芸薹根肿菌遗传多样性研究
摘要 | 第10-12页 |
Abstract | 第12-13页 |
前言 | 第14-16页 |
1 文献综述 | 第16-28页 |
1.1 十字花科根肿病 | 第16-18页 |
1.1.1 根肿菌的分类地位及形态 | 第16页 |
1.1.2 根肿菌的生活史 | 第16-17页 |
1.1.3 根肿病发病症状 | 第17页 |
1.1.4 根肿病的发病条件 | 第17-18页 |
1.2 根肿菌的检测 | 第18-20页 |
1.2.1 植株诱导法 | 第18-19页 |
1.2.2 荧光显微镜技术 | 第19页 |
1.2.3 血清学分析法 | 第19页 |
1.2.4 PCR技术 | 第19-20页 |
1.3 芸薹根肿菌的生理小种鉴定系统 | 第20-23页 |
1.3.1 Williams生理小种鉴别系统 | 第20-21页 |
1.3.2 ECD鉴别系统 | 第21-22页 |
1.3.3 Somé鉴别系统 | 第22-23页 |
1.3.4 Kuginuki鉴别系统 | 第23页 |
1.4 根肿菌鉴定接种方法 | 第23-24页 |
1.4.1 蘸根法 | 第23页 |
1.4.2 插入法 | 第23页 |
1.4.3 注射法 | 第23-24页 |
1.4.4 菌土法 | 第24页 |
1.5 分子标记技术在微生物遗传多样性中的应用 | 第24-27页 |
1.5.1 RFLP标记技术 | 第24-25页 |
1.5.2 RAPD标记技术 | 第25页 |
1.5.3 SSR标记技术 | 第25-26页 |
1.5.4 AFLP标记技术 | 第26-27页 |
1.6 本研究的目的与意义 | 第27-28页 |
2 材料与方法 | 第28-36页 |
2.1 芸薹根肿菌生理小种的鉴定 | 第28-31页 |
2.1.1 试验材料 | 第28-29页 |
2.1.2 接种菌液的制备 | 第29页 |
2.1.3 接种方法 | 第29-30页 |
2.1.4 病情调查 | 第30页 |
2.1.5 不同生理小种的划分标准 | 第30-31页 |
2.2 芸薹根肿菌基因组SSR序列的分布 | 第31页 |
2.2.1 试验材料 | 第31页 |
2.2.2 基因组SSR序列的检索 | 第31页 |
2.3 芸薹根肿菌的遗传多样性 | 第31-36页 |
2.3.1 试验材料 | 第31-32页 |
2.3.2 根肿菌休眠孢子的分离和提纯 | 第32页 |
2.3.3 芸薹根肿菌DNA的提取 | 第32页 |
2.3.4 基因组SSR引物设计 | 第32-33页 |
2.3.5 根肿菌SSR引物的筛选 | 第33页 |
2.3.6 PCR扩增 | 第33页 |
2.3.7 琼脂糖凝胶凝胶电泳 | 第33-34页 |
2.3.8 聚丙烯酰氨凝胶电泳 | 第34-35页 |
2.3.9 聚类分析 | 第35-36页 |
3 结果与分析 | 第36-49页 |
3.1 芸薹根肿菌生理小种的鉴定 | 第36-40页 |
3.1.1 生理小种鉴定结果 | 第36-38页 |
3.1.2 根肿菌生理小种在不同地区的分布情况 | 第38-39页 |
3.1.3 不同寄主品种的根肿菌生理小种分化 | 第39-40页 |
3.2 芸薹根肿菌基因组SSR序列的分布 | 第40-44页 |
3.2.1 基因组SSR序列的检索 | 第40-41页 |
3.2.2 根肿菌SSR重复基元 | 第41-43页 |
3.2.3 根肿菌SSR各重复类型的分布特点 | 第43-44页 |
3.3 芸薹根肿菌的遗传多样性 | 第44-49页 |
3.3.1 根肿菌DNA提取结果 | 第44页 |
3.3.2 基因组引物设计 | 第44页 |
3.3.3 SSR引物的筛选 | 第44-47页 |
3.3.4 SSR引物的PCR扩增结果 | 第47页 |
3.3.5 芸薹根肿菌的遗传多样性分析 | 第47-49页 |
4 讨论 | 第49-53页 |
4.1 芸薹根肿菌生理小种的鉴定 | 第49-50页 |
4.2 芸薹根肿菌基因组SSR序列的分布 | 第50页 |
4.3 芸薹根肿菌遗传多样性 | 第50-52页 |
4.3.1 SSR引物筛选和扩增结果 | 第50-51页 |
4.3.2 聚类分析结果 | 第51-52页 |
4.4 SSR分子标记技术在根肿菌上的应用展望 | 第52-53页 |
5 结论 | 第53-54页 |
参考文献 | 第54-60页 |
致谢 | 第60-61页 |