| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第15-31页 |
| 1.1 新疆棉花黄萎病的发生危害 | 第15-16页 |
| 1.2 棉花黄萎病菌的致病力分化及遗传变异 | 第16-19页 |
| 1.2.1 棉花黄萎病菌的致病力分化 | 第16-18页 |
| 1.2.2 棉花黄萎病菌的遗传变异 | 第18-19页 |
| 1.3 土壤中棉花黄萎病菌的微菌核动态 | 第19-20页 |
| 1.3.1 土壤中微菌核的分布及影响因素 | 第19页 |
| 1.3.2 减少微菌核数量的措施 | 第19-20页 |
| 1.4 影响土壤中微生物群落特征的因素 | 第20-25页 |
| 1.4.1 作物品种 | 第21-22页 |
| 1.4.2 长年连作 | 第22页 |
| 1.4.3 栽培模式 | 第22-23页 |
| 1.4.4 转基因作物 | 第23页 |
| 1.4.5 土壤肥力 | 第23-24页 |
| 1.4.6 土壤改良剂 | 第24页 |
| 1.4.7 其它因素 | 第24-25页 |
| 1.5 影响植物根部微生物群落特征的因素 | 第25-28页 |
| 1.5.1 生物入侵 | 第25-26页 |
| 1.5.2 植物根系分泌物的作用 | 第26-27页 |
| 1.5.3 内生微生物多样性变化 | 第27-28页 |
| 1.6 微生物多样性研究方法 | 第28页 |
| 1.7 研究目的与意义 | 第28-29页 |
| 1.8 研究内容 | 第29-30页 |
| 1.8.1 新疆棉花黄萎病发生危害调查 | 第29页 |
| 1.8.2 棉花黄萎病田土壤中细菌群落多样性 | 第29页 |
| 1.8.3 棉花黄萎病田土壤中真菌群落多样性 | 第29页 |
| 1.8.4 棉花黄萎病株根部内生细菌群落多样性 | 第29-30页 |
| 1.9 技术路线 | 第30-31页 |
| 第二章 新疆棉花黄萎病的发生、病原菌鉴定及ISSR分析 | 第31-47页 |
| 2.1 试验材料 | 第31-32页 |
| 2.1.1 供试菌株 | 第31页 |
| 2.1.2 供试引物 | 第31页 |
| 2.1.3 培养基 | 第31页 |
| 2.1.4 试剂及仪器 | 第31-32页 |
| 2.2 试验方法 | 第32-34页 |
| 2.2.1 阿拉尔棉花黄萎病发生规律调查 | 第32页 |
| 2.2.2 新疆主要棉区棉花黄萎病发生调查 | 第32-33页 |
| 2.2.3 新疆棉花黄萎病菌培养性状观察与分子检测 | 第33-34页 |
| 2.2.4 新疆棉花黄萎病菌的ISSR分析 | 第34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-46页 |
| 2.3.1 新疆主要植棉地区棉花黄萎病发生情况 | 第34-36页 |
| 2.3.2 阿克苏地区棉花黄萎病发生规律 | 第36-37页 |
| 2.3.3 新疆棉花黄萎病菌培养性状与分子检测 | 第37-44页 |
| 2.3.4 新疆棉花黄萎病菌遗传变异的ISSR分析 | 第44-46页 |
| 2.4 小结 | 第46-47页 |
| 第三章 棉花黄萎病田土壤中细菌群落多样性 | 第47-67页 |
| 3.1 试验材料 | 第47-49页 |
| 3.1.1 供试菌株 | 第47页 |
| 3.1.2 供试土壤 | 第47-49页 |
| 3.1.3 培养基 | 第49页 |
| 3.1.4 试剂及仪器 | 第49页 |
| 3.2 试验方法 | 第49-51页 |
| 3.2.1 土壤养分分析 | 第49页 |
| 3.2.2 棉花黄萎病菌发酵上清液对AL7生长的影响 | 第49-50页 |
| 3.2.3 土壤中细菌、放线菌数量检测 | 第50页 |
| 3.2.4 土壤样品总DNA的提取与扩增 | 第50-51页 |
| 3.2.5 数据分析 | 第51页 |
| 3.3 结果与分析 | 第51-66页 |
| 3.3.1 土壤养分化验分析 | 第51-52页 |
| 3.3.2 棉花黄萎病菌发酵液对AL7生长的影响 | 第52页 |
| 3.3.3 土壤中可培养微生物数量 | 第52-53页 |
| 3.3.4 土壤养分与细菌、放线菌的相关性分析 | 第53-54页 |
| 3.3.5 土壤中细菌群落的Alpha多样性分析 | 第54-55页 |
| 3.3.6 土壤中细菌群落属分类水平物种分布 | 第55-57页 |
| 3.3.7 土壤中细菌群落的Beta多样性分析 | 第57-60页 |
| 3.3.8 土壤中细菌群落与环境因素的RDA分析 | 第60-61页 |
| 3.3.9 土壤中细菌群落的丰度显著差异分析 | 第61-62页 |
| 3.3.10 土壤中细菌功能基因丰度差异分析 | 第62-66页 |
| 3.4 小结 | 第66-67页 |
| 第四章 棉花黄萎病田土壤中真菌群落多样性 | 第67-85页 |
| 4.1 试验材料 | 第67-68页 |
| 4.1.1 供试品种 | 第67页 |
| 4.1.2 供试土壤 | 第67页 |
| 4.1.3 培养基 | 第67-68页 |
| 4.1.4 试剂及仪器 | 第68页 |
| 4.2 试验方法 | 第68-69页 |
| 4.2.1 土壤中真菌数量检测 | 第68页 |
| 4.2.2 土壤中棉花黄萎病菌微菌核分离 | 第68页 |
| 4.2.3 土壤样品总DNA的提取、扩增和高通量测序 | 第68页 |
| 4.2.4 数据分析 | 第68-69页 |
| 4.3 结果与分析 | 第69-83页 |
| 4.3.1 土壤中的可培养真菌数量 | 第69页 |
| 4.3.2 土壤中棉花黄萎病菌的微菌核数量分析 | 第69-71页 |
| 4.3.3 可培养微生物的相关性分析 | 第71-73页 |
| 4.3.4 土壤中细菌群落的Alpha多样性分析 | 第73-75页 |
| 4.3.5 不同处理组在各水平上优势真菌菌群的差异 | 第75-77页 |
| 4.3.6 土壤中真菌群落的Beta多样性分析 | 第77-80页 |
| 4.3.7 土壤中真菌群落与环境因素的RDA分析 | 第80-82页 |
| 4.3.8 土壤中真菌群落的丰度显著差异 | 第82-83页 |
| 4.4 小结 | 第83-85页 |
| 第五章 棉花黄萎病株根部内生细菌群落多样性 | 第85-97页 |
| 5.1 试验材料 | 第85-86页 |
| 5.1.1 供试品种 | 第85-86页 |
| 5.1.2 试剂及仪器 | 第86页 |
| 5.2 试验方法 | 第86-87页 |
| 5.2.1 取样方法 | 第86页 |
| 5.2.2 基因组DNA的提取、扩增 | 第86页 |
| 5.2.3 数据分析 | 第86-87页 |
| 5.3 结果与分析 | 第87-96页 |
| 5.3.1 棉花根部内生细菌群落的Alpha多样性分析 | 第87-88页 |
| 5.3.2 棉花根部内生细菌群落组成 | 第88-92页 |
| 5.3.3 棉花根部内生细菌群落的Beta多样性分析 | 第92-94页 |
| 5.3.4 棉花根部内生细菌群落与品种抗性的RDA分析 | 第94-95页 |
| 5.3.5 棉花根部内生细菌群落的显著差异分析 | 第95-96页 |
| 5.4 小结 | 第96-97页 |
| 第六章 结论与讨论 | 第97-103页 |
| 6.1 结论 | 第97页 |
| 6.2 讨论 | 第97-101页 |
| 6.2.1 新疆棉花黄萎病的发生及其病原菌分子鉴定与遗传变异 | 第97-98页 |
| 6.2.2 棉花黄萎病田土壤中可培养微生物多样性 | 第98-99页 |
| 6.2.3 棉花黄萎病田土壤中微生物多样性的高通量测序分析 | 第99-100页 |
| 6.2.4 棉花黄萎病株根部内生细菌多样性 | 第100-101页 |
| 6.3 展望 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-115页 |
| 附图 | 第115-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 作者简介 | 第117页 |
