛋白表达基因来源染色体分布 | 第69页 |
| ·GO 注释 | 第69-75页 |
| ·与肿瘤相关蛋白分析及生物标志物和药物靶标的预测 | 第75-82页 |
| ·小结 | 第82-83页 |
| 第五章 亚细胞水平上k562 核蛋白表达谱的构建及生物学分析 | 第83-100页 |
| ·引言 | 第83页 |
| ·材料与方法 | 第83-86页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第83-84页 |
| ·细胞核蛋白的提取与纯度检测 | 第84-85页 |
| ·细胞核蛋白分离与胶内酶解 | 第85页 |
| ·肽混合物的分离鉴定与统计分析 | 第85-86页 |
| ·结果与讨论 | 第86-99页 |
| ·核蛋白分离提取效果评价 | 第86页 |
| ·蛋白的鉴定与理化性质分析 | 第86-89页 |
| ·蛋白表达基因来源染色体分布 | 第89-90页 |
| ·蛋白功能参与生物过程及定位的GO 预测 | 第90-95页 |
| ·与肿瘤相关蛋白分析 | 第95-99页 |
| ·小结 | 第99-100页 |
| 第六章 多烯紫杉醇诱导k562细胞凋亡过程中可溶性蛋白表达变化的定量分析 | 第100-113页 |
| ·引言 | 第100页 |
| ·材料与方法 | 第100-102页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第100-101页 |
| ·药物处理及细胞总蛋白的提取 | 第101页 |
| ·细胞蛋白提取物的胰蛋白酶酶解与~(18)O 标记 | 第101页 |
| ·标记产物的分析鉴定 | 第101页 |
| ·肽段的定量分析比较 | 第101-102页 |
| ·差异蛋白的生物学意义探讨 | 第102页 |
| ·结果与讨论 | 第102-111页 |
| ·肽段峰面积比值的计算及方法评价 | 第102页 |
| ·肽段比值范围的确定 | 第102-106页 |
| ·可溶性蛋白质组的变化及生物学意义分析 | 第106-111页 |
| ·小结 | 第111-113页 |
| 第七章 结论与展望 | 第113-116页 |
| ·结论 | 第113-114页 |
| ·创新点 | 第114-115页 |
| ·展望 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-132页 |
| 发表论文及参加科研情况 | 第132-133页 |
| 附录 | 第133-140页 |
| 致谢 | 第140页 |
