| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 符号说明 | 第7-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-22页 |
| 1 獭兔品种简介 | 第11-13页 |
| 1.1 獭兔的起源介绍 | 第11页 |
| 1.2 獭兔毛皮的特点 | 第11-12页 |
| 1.3 我国的獭兔品系 | 第12页 |
| 1.4 我国獭兔业发展现状 | 第12-13页 |
| 1.5 獭兔毛色研究概况 | 第13页 |
| 2 转录组测序技术简介 | 第13-17页 |
| 2.1 转录组测序的概念及流程 | 第14-15页 |
| 2.2 转录组测序技术平台 | 第15-16页 |
| 2.3 转录组测序的应用 | 第16-17页 |
| 3 单核苷酸多态性概述 | 第17-21页 |
| 3.1 SNPs的概念及分类 | 第18页 |
| 3.2 SNPs的特点及优势 | 第18-19页 |
| 3.3 SNPs的研究手段 | 第19-21页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 利用转录组技术筛选獭兔青紫蓝毛色相关差异表达基因 | 第22-43页 |
| 1 材料和方法 | 第22-28页 |
| 1.1 试验材料 | 第22-25页 |
| 1.2 RNA提取和纯化 | 第25页 |
| 1.3 转录组测序 | 第25-27页 |
| 1.4 荧光定量PCR验证 | 第27-28页 |
| 2 结果与分析 | 第28-39页 |
| 2.1 RNA提取及质量检测 | 第28-29页 |
| 2.2 原始数据的基本分析 | 第29-31页 |
| 2.3 测序饱和度质量评价 | 第31页 |
| 2.4 Reads在参考基因组中的分布 | 第31-32页 |
| 2.5 差异表达基因的筛选 | 第32-36页 |
| 2.6 DEGs的功能注释 | 第36-38页 |
| 2.7 基因结构细化和新转录本的预测 | 第38页 |
| 2.8 可变剪接和SNP预测 | 第38-39页 |
| 2.9 荧光定量PCR验证 | 第39页 |
| 3 讨论 | 第39-43页 |
| 第三章 Tyr基因外显子多态性检测及生物信息学分析 | 第43-55页 |
| 1 材料与方法 | 第43-47页 |
| 1.1 试验材料 | 第43页 |
| 1.2 主要仪器 | 第43页 |
| 1.3 主要试剂及其配制 | 第43-44页 |
| 1.4 DNA提取和检测 | 第44页 |
| 1.5 引物设计 | 第44-45页 |
| 1.6 引物稀释 | 第45页 |
| 1.7 PCR扩增 | 第45-46页 |
| 1.8 PCR产物检测 | 第46页 |
| 1.9 PCR-SSCP检测 | 第46页 |
| 1.10 数据处理 | 第46页 |
| 1.11 Tyr基因序列分析 | 第46页 |
| 1.12 TYR蛋白结构预测 | 第46-47页 |
| 2 结果与分析 | 第47-53页 |
| 2.1 Tyr基因各外显子的扩增结果 | 第47-48页 |
| 2.2 Tyr基因多态序列分析 | 第48-49页 |
| 2.3 Tyr基因外显子2遗传多样性分析 | 第49页 |
| 2.4 Tyr基因外显子3遗传多样性分析 | 第49-50页 |
| 2.5 Tyr基因SNPs的生物信息学分析 | 第50-53页 |
| 3 讨论 | 第53-55页 |
| 第四章 Tyrp1基因外显子多态检测及内含子TA克隆 | 第55-64页 |
| 1 材料与方法 | 第55-59页 |
| 1.1 试验动物 | 第55页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第55-56页 |
| 1.3 引物设计 | 第56-57页 |
| 1.4 Tyrp1基因外显子PCR-SSCP检测 | 第57页 |
| 1.5 Tyrp1基因内含子TA克隆 | 第57-59页 |
| 2 结果与分析 | 第59-62页 |
| 2.1 Tyrp1基因各外显子的扩增结果 | 第59页 |
| 2.2 Tyrp1基因多态序列分析 | 第59-60页 |
| 2.3 Tyrp1基因外显子2遗传多样性分析 | 第60页 |
| 2.4 Tyrp1基因内含子TA克隆 | 第60-62页 |
| 3 讨论 | 第62-64页 |
| 全文结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 攻读学位期间发表和参与发表的学术论文目录 | 第78-79页 |
