| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-13页 |
| 引言 | 第13-15页 |
| 1 文献综述 | 第15-34页 |
| ·引言 | 第15-16页 |
| ·甘油生物歧化过程的代谢和基因调控机理 | 第16-21页 |
| ·甘油生物歧化为1,3-丙二醇简介 | 第16-17页 |
| ·甘油生物歧化过程的代谢机理 | 第17-18页 |
| ·甘油生物歧化过程的发酵工艺 | 第18-19页 |
| ·甘油生物歧化过程的基因调控机理 | 第19-21页 |
| ·甘油生物歧化过程的动力学研究 | 第21-25页 |
| ·非线性动力学和动态行为的研究 | 第21-23页 |
| ·微生物细胞生长动力学 | 第23-24页 |
| ·底物甘油消耗动力学 | 第24-25页 |
| ·胞外主要产物形成动力学 | 第25页 |
| ·原核生物操纵子基因调控机制与数学模拟 | 第25-29页 |
| ·诱导操纵子——乳糖操纵子的表达调控 | 第26-27页 |
| ·阻遏操纵子——色氨酸操纵子的表达调控 | 第27-28页 |
| ·色氨酸操纵子的基因调控模型与数学分析 | 第28-29页 |
| ·生物化学过程的数学模拟与分析方法 | 第29-34页 |
| ·代谢工程定量分析方法简介 | 第29-31页 |
| ·化学计量系统分析 | 第31-32页 |
| ·生化系统理论(BST) | 第32-34页 |
| 2 甘油生物歧化过程的酶催化动力学 | 第34-78页 |
| ·引言 | 第34-37页 |
| ·还原途径酶催化动力学 | 第37-40页 |
| ·底物甘油跨膜运输动力学 | 第37-38页 |
| ·胞内3-羟基丙醛(3-HPA)动力学 | 第38-39页 |
| ·胞内1,3-丙二醇动力学 | 第39页 |
| ·甘油生物歧化过程还原途径酶催化动力学 | 第39-40页 |
| ·还原途径酶催化动力学实验数据和数学方法 | 第40页 |
| ·还原途径酶催化动力学模拟结果与分析 | 第40-49页 |
| ·甘油脱水酶和1,3-PD氧化还原酶的催化动力学 | 第40页 |
| ·模型参数的确定 | 第40-42页 |
| ·还原途径酶催化动力学模拟结果与分析 | 第42-49页 |
| ·氧化途径酶催化动力学 | 第49-61页 |
| ·二羟基丙酮(DHA)动力学 | 第50-52页 |
| ·磷酸二羟基丙酮(DHAP)动力学 | 第52-53页 |
| ·磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)动力学 | 第53-54页 |
| ·琥珀酸的跨膜转运动力学 | 第54页 |
| ·丙酮酸(PYR)动力学 | 第54-56页 |
| ·乳酸的跨膜转运动力学 | 第56-57页 |
| ·2,3-丁二醇的跨膜转运动力学 | 第57页 |
| ·甲酸的跨膜转运动力学 | 第57-58页 |
| ·乙酰辅酶A(乙酰CoA)动力学 | 第58页 |
| ·乙酸(HAc)的跨膜转运动力学 | 第58-59页 |
| ·乙醇(EtOH)的跨膜转运动力学 | 第59页 |
| ·甘油生物歧化过程氧化途径酶催化动力学 | 第59-61页 |
| ·氧化途径酶催化动力学实验数据和数学方法 | 第61页 |
| ·氧化途径酶催化动力学的模拟结果与分析 | 第61-76页 |
| ·四个关键酶催化动力学 | 第61-62页 |
| ·模型参数确定 | 第62-68页 |
| ·氧化途径酶催化动力学的模拟结果与分析 | 第68-76页 |
| ·小结 | 第76-78页 |
| 3 甘油生物歧化过程基因调控动力学 | 第78-122页 |
| ·引言 | 第78页 |
| ·色氨酸操纵子基因调控动力学 | 第78-84页 |
| ·色氨酸操纵子基因调控动力学简介 | 第78-80页 |
| ·基本假定 | 第80-81页 |
| ·调节蛋白动力学 | 第81-82页 |
| ·色氨酸跨膜转运动力学 | 第82-83页 |
| ·色氨酸操纵子基因调控动力学 | 第83-84页 |
| ·色氨酸操纵子动力学参数的确定 | 第84-86页 |
| ·色氨酸操纵子基因调控动力学的数学分析 | 第86-95页 |
| ·稳态分析 | 第86-88页 |
| ·鲁棒性分析 | 第88-91页 |
| ·局部稳定性分析 | 第91-92页 |
| ·动态行为分析 | 第92-95页 |
| ·色氨酸操纵子基因调控动力学的优化分析 | 第95-99页 |
| ·线性规划及优化 | 第96-97页 |
| ·最优解 | 第97-99页 |
| ·甘油生物歧化过程基因调控动力学 | 第99-106页 |
| ·甘油生物歧化过程基因调控动力学简介 | 第99-100页 |
| ·3-羟基丙醛对dha调节子的阻遏作用 | 第100-102页 |
| ·调节蛋白动力学 | 第102-103页 |
| ·关键酶GDHt和PDOR的动力学 | 第103-104页 |
| ·甘油生物歧化过程基因调控动力学的简化模型 | 第104-105页 |
| ·3-HPA阻遏的dha调节子基因调控动力学 | 第105-106页 |
| ·甘油生物歧化基因调控动力学实验数据和数学方法 | 第106-108页 |
| ·甘油生物歧化过程基因调控动力学的鲁棒性分析 | 第108-114页 |
| ·S-系统方程 | 第108-109页 |
| ·Dha调节子的鲁棒性分析 | 第109-113页 |
| ·Dha调节子的局部稳定性 | 第113-114页 |
| ·甘油生物歧化过程基因调控动力学的模拟结果与分析 | 第114-120页 |
| ·连续发酵过程的模拟和多稳态分析 | 第114-115页 |
| ·1,3-丙二醇的生产强度 | 第115-116页 |
| ·胞内主要物质的模拟结果 | 第116-120页 |
| ·小结 | 第120-122页 |
| 4 生物转化法生产1,3-丙二醇和2,3-丁二醇的化学计量分析 | 第122-153页 |
| ·引言 | 第122-123页 |
| ·葡萄糖和甘油共底物代谢产1,3-PD的化学计量分析 | 第123-132页 |
| ·化学计量分析模型 | 第124-128页 |
| ·化学计量分析结果与讨论 | 第128-131页 |
| ·小结 | 第131-132页 |
| ·葡萄糖和甘油共底物产1,3-PD和2,3-BD的化学计量分析 | 第132-137页 |
| ·化学计量分析模型 | 第132-136页 |
| ·计量分析结果与讨论 | 第136-137页 |
| ·小结 | 第137页 |
| ·葡萄糖和木糖共底物代谢产2,3-BD和氢气的化学计量分析 | 第137-145页 |
| ·化学计量分析模型 | 第137-141页 |
| ·化学计量分析结果与讨论 | 第141-144页 |
| ·小结 | 第144-145页 |
| ·葡萄糖发酵生产氢气的化学计量分析 | 第145-152页 |
| ·化学计量分析模型 | 第145-148页 |
| ·化学计量分析结果与讨论 | 第148-152页 |
| ·小结 | 第152页 |
| ·本章小结 | 第152-153页 |
| 结论 | 第153-155页 |
| 展望 | 第155-156页 |
| 创新点 | 第156-157页 |
| 参考文献 | 第157-166页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第166-169页 |
| 致谢 | 第169-170页 |
| 作者简介 | 第170-172页 |