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心肌短暂缺血—再灌注反应基因的筛选、克隆和功能初步研究

缩写词简表第1-11页
中文摘要第11-14页
英文摘要第14-17页
前言第17-20页
技术路线第20-23页
第一章 采用抑制消减杂交技术筛选大鼠心肌短暂缺血-再灌注诱导表达上调的基因第23-42页
 一、 材料和方法第23-32页
  1. 材料第23-24页
   ·实验动物第23页
   ·试剂第23-24页
   ·引物第24页
  2. 方法第24-32页
   ·大鼠心肌短暂缺血-再灌注动物模型的建立第24-25页
   ·总 RNA 的提取第25页
   ·mRNA 的提取第25页
   ·抑制消减杂交第25-30页
     ·cDNA 第一链的合成第25页
     ·cDNA 第二链的合成第25-26页
     ·双链cDNA 的 RsaⅠ酶切第26页
     ·检测子(tester)cDNA 的接头连接第26页
     ·连接效率的检测第26-27页
     ·消减杂交第27页
     ·抑制性 PCR第27-28页
     ·消减效率的检测第28-29页
     ·消减cDNA 文库的构建第29-30页
   ·反向 Northern 点杂交初步筛选差异表达基因第30页
   ·测序与序列分析第30页
   ·RT-PCR 进一步鉴定差异表达第30-31页
   ·Northern blot 进一步鉴定差异表达第31-32页
 二、 结果第32-40页
  1. 总 RNA 及mRNA 的提取第32-33页
  2. 双链cDNA 的合成及RsaⅠ酶切第33页
  3. 双链cDNA 与接头的连接效率检测第33-34页
  4. 消减 PCR 产物检测第34-35页
  5. 消减效率的检测第35页
  6. 大鼠心肌缺血-再灌注诱导表达上调基因的消减cDNA 文库的构建第35-36页
  7. 反向 Northern 点杂交初步筛选差异表达基因第36-37页
  8. 测序和序列分析第37-39页
  9. RT-PCR 和 Northern blot 进一步验证差异表达第39-40页
 三、 讨论第40-42页
第二章 采用cDNA 微阵列结合聚类分析探讨大鼠心肌短暂缺血-再灌注后不同时间点基因表达谱的改变第42-55页
 一、 材料和方法第42-43页
  1. 材料第42页
  2. 方法第42-43页
   ·大鼠心肌短暂缺血-再灌注动物模型的制备第42-43页
   ·cDNA 芯片检测与分析第43页
   ·聚类分析第43页
 二、 结果第43-52页
  1 cDNA 芯片结果第43-49页
  2. 聚类分析第49-52页
 三、 讨论第52-55页
第三章 大鼠心肌短暂缺血-再灌注诱导表达上调的新基因 Mip1 的克隆和特性分析第55-73页
 一、 材料和方法第55-59页
  1. 材料第55-56页
   ·载体和菌株第55页
   ·试剂第55-56页
   ·引物第56页
  2. 方法第56-59页
   ·EST 拼接第56页
   ·电子克隆第56-57页
   ·RACE 技术获取基因5′末端第57-58页
     ·cDNA 第一链的合成第57页
     ·5′RACE 扩增第57-58页
     ·测序和拼接第58页
   ·RT-PCR 验证所获基因全长第58页
   ·多组织膜 Northern 杂交第58页
   ·生物信息学分析 Mip1 的核酸和蛋白质特性第58-59页
 二、 结果第59-71页
  1. EST 拼接与电子克隆第59页
  2. 5′RACE 扩增第59-60页
  3. RT-PCR 验证所获基因全长第60-62页
  4. 多组织膜 Northern 杂交结果第62页
  5. Mip1 的核酸与蛋白质特性的生物信息学分析第62-71页
 三、 讨论第71-73页
第四章 新基因 Mip1 功能的初步研究第73-90页
 一、 材料和方法第73-81页
  1. 材料第73-74页
   ·实验动物第73页
   ·细胞第73页
   ·载体和菌株第73页
   ·试剂第73-74页
  2. 方法第74-81页
   ·大鼠心肌短暂缺血-再灌注动物模型的制备第74页
   ·Northern blot 检测Mip1 在大鼠心肌短暂缺血-再灌注后不同时间点的表达第74-75页
   ·Mip1 的真核表达质粒Mip1-pEGFP-N1 和Mip1-pcDNA3.1/myc-His(-)的构建第75-78页
     ·加端 PCR 扩增 Mip1 的 ORF第76页
     ·PCR 产物及载体的酶切及回收第76-77页
     ·连接与转化第77页
     ·质粒 DNA 的小量制备第77-78页
     ·Mip1-pEGFP-N1 和 Mip1-pcDNA3.1 重组子的鉴定第78页
     ·质粒 DNA 的大量制备第78页
   ·Mip1 蛋白在正常和活性氧刺激时的亚细胞定位第78-79页
   ·稳定表达 Mip1 的 C2C12细胞株的建立第79页
     ·转染和 G418 筛选第79页
     ·Western blot 筛选高表达克隆第79页
   ·H_2O_2浓度的测定第79页
   ·H_2O_2损伤实验第79页
   ·LDH 释放率检测第79-80页
   ·Hoechst 33258 染色检测细胞凋亡发生率第80页
   ·流式细胞术检测Mip1对细胞周期的影响第80页
   ·统计处理第80-81页
 二、 结果第81-88页
  1. Northern blot 检测Mip1 在大鼠心肌短暂缺血-再灌注后不同时间点的表达第81页
  2. Mip1 蛋白在正常和活性氧刺激时的亚细胞定位第81-84页
   ·Mip1-pEGFP-N1 重组质粒的鉴定第81-83页
   ·Mip1 蛋白在正常和氧化应激时的亚细胞定位第83-84页
  3. 稳定表达 Mip1 的 C_2C_(12)细胞株的建立第84-85页
   ·Mip1-pcDNA3.1/myc-His(-)重组质粒的鉴定第84-85页
   ·Western blot 筛选高表达 Mip1 的细胞克隆第85页
  4. LDH 释放率的测定第85-86页
  5. Hoechst 33258 染色检测细胞凋亡发生率第86-87页
  6. 流式细胞术分析Mip1对细胞周期的影响第87-88页
 三、讨论第88-90页
结论第90-91页
参考文献第91-98页
综述1第98-109页
综述 2第109-116页
攻读学位期间主要的研究成果目录第116-118页
致谢第118页

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