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剪接因子BBP在稻瘟菌发育过程中的功能分析

Abstract第1-7页
摘要第7-8页
Acronyms第8-12页
SECTION 1: Literature Review第12-26页
     ·Introduction第12-14页
     ·Identification of M. oryzae第14-15页
     ·Disease cycle第15-16页
     ·Deducing pathogenicity determinants in the life cycle of M. oryzae第16-18页
     ·M. oryzae pre-mRNA splicing pathways第18-20页
     ·Alternate RNA forms and alternative splicing in M. oryzae第20-21页
     ·BBP gene and its corresponding BPS第21-22页
     ·mRNA interference in M. oryzae第22-24页
     ·Objective of the study第24-25页
     ·Research areas第25-26页
SECTION 2: Knockout of the BBP gene第26-49页
   ·Materials and Methods第26页
   ·Materials第26-32页
     ·Bacteria, fungal strain and plasmids第26页
     ·Major experimental kits and reagents第26页
     ·Major experimental equipments and machines第26页
     ·Major formulas for experimental solution and media第26-32页
   ·Methods第32-44页
     ·Fungal strains cμltivation and growth conditions第32页
     ·CTAB Method for Fungal DNA extraction第32-39页
       ·Vector plasmid and BBP gene DNA manipμlations第33-34页
       ·PCR condition for each of the two flanks第34页
       ·PCR product recovering and ligation into pMD18-T vector第34-35页
       ·Procedure for Transformation into the E. coli DH5α competent cell第35页
       ·Extraction of plasmid第35-36页
       ·Confirmation of successful ligation第36-37页
         ·PCR confirmation第36-37页
         ·Double restriction endonuclease digestion第37页
         ·Sequencing第37页
       ·Construction of knockout vector第37-39页
         ·Insertion of the left flank第38-39页
         ·Transformation into E. coli competent cell第39页
         ·Insertion of the right flank第39页
         ·Transformation into E. coli competent cell第39页
         ·Confirmation for the successful ligation第39页
     ·Transformation of pXEH-BBP into Agrobacterium strain EHA10528第39-40页
       ·Procedures for EHA105 transformation第39-40页
       ·Confirmation of successfμl tansformation第40页
     ·Agrobacterium mediated transformation of the M. oryzae strain JJ88第40-41页
       ·Procedure for ATMT第40-41页
     ·Protoplast transformation第41-42页
       ·Procedures for protoplast transformation第41-42页
     ·Extraction of transformants DNA using lysis solution第42页
       ·Procedures for DNA extraction using lysis solution第42页
     ·Screening for the mutants from transformants by PCR第42-44页
       ·Explanation of screening for the mutants第42-44页
   ·Results第44-47页
     ·Amplification of the BBP left and right flanks第44页
     ·Construction of pXEH-BBP knockout vector第44-45页
     ·Transformation into Agrobacterium strain EHA105第45-46页
     ·Transformation into rice blast fungus M. oryzae strain JJ8835第46页
     ·Knockout mutants第46-47页
   ·Discusion第47-49页
SECTION 3 RNA Interference Of BBP Gene第49-61页
   ·Materials and methods第49-55页
     ·Materials第49页
     ·Methods第49-55页
       ·Construction of RNA interference species第49页
       ·PCR conditions第49-50页
       ·PCR product recovering and purification第50页
       ·Ligation into pMD18-T vector第50页
       ·Transformation into the DH5α competent cell第50-51页
         ·Extraction of plasmid第51页
       ·Confirmation of successful ligation第51-52页
         ·PCR confirmation第51页
         ·Double restriction endonuclease digestion for sense fragment第51页
         ·Double restriction endonuclease digestion for antisense fragment第51-52页
         ·Confirmation of cloned RNA interference fragments by sequencing第52页
       ·Construction of BBP RNAi vectors第52-53页
       ·pSilent-1 plasmid restriction digestion and ligation of the flanks第53-55页
         ·ligation of the sense RNAi fragment to get pSilent-1BBPRNAiS RNA silencing species第53页
         ·Ligation第53页
         ·Transformation into E. coli competent cell第53页
         ·Confirmation of successful ligation第53-54页
         ·Ligation of the antisense fragment in pSilent-1BBPRNAiS to get hairpin RNA interference species第54页
         ·Ligation第54页
         ·Transformation into E. coli competent cell第54页
         ·Confirmation for the successfμl ligation第54-55页
     ·Transformation into M. oryzae strain JJ8844第55页
       ·Protoplast transformation第55页
     ·Screeing for transformants第55页
       ·Assays for growth and sporulation第55页
   ·Results第55-59页
     ·Amplification of the BBP sense and antisense fragments第55-56页
     ·RNA interference species第56-57页
     ·Transformants第57页
     ·Assays for growth and sporulation第57-59页
   ·Discussions第59-61页
SECTION 4第61-62页
   ·Conclusion第61-62页
References第62-70页
Acknowledgments第70页

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