| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-27页 |
| ·计算机药物设计简介与展望 | 第7-15页 |
| ·间接药物设计方法 | 第8-9页 |
| ·直接药物设计方法 | 第9-14页 |
| ·药物设计未来的期望与挑战 | 第14-15页 |
| ·SARS冠状病毒 | 第15-18页 |
| ·计算机辅助设计在抗SARS药物上的进展 | 第16-18页 |
| ·新关键蛋白酶的发现 | 第18页 |
| ·禽流感病毒 | 第18-27页 |
| ·病毒简介 | 第18-21页 |
| ·禽流感药物 | 第21-27页 |
| 第二章 基于组织蛋白酶L的中药数据库虚拟筛选 | 第27-45页 |
| ·抑制剂MDL28170 | 第28页 |
| ·组织蛋白酶L | 第28-30页 |
| ·相似性搜索 | 第30页 |
| ·分子对接计算(DOCK软件) | 第30-38页 |
| ·活性位点的确定 | 第31页 |
| ·匹配原则 | 第31-32页 |
| ·得分函数 | 第32-33页 |
| ·格点对接 | 第33-34页 |
| ·柔性策略 | 第34-38页 |
| ·计算结果与讨论 | 第38-44页 |
| ·结论 | 第44-45页 |
| 第三章 H5N1 神经氨酸酶结构变异与其抗药性的研究 | 第45-57页 |
| ·抗原转变(antigenic shift) | 第46-47页 |
| ·NA蛋白的同源模建 | 第47-50页 |
| ·结构和序列比对 | 第50-52页 |
| ·抑制剂和受体之间的相互作用 | 第52-55页 |
| ·结论 | 第55-57页 |
| 第四章 基于神经氨酸酶N1 晶体结构对达菲的修饰 | 第57-70页 |
| ·NA药物(Oseltamivir、Zanamivir)发展史 | 第57-59页 |
| ·H5N1-NA(2HTY)晶体结构 | 第59-62页 |
| ·Oselatmivir的修饰 | 第62-67页 |
| ·分子对接结果及讨论 | 第67-69页 |
| ·结论 | 第69-70页 |
| 第五章 基于分子片段的定量构效关系方法在药物设计中的应用 | 第70-87页 |
| ·理论简介 | 第71-73页 |
| ·FB-QSAR方法介绍 | 第73-78页 |
| ·计算及结果 | 第78-85页 |
| ·结论 | 第85-87页 |
| 第六章 论文结论 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-100页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第100-101页 |
| 附录 | 第101-105页 |
| 致谢 | 第105页 |
