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嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因的克隆和表达

中文摘要第1-11页
ABSTRACT第11-12页
第一章 文献综述第12-34页
 1 几丁质酶的研究进展第13-24页
   ·几丁质的结构第13页
   ·几丁质的降解方式第13-14页
   ·几丁质酶的研究历史和现状第14-16页
   ·几丁质酶的分类和关系第16-17页
   ·几丁质酶的抗病作用第17-19页
   ·微生物几丁质酶的分子生物学第19-23页
     ·信号肽序列第20页
     ·催化域第20-22页
     ·几丁质结合区域第22-23页
     ·C 端序列第23页
   ·几丁质酶的应用第23-24页
 2 巴斯德毕赤酵母表达系统的研究进展第24-32页
   ·巴斯德毕赤酵母的特性第25-26页
   ·毕赤酵母宿主菌和表达载体的类型第26-29页
   ·表达载体在毕赤酵母中的整合第29-31页
   ·巴斯德毕赤酵母中信号肽的剪切过程第31页
   ·巴斯德毕赤酵母表达外源蛋白展望第31-32页
 3 本研究的目的意义及研究内容第32-34页
   ·本研究的目的意义第32-33页
   ·研究内容第33-34页
第二章 嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因克隆及序列分析第34-65页
 1 材料和方法第34-50页
   ·实验材料第34-37页
     ·菌株与质粒第34页
     ·酶和生化试剂第34-35页
     ·仪器第35页
     ·培养基第35页
     ·溶液配制第35-36页
     ·PCR 引物第36-37页
   ·实验方法第37-50页
     ·总RNA 的提取(Trizol 法)第37-38页
     ·紫外检测RNA 产率和纯度第38页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第38-39页
     ·目的基因3’末端的分离(3’-RACE)第39-45页
       ·目的基因3’末端的扩增第39页
       ·PCR 产物回收第39-40页
       ·载体连接第40-41页
       ·大肠杆菌 E.coli 感受态细胞的制备和转化第41-43页
         ·大肠杆菌感受态的制备第41-42页
         ·大肠杆菌感受态的转化第42-43页
       ·重组质粒的筛选与鉴定第43-45页
         ·IPTG-X-gal 筛选第43页
         ·菌落 PCR 检测第43页
         ·碱法小量提取质粒 DNA第43-44页
         ·质粒 DNA 的酶切鉴定第44页
         ·序列测定第44-45页
     ·目的基因5’末端的分离(5’-RACE)第45-49页
       ·cDNA 第一链的合成第45-46页
       ·cDNA 第一链的纯化第46-47页
       ·cDNA 第一链的加尾第47页
       ·RACE-PCR 扩增第47-49页
       ·二次 PCR(巢式PCR)第49页
     ·目的基因全长cDNA 的克隆第49-50页
     ·全长序列的生物信息学分析第50页
 2 结果与分析第50-61页
   ·嗜热子囊菌光孢变种总RNA 的提取第50页
   ·嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因cDNA3’-末端的分离第50-52页
   ·嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因cDNA 5’-末端的分离第52页
   ·嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因全长cDNA 的分离第52-54页
   ·嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第54-61页
     ·几丁质酶基因Tachit 的核苷酸序列分析第56页
     ·几丁质酶基因 Tachit 的预测蛋白氨基酸序列分析第56-59页
     ·几丁质酶基因Tachit 的预测蛋白氨基酸组成第59-61页
 3 讨论第61-65页
   ·几丁质酶基因克隆的策略第61-62页
   ·RACE 技术应注意的问题第62-65页
第三章 嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因在大肠杆菌和毕赤酵母中的表达第65-98页
 1 材料和方法第65-80页
   ·实验材料第65-70页
     ·菌株和质粒第65-66页
     ·酶和生化试剂第66页
     ·培养基及有关溶液的配制第66-69页
     ·主要仪器设备第69-70页
   ·实验方法第70-80页
     ·几丁质酶基因片段的分离第70-71页
       ·几丁质酶基因序列的限制性酶切位点分析第70页
       ·引物设计第70-71页
     ·几丁质酶基因在大肠杆菌中的表达第71-73页
       ·几丁质酶基因原核表达载体的构建第71-72页
       ·几丁质酶基因的原核诱导表达第72页
       ·表达蛋白的可溶性分析第72页
       ·表达蛋白的几丁质酶活性测定第72-73页
     ·几丁质基因在毕赤酵母中的表达第73-80页
       ·酵母表达载体的构建第73-74页
       ·酵母转化第74-76页
         ·线性化质粒 DNA 的制备第74页
         ·Pichia pastoris GS115 感受态细胞的制备(电击法)第74-75页
         ·电击转化酵母感受态细胞第75-76页
       ·酵母转化子的筛选与鉴定第76-78页
         ·酵母转化子甲醇利用表型的平板筛选第76页
         ·酵母基因组 DNA 的分离第76-78页
       ·酵母转化子的 PCR 鉴定第78页
       ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第78-79页
       ·酵母工程菌的培养和几丁质酶的诱导表达第79-80页
       ·重组酵母表达产物的生物学活性检测第80页
         ·pPIC3.5K 胞内表达的酶活测定第80页
         ·pPIC9K 分泌表达的酶活测定第80页
       ·重组酵母表达产物的SDS-PAGE 分析第80页
 2. 结果与分析第80-94页
   ·几丁质酶编码序列的分离第80-82页
   ·几丁质酶基因在大肠杆菌中的表达第82-85页
     ·几丁质酶基因重组表达载体的构建第82-83页
     ·几丁质酶基因在大肠杆菌中的诱导表达第83-84页
     ·表达蛋白的可溶性分析第84-85页
     ·表达蛋白的几丁质酶活性测定第85页
   ·几丁质酶基因在毕赤酵母中的表达第85-94页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第85-88页
     ·重组酵母转化子的筛选第88-91页
       ·酵母转化子的甲醇利用表型的筛选第88-89页
       ·酵母转化子的 PCR 鉴定第89-90页
       ·几丁质酶基因多拷贝整合子的筛选第90-91页
     ·几丁质酶基因在Pichia pastoris 中的表达第91-94页
       ·几丁质酶基因在 Pichia pastoris 中的胞内表达第91页
       ·几丁质酶基因在 Pichia pastoris 中的分泌表达第91页
       ·重组酵母菌株产酶曲线测定第91-92页
       ·几丁质酶基因表达产物的 SDS-PAGE 检测第92-94页
         ·胞内表达重组酵母几丁质酶表达产物的SDS-PAGE 检测第92页
         ·分泌表达重组酵母几丁质酶表达产物的SDS-PAGE 检测第92-94页
 3 讨论第94-98页
   ·实验分析第94页
   ·表达系统的选择第94-96页
   ·酵母细胞的破壁方法第96页
   ·真核表达载体的线性化第96-98页
第四章 嗜热子囊菌光孢变种几丁质酶基因分泌表达产物的纯化及其性质研究第98-107页
 1 材料和方法第98-101页
   ·实验材料第98-99页
     ·几丁质酶工程菌株第98页
     ·主要试剂第98-99页
     ·培养基第99页
     ·主要仪器设备第99页
   ·实验方法第99-101页
     ·巴斯德毕赤酵母分泌表达产物的纯化第99页
     ·表达产物的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第99-100页
     ·几丁质酶酶学特性的研究第100-101页
       ·反应最适温度第100页
       ·热稳定性第100页
       ·反应最适pH 值第100-101页
       ·pH 值稳定性第101页
       ·各种金属离子对几丁质酶活性的影响第101页
 2 结果与分析第101-104页
   ·重组几丁质酶的纯化第101-102页
   ·重组几丁质酶的最适反应温度第102页
   ·重组几丁质酶的热稳定性第102-103页
   ·重组几丁质酶的最适反应pH 值第103-104页
   ·金属离子对重组几丁质酶活性的影响第104页
 3 讨论第104-107页
   ·几丁质酶的热稳定性第104-105页
   ·几丁质酶酶活的大小第105页
   ·几丁质酶的pH 稳定性第105-107页
第五章 结果和展望第107-109页
 1 结果第107-108页
 2 展望第108-109页
参考文献第109-120页
致谢第120页

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