| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-18页 |
| ·蛋白质分子三维几何结构 | 第9-13页 |
| ·蛋白质分子四级结构 | 第9-10页 |
| ·蛋白质分子结构获取方法 | 第10-11页 |
| ·蛋白质分子三维结构表示方法 | 第11-13页 |
| ·蛋白质分子数据库 | 第13页 |
| ·蛋白质分子的静电势 | 第13-17页 |
| ·静电势和静电势能的定义 | 第14-15页 |
| ·蛋白质分子静电势的计算 | 第15-17页 |
| ·本文的主要工作 | 第17页 |
| ·本文的章节安排 | 第17-18页 |
| 第二章 蛋白质分子表面原子的提取及应用 | 第18-38页 |
| ·引言 | 第18页 |
| ·蛋白质分子表面原子的定义和拓扑结构 | 第18-21页 |
| ·蛋白质分子表面的定义 | 第18-19页 |
| ·蛋白质分子表面原子的定义 | 第19页 |
| ·拓扑结构 | 第19-21页 |
| ·蛋白质分子表面原子图(SAG-surface atoms graphic) | 第21-25页 |
| ·分子表面原子图SAG的定义 | 第21-22页 |
| ·分子表面原子图SAG的构建 | 第22-24页 |
| ·分子表面原子图SAG的搜索 | 第24-25页 |
| ·分子内空腔例子的展示 | 第25-27页 |
| ·实验结果 | 第27-28页 |
| ·表面原子在构建分子表面中的应用 | 第28-29页 |
| ·表面原子在分子静电势场分析中的应用 | 第29-30页 |
| ·表面原子在蛋白质对生物材料表面吸附中的应用 | 第30-37页 |
| ·马尔科夫链Monte Carlo(MCMC)简介 | 第31-34页 |
| ·搜索蛋白质分子吸附取向的方法 | 第34-35页 |
| ·蛋白质分子吸附取向的实验结果 | 第35-37页 |
| ·讨论 | 第37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第三章 蛋白质分子结合位点静电势特征分析 | 第38-56页 |
| ·引言 | 第38页 |
| ·静电势的应用 | 第38-40页 |
| ·本文方法 | 第40-43页 |
| ·实验结果 | 第43-54页 |
| ·例子展示 | 第44-52页 |
| ·protein-DNA实验结果 | 第52-54页 |
| ·讨论 | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第四章 总结与展望 | 第56-58页 |
| ·总结 | 第56-57页 |
| ·展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 致谢 | 第62页 |