高维生物数据的分类与预测研究
摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-13页 |
第一章 绪论 | 第13-26页 |
·引言 | 第13-14页 |
·研究背景 | 第14-20页 |
·生物信息学概述 | 第14-16页 |
·蛋白质 | 第16-18页 |
·蛋白质数据库 | 第18-20页 |
·相关技术和国内外研究现状 | 第20-23页 |
·蛋白质数据的特征描述方法 | 第20-22页 |
·蛋白质数据的分类方法 | 第22-23页 |
·论文的研究内容与创新点 | 第23-25页 |
·论文的组织结构 | 第25-26页 |
第二章 蛋白质序列数据的特征分析与分类技术 | 第26-45页 |
·引言 | 第26页 |
·蛋白质序列的特征描述方法 | 第26-35页 |
·基于氨基酸组成和序列顺序信息的特征描述方法 | 第26-28页 |
·基于氨基酸物理化学特性的特征描述方法 | 第28-32页 |
·基于蛋白质数据库信息的特征描述方法 | 第32-34页 |
·基于蛋白质进化信息的特征描述方法 | 第34-35页 |
·蛋白质分类算法 | 第35-42页 |
·分类模型的检验与评估 | 第42-44页 |
·模型的检验 | 第42-43页 |
·模型的评估 | 第43-44页 |
·本章小结 | 第44-45页 |
第三章 基于线性子空间算法的蛋白质序列分类与预测 | 第45-69页 |
·引言 | 第45页 |
·线性子空间概述 | 第45-50页 |
·主成分分析基础 | 第46-49页 |
·线性判别分析 | 第49-50页 |
·基于线性降维算法的蛋白质亚细胞位置预测 | 第50-60页 |
·亚细胞位置预测问题 | 第50-51页 |
·亚细胞位置预测的研究现状 | 第51-53页 |
·细菌蛋白亚细胞位置预测算法 | 第53-56页 |
·预测实验及讨论 | 第56-60页 |
·基于PCA 的蛋白质四级结构预测 | 第60-67页 |
·四级结构预测问题 | 第60-62页 |
·四级结构预测的研究现状 | 第62-63页 |
·四级结构数据选取 | 第63-64页 |
·四级结构预测算法 | 第64-65页 |
·实验结果及讨论 | 第65-67页 |
·本章小结 | 第67-69页 |
第四章 基于核方法的蛋白质亚细胞位置的分类与预测 | 第69-84页 |
·引言 | 第69页 |
·核方法基础 | 第69-72页 |
·核方法的基本思想 | 第70-71页 |
·常用的核函数 | 第71页 |
·核方法的发展及应用 | 第71-72页 |
·基于非线性降维算法的蛋白质亚细胞位置预测 | 第72-83页 |
·核 PCA | 第72-74页 |
·核 LDA | 第74-77页 |
·细菌蛋白质亚细胞位置预测 | 第77-78页 |
·实验结果及讨论 | 第78-81页 |
·Internet 网络服务 | 第81-83页 |
·本章小结 | 第83-84页 |
第五章 基于流形学习算法的膜蛋白分类与预测 | 第84-104页 |
·引言 | 第84页 |
·流形学习算法 | 第84-96页 |
·流形学习算法的研究现状 | 第84-86页 |
·几种流形学习算法 | 第86-93页 |
·最大方差映射算法 | 第93-96页 |
·基于最大方差映射算法的膜蛋白类型预测 | 第96-102页 |
·膜蛋白类型预测问题 | 第96-98页 |
·膜蛋白类型预测的研究现状 | 第98-99页 |
·膜蛋白类型预测算法 | 第99-100页 |
·实验结果及讨论 | 第100-102页 |
·本章小结 | 第102-104页 |
第六章 降维算法在高维生物数据中的应用与改进 | 第104-124页 |
·引言 | 第104-105页 |
·实验结果及讨论 | 第105-112页 |
·Isomap 改进算法 | 第112-123页 |
·最小最大距离 | 第112-114页 |
·MDM-Isomap 算法 | 第114-115页 |
·实验结果及讨论 | 第115-123页 |
·本章小结 | 第123-124页 |
第七章 总结与展望 | 第124-126页 |
·全文工作总结 | 第124-125页 |
·未来工作展望 | 第125-126页 |
参考文献 | 第126-135页 |
致谢 | 第135-137页 |
博士期间发表、撰写的学术论文 | 第137-139页 |