| 摘要 | 第10-13页 |
| ABSTRACT | 第13-16页 |
| 缩略词表 | 第17-18页 |
| 绪论 | 第18-19页 |
| 第一篇 文献综述 | 第19-65页 |
| 第一章 SARA模型的建立 | 第19-39页 |
| 1 SARA简介 | 第19-22页 |
| 1.1 SARA的定义 | 第19-20页 |
| 1.2 SARA相关炎症 | 第20-22页 |
| 1.2.1 蹄叶炎 | 第20页 |
| 1.2.2 乳房炎 | 第20-21页 |
| 1.2.3 脂肪肝 | 第21-22页 |
| 1.2.4 其他相关疾病 | 第22页 |
| 2 LPS简介 | 第22-24页 |
| 2.1 LPS的结构 | 第22-24页 |
| 2.2 LPS在天然免疫反应中的作用 | 第24页 |
| 3 肝脏在机体免疫反应中的作用 | 第24-26页 |
| 4 日粮模式与SARA之间的关系 | 第26-30页 |
| 4.1 物理有效中性洗涤纤维 | 第26-27页 |
| 4.2 饲料颗粒大小对SARA的影响 | 第27-28页 |
| 4.3 谷物饲料对SARA的影响 | 第28-30页 |
| 参考文献 | 第30-39页 |
| 第二章 炎性信号通路 | 第39-57页 |
| 1 NF-κB信号通路 | 第39-43页 |
| 1.1 NF-κB信号通路与机体炎症反应 | 第39-41页 |
| 1.2 TLRs的作用 | 第41-42页 |
| 1.3 NF-κB信号通路节点:TRAFs | 第42-43页 |
| 2 MAPK信号通路 | 第43-49页 |
| 2.1 p38 MAP激酶通路 | 第45-46页 |
| 2.2 ERK MAPKs通路 | 第46-47页 |
| 2.3 JNK MAPK通路 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-57页 |
| 第三章 日粮对反刍动物消化道内微生物组群的影响 | 第57-65页 |
| 1 反刍动物消化道微生物 | 第57-59页 |
| 1.1 OTUs概念 | 第57-58页 |
| 1.2 生物学指数 | 第58页 |
| 1.3 肠道微生物 | 第58-59页 |
| 2 高谷物日粮对牛消化道微生物的影响 | 第59-61页 |
| 2.1 瘤胃细菌种群的变化 | 第59-60页 |
| 2.2 瘤胃原生动物的变化 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 第二篇 试验研究 | 第65-151页 |
| 第四章 高精料日粮对奶牛肝脏的炎性损伤 | 第65-87页 |
| 1 材料与方法 | 第67-74页 |
| 1.1 主要试剂和设备 | 第67页 |
| 1.1.1 主要试剂 | 第67页 |
| 1.1.2 主要设备 | 第67页 |
| 1.2 试验动物与试验设计 | 第67-69页 |
| 1.3 样品采集 | 第69-70页 |
| 1.3.1 瘤胃样品采集 | 第69页 |
| 1.3.2 血液样品采集 | 第69页 |
| 1.3.3 肝脏样品采集 | 第69-70页 |
| 1.4 样品检测 | 第70-74页 |
| 1.4.1 血浆LPS浓度检测 | 第70页 |
| 1.4.2 血浆样品促炎性因子的浓度测定 | 第70页 |
| 1.4.3 肝脏组织切片 | 第70页 |
| 1.4.4 肝脏内免疫相关基因的mRNA表达 | 第70-71页 |
| 1.4.5 肝脏中NF-κB、p38和ERK蛋白表达 | 第71-74页 |
| 1.5 数据分析 | 第74页 |
| 2 结果与分析 | 第74-80页 |
| 2.1 瘤胃液pH值以及肝静脉、门静脉LPS浓度 | 第74页 |
| 2.2 肝脏的组织病理学变化 | 第74-75页 |
| 2.3 肝脏免疫相关基因的mRNA相对表达量 | 第75-77页 |
| 2.4 肝静脉、外周血中促炎性细胞因子的浓度 | 第77-78页 |
| 2.5 肝脏内NF-κB、ERK和p38 MAPK蛋白的活化情况 | 第78-79页 |
| 2.5.1 肝脏内NF-κB蛋白的活化 | 第78页 |
| 2.5.2 肝脏内p38、ERK MAPK蛋白的活化 | 第78-79页 |
| 2.6 门静脉LPS与肝脏p38、ERK的mRNA表达及p38蛋白表达之间的相关性分析 | 第79-80页 |
| 3 讨论 | 第80-82页 |
| 4 小结 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-87页 |
| 第五章 高精料日粮对奶牛瘤胃内容物中微生物区系的影响 | 第87-105页 |
| 1 材料与方法 | 第88-91页 |
| 1.1 主要试剂和设备 | 第88-89页 |
| 1.1.1 主要试剂 | 第88-89页 |
| 1.1.2 主要设备 | 第89页 |
| 1.2 试验动物和试验设计 | 第89页 |
| 1.3 样品采集 | 第89页 |
| 1.4 样品检测 | 第89-90页 |
| 1.4.1 DNA提取 | 第89页 |
| 1.4.2 PCR扩增 | 第89-90页 |
| 1.4.3 PCR产物的纯化 | 第90页 |
| 1.4.4 文库构建和上机测序 | 第90页 |
| 1.5 信息分析 | 第90-91页 |
| 1.5.1 测序数据处理 | 第90-91页 |
| 1.5.2 OTUs分析 | 第91页 |
| 1.5.3 物种属水平分析 | 第91页 |
| 1.5.4 样品复杂度分析(α多样性分析) | 第91页 |
| 1.5.5 多样本比较分析(β多样性分析) | 第91页 |
| 1.5.6 属水平组别差异比较 | 第91页 |
| 1.5.7 组间群落差异分析 | 第91页 |
| 2 结果与分析 | 第91-99页 |
| 2.1 瘤胃液和门静脉中的LPS含量 | 第91-92页 |
| 2.2 高精料日粮对瘤胃内容物微生物群落的影响 | 第92-99页 |
| 2.2.1 门、属水平上物种分类 | 第92-94页 |
| 2.2.2 属水平上的菌群差异比较 | 第94-95页 |
| 2.2.3 物种丰度聚类分析 | 第95-96页 |
| 2.2.4 微生物区系的多样性分析 | 第96-97页 |
| 2.2.5 主成分分析 | 第97页 |
| 2.2.6 两组间群落差异分析 | 第97-99页 |
| 3 讨论 | 第99-100页 |
| 4 小结 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-105页 |
| 第六章 日粮改变对奶山羊SARA的调控作用 | 第105-121页 |
| 1 材料与方法 | 第107-110页 |
| 1.1 主要试剂和设备 | 第107页 |
| 1.2 试验动物与试验设计 | 第107页 |
| 1.3 样品采集 | 第107-108页 |
| 1.4 样品检测 | 第108-110页 |
| 1.4.1 血浆LPS浓度检测 | 第108页 |
| 1.4.2 血浆样品促炎性因子的浓度测定 | 第108-109页 |
| 1.4.3 肝脏内免疫相关基因的mRNA表达 | 第109-110页 |
| 1.4.4 肝脏中NF-κB、p38和ERK蛋白表达 | 第110页 |
| 1.5 数据分析 | 第110页 |
| 2 结果与分析 | 第110-114页 |
| 2.1 瘤胃液pH值以及肝静脉、门静脉LPS浓度 | 第110页 |
| 2.2 肝脏免疫相关基因的mRNA相对表达量 | 第110-112页 |
| 2.3 外周血中促炎性细胞因子的浓度 | 第112页 |
| 2.4 肝脏内NF-κB、ERK和p38 MAPK蛋白的活化情况 | 第112-114页 |
| 2.4.1 肝脏内NF-κB的活化情况 | 第112-113页 |
| 2.4.2 肝脏内ERK、p38 MAPK蛋白的活化情况 | 第113-114页 |
| 2.5 门静脉LPS与肝脏内p38、ERK蛋白活化之间的相关性 | 第114页 |
| 3 讨论 | 第114-116页 |
| 4 小结 | 第116-117页 |
| 参考文献 | 第117-121页 |
| 第七章 酵母发酵产物对SARA状态下奶牛瘤胃、粪便中LPS浓度以及急性期反应的影响 | 第121-137页 |
| 1 材料与方法 | 第122-126页 |
| 1.1 主要试剂和设备 | 第122-123页 |
| 1.1.1 主要试剂 | 第122-123页 |
| 1.1.2 主要设备 | 第123页 |
| 1.2 试验动物与试验设计 | 第123-124页 |
| 1.3 样品采集 | 第124页 |
| 1.3.1 瘤胃液样品采集 | 第124页 |
| 1.3.2 粪便样品采集 | 第124页 |
| 1.3.3 血液样品采集 | 第124页 |
| 1.4 样品检测 | 第124-125页 |
| 1.4.1 瘤胃液和粪便样品LPS检测 | 第124-125页 |
| 1.4.2 外周血中LPS的检测 | 第125页 |
| 1.4.3 外周血中急性期蛋白的检测 | 第125页 |
| 1.5 数据分析 | 第125-126页 |
| 2 结果与分析 | 第126-130页 |
| 2.1 瘤胃液和粪便pH值 | 第126页 |
| 2.2 瘤胃液中LPS含量 | 第126-127页 |
| 2.3 粪便中LPS含量 | 第127页 |
| 2.4 外周血急性期蛋白的含量 | 第127-129页 |
| 2.4.1 外周血中SAA的含量 | 第127-128页 |
| 2.4.2 外周血中Hp的含量 | 第128-129页 |
| 2.4.3 外周血中LBP的含量 | 第129页 |
| 2.5 瘤胃LPS与粪便LPS、急性期蛋白之间的相关性 | 第129-130页 |
| 3 讨论 | 第130-132页 |
| 4 小结 | 第132-133页 |
| 参考文献 | 第133-137页 |
| 第八章 增加日粮中酵母发酵产物含量对SARA状态下奶牛急性期反应的影响 | 第137-151页 |
| 1 材料和方法 | 第138-139页 |
| 1.1 主要试剂和设备 | 第138-139页 |
| 1.2 试验动物与试验设计 | 第139页 |
| 1.3 样品采集 | 第139页 |
| 1.4 样品检测 | 第139页 |
| 1.5 数据分析 | 第139页 |
| 2 结果与分析 | 第139-144页 |
| 2.1 瘤胃液和粪便pH值 | 第139-140页 |
| 2.2 瘤胃液中LPS含量 | 第140-141页 |
| 2.3 粪便中LPS含量 | 第141页 |
| 2.4 外周血急性期蛋白的含量 | 第141-144页 |
| 2.4.1 外周血中SAA的含量 | 第141-142页 |
| 2.4.2 外周血中Hp的含量 | 第142-143页 |
| 2.4.3 外周血中LBP的含量 | 第143-144页 |
| 2.5 瘤胃LPS与粪便LPS、急性期蛋白之间的相关性 | 第144页 |
| 3 讨论 | 第144-146页 |
| 4 结论 | 第146-147页 |
| 参考文献 | 第147-151页 |
| 结论 | 第151-153页 |
| 致谢 | 第153-155页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第155-156页 |
