| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一章 绪论 | 第15-37页 |
| 1.1 分子标记技术的发展及其在保护遗传学中的应用 | 第15-29页 |
| 1.1.1 引言 | 第15页 |
| 1.1.2 分子标记技术的发展 | 第15-20页 |
| 1.1.3 群体基因组学的研究进展 | 第20-25页 |
| 1.1.4 分子标记技术在保护遗传学研究中的应用 | 第25-29页 |
| 1.2 松江鲈保护遗传学研究进展 | 第29-33页 |
| 1.2.1 松江鲈的分类地位及其生物学特征 | 第29-30页 |
| 1.2.2 松江鲈资源分布现状 | 第30-31页 |
| 1.2.3 松江鲈保护遗传学研究进展 | 第31-33页 |
| 1.3 本研究的目的及意义 | 第33-37页 |
| 1.3.1 研究的目的与意义 | 第33-35页 |
| 1.3.2 研究的思路 | 第35-37页 |
| 第二章 松江鲈遗传标记的开发 | 第37-65页 |
| 2.1 引言 | 第37页 |
| 2.2 松江鲈微卫星标记的开发 | 第37-52页 |
| 2.2.1 材料与方法 | 第37-44页 |
| 2.2.2 实验结果 | 第44-51页 |
| 2.2.3 讨论 | 第51-52页 |
| 2.3 松江鲈基因组SNP标记的开发 | 第52-62页 |
| 2.3.1 材料与方法 | 第52-56页 |
| 2.3.2 实验结果 | 第56-60页 |
| 2.3.3 讨论 | 第60-62页 |
| 2.4 本章小结 | 第62-65页 |
| 第三章 基于微卫星标记的松江鲈保护遗传学研究 | 第65-81页 |
| 3.1 引言 | 第65-66页 |
| 3.2 材料与方法 | 第66-69页 |
| 3.3 实验结果 | 第69-76页 |
| 3.3.1 遗传多样性分析 | 第69-71页 |
| 3.3.2 遗传结构分析 | 第71-74页 |
| 3.3.3 基因交流分析 | 第74-75页 |
| 3.3.4 有效群体大小估算 | 第75-76页 |
| 3.4 讨论 | 第76-79页 |
| 3.4.1 松江鲈群体遗传多样性 | 第76-77页 |
| 3.4.2 松江鲈群体遗传结构 | 第77-78页 |
| 3.4.3 松江鲈保护管理建议 | 第78-79页 |
| 3.5 本章小结 | 第79-81页 |
| 第四章 基于群体基因组学的松江鲈保护遗传学研究 | 第81-115页 |
| 4.1 引言 | 第81-83页 |
| 4.2 材料与方法 | 第83-89页 |
| 4.2.1 样品采集与DNA提取 | 第83页 |
| 4.2.2 RAD文库构建与上机测序 | 第83-84页 |
| 4.2.3 数据获取与原始数据处理 | 第84-85页 |
| 4.2.4 基于多个体的参考序列组装 | 第85页 |
| 4.2.5 序列比对与SNP提取 | 第85页 |
| 4.2.6 SNP位点质量过滤 | 第85-86页 |
| 4.2.7 群体遗传学分析 | 第86-88页 |
| 4.2.8 本地适应性分析 | 第88-89页 |
| 4.3 实验结果 | 第89-109页 |
| 4.3.1 RAD建库测序及数据质控 | 第89-94页 |
| 4.3.2 基于多个体参考序列的组装 | 第94-95页 |
| 4.3.3 SNP位点的筛选 | 第95页 |
| 4.3.4 遗传结构分析 | 第95-101页 |
| 4.3.5 本地适应性分析 | 第101-109页 |
| 4.4 讨论 | 第109-114页 |
| 4.4.1 松江鲈群体遗传结构 | 第109-111页 |
| 4.4.2 松江鲈本地适应性 | 第111-113页 |
| 4.4.3 松江鲈保护管理建议 | 第113-114页 |
| 4.5 本章小结 | 第114-115页 |
| 第五章 总结与展望 | 第115-119页 |
| 5.1 研究总结 | 第115-116页 |
| 5.2 主要创新点 | 第116页 |
| 5.3 研究不足之处 | 第116-117页 |
| 5.4 展望 | 第117-119页 |
| 参考文献 | 第119-135页 |
| 致谢 | 第135-137页 |
| 作者简历及博士期间已发表和完成论文情况 | 第137页 |