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暗色丝孢真菌细基格孢属(Ulocladium)、葡柄霉属(Stemphylium)及链格孢属(Alternaria)的分类和分子系统学研究

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-11页
英文缩写符号及中英文对照表第11-12页
1. 引言第12-25页
   ·分子系统学研究的基本原理第12-20页
     ·分子系统学的发展和应用第12页
     ·分子系统学基本原理与方法第12-14页
     ·分子系统学在现代真菌分类中的应用第14-20页
   ·植物致病性暗色丝孢真菌的分类研究状况第20-24页
     ·经济重要性第20-22页
     ·细基格孢属(Ulocladium)、匍柄霉属(Stemphylium)及链格孢属(Alternaria)分类标准第22-24页
     ·三个属的分类研究中存在的问题第24页
   ·本研究的目的和意义第24-25页
2 材料与方法第25-43页
   ·实验材料与仪器第25-28页
     ·菌种及标本来源第25页
     ·培养基第25-26页
       ·分离及鉴定培养基第25页
       ·液体发酵培养基第25页
       ·LB 液体培养基第25-26页
       ·LB 固体培养基第26页
     ·仪器与试剂第26-28页
       ·主要仪器第26页
       ·主要试剂及配制方法第26-28页
   ·形态分类实验方法第28-29页
     ·标本处理第28页
       ·新鲜标本处理第28页
       ·种子处理第28页
     ·纯培养的获得第28-29页
     ·描述鉴定第29页
   ·分子系统学研究方法第29-43页
     ·供试菌株第29-32页
       ·匍柄霉属分子系统学研究受试菌株第29-30页
       ·细基格孢属分子系统学研究受试菌株第30-32页
     ·菌体培养第32页
     ·DNA 的提取第32-33页
     ·PCR 引物设计、反应体系及步骤第33-34页
     ·ITS 扩增产物测序第34页
     ·gpd 扩增产物测序第34-36页
       ·扩增产物的回收第34页
       ·感受态细胞的制备步骤第34-35页
       ·扩增片断与载体连接第35页
       ·大肠杆菌感受态细胞的转化第35页
       ·碱法小量提取质粒 DNA第35-36页
       ·质粒的酶切鉴定第36页
       ·gpd 序列的测定第36页
     ·数据处理方法第36-43页
       ·序列的比对排定(Alignment)第36-38页
       ·分子系统树的构建第38-43页
       ·树的显示和保存第43页
3 结果与分析第43-57页
   ·新种的描述第43-46页
     ·亚小球匍柄霉 Stemphylium subglobuliferum第43-44页
     ·辣椒细基格孢 Ulocladium capsicum第44-46页
   ·新种的分子系统学证据第46-56页
     ·采用简约法对亚小球匍柄霉(Stemphylium subglobuliferum)的分子系统学分析结果第46-50页
     ·采用距离法对辣椒细基格孢(Ulocladium capsicum)的分子系统学分析结果第50-56页
   ·三属的分类和分子系统学关系第56-57页
4 讨论与结论第57-63页
   ·形态分类条件的优化第57-59页
   ·基于基因测序的分子系统学研究方法的优越性第59页
   ·分子系统学研究中应注意的外群选择问题第59-60页
   ·细基格孢属(Ulocladium)分类标准的修订第60-61页
   ·链格孢属(Alternaria)分类标准的修订第61-63页
参考文献第63-71页
致谢第71-72页
攻读学位期间发表论文情况第72-73页
附录第73页

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