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苹果冷胁迫下差异表达基因的筛选及新抗逆基因MdTLP7的功能鉴定

中文摘要第8-10页
Abstract第10-12页
1 前言第13-25页
    1.1 苹果概述第13页
    1.2 植物抗逆性研究进展第13-18页
        1.2.1 植物抗寒性的生理基础第13-16页
            1.2.1.1 细胞膜与植物抗寒性的关系第14页
            1.2.1.2 渗透调节物质与植物抗寒性的关系第14-15页
            1.2.1.3 酶系统与植物抗寒性的关系第15-16页
            1.2.1.4 激素与植物抗寒性的关系第16页
        1.2.2 植物抗寒性的分子机制及抗寒基因的研究第16-18页
            1.2.2.1 抗寒性分子机理第16-17页
            1.2.2.2 抗寒基因的研究第17-18页
    1.3 基因组学的研究方法第18-23页
        1.3.1 DNA微阵列或基因芯片技术第19页
        1.3.2 基因表达系列分析(SAGE)技术第19页
        1.3.3 大规模平行信号测序系统MPSS技术第19页
        1.3.4 Solexa测序第19-23页
            1.3.4.1 Solexa测序的基本原理第20页
            1.3.4.2 Solexa测序的基本流程第20-22页
            1.3.4.3 Solexa测序的应用第22-23页
    1.4 TLP在植物中的研究进展第23-24页
        1.4.1 Tubby家族的成员及其分布第23-24页
        1.4.2 TLP家族蛋白质的功能第24页
    1.5 本实验的目的意义第24-25页
2 材料与方法第25-41页
    2.1 实验材料第25-27页
        2.1.1 植物材料第25页
        2.1.2 材料的冷处理第25页
        2.1.3 菌株与质粒第25页
        2.1.4 酶与各种试剂第25页
        2.1.5 实验器材第25-26页
        2.1.6 引物第26-27页
        2.1.7 软件和网络资源第27页
    2.2 主要试剂的配制第27-29页
        2.2.1 实验相关试剂溶液的配制第27-28页
            2.2.1.1 CTAB法提取植物RNA提取液的配置第27-28页
            2.2.1.2 制备感受态所需试剂的配制第28页
            2.2.1.3 50×TAE缓冲液的配制第28页
            2.2.1.4 MS培养基母液的配置第28页
        2.2.2 实验所需培养基的配置第28-29页
            2.2.2.1 MS基本培养基第28-29页
            2.2.2.2 LB基本培养基第29页
    2.3 实验方法第29-41页
        2.3.1 苹果M.26和Gala组培苗生理指标测定第29-30页
            2.3.1.1 相对电导率的测定第29页
            2.3.1.2 MDA含量测定第29-30页
        2.3.2 Solexa测序流程第30页
        2.3.3 数据统计分析第30-33页
            2.3.3.1 原始数据处理与统计第30-31页
            2.3.3.2 标签的基因注释第31页
            2.3.3.3 差异表达基因的筛选第31-32页
            2.3.3.4 Gene Ontology功能显著性富集分析第32页
            2.3.3.5 Pathway显著性富集分析第32-33页
        2.3.4 实时定量PCR第33-34页
        2.3.5 苹果MdTLP7基因全长及截短体/突变体的克隆与序列测定第34-38页
            2.3.5.1 苹果MdTLP7基因全长及四种截短体/突变体的设计第34页
            2.3.5.2 苹果MdTLP7基因的生物信息学分析第34页
            2.3.5.3 苹果叶片总RNA的提取第34-35页
            2.3.5.4 RNA反转录第35页
            2.3.5.5 PCR扩增第35-36页
            2.3.5.6 PCR扩增产物的胶回收第36页
            2.3.5.7 胶回收产物与pMD18-Tsimple载体连接第36-37页
            2.3.5.8 大肠杆菌感受态DHB4的制备第37页
            2.3.5.9 连接产物转化感受态DHB4细胞第37页
            2.3.5.10 阳性克隆的筛选第37-38页
        2.3.6 原核表达载体的构建第38-39页
            2.3.6.1 试剂盒小量碱法提取质粒DNA第38-39页
            2.3.6.2 目的片段和表达载体pET-30a(+)的双酶切第39页
            2.3.6.3 目的片段与质粒酶切胶回收产物连接第39页
        2.3.7 E.coli Rosetta原核表达的诱导第39-41页
3 结果与分析第41-57页
    3.1 M.26具有较强的抗寒能力第41-42页
        3.1.1 低温对苹果不同品种叶片细胞膜相对电导率的影响第41页
        3.1.2 低温对苹果不同品种叶片中MDA含量的影响第41-42页
    3.2 Solexa测序数据的统计及基因注释第42-43页
    3.3 差异基因的筛选第43-46页
    3.4 GO功能分类和KEGG Pathway显著性分析第46-47页
    3.5 qRT-PCR对测序结果的验证第47-49页
    3.6 苹果MdTLP7基因全长的克隆和结构特征第49-51页
        3.6.1 苹果MdTLP7基因全长的克隆第49-50页
        3.6.2 苹果MdTLP7蛋白Tubby结构域的结构特征第50-51页
    3.7 MdTLP7的表达在原核系统逆境胁迫中的作用第51-53页
    3.8 MdTLP7蛋白中发挥抗逆功能的区域第53-57页
4 讨论第57-60页
5 结论第60-61页
参考文献第61-66页
致谢第66-67页
攻读学位期间发表论文情况第67页

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