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分子对接构象搜索优化策略与算法研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第10-16页
    1.1 研究背景及意义第10-12页
    1.2 国内外研究现状第12-13页
    1.3 主要研究内容第13-14页
    1.4 本文组织结构第14-16页
第二章 相关研究理论第16-27页
    2.1 分子对接第16-17页
        2.1.1 分子对接原理第16页
        2.1.2 分子对接分类第16-17页
        2.1.3 主要研究问题第17页
    2.2 遗传算法第17-22页
        2.2.1 算法概要第17-19页
        2.2.2 运算流程第19页
        2.2.3 基本实现技术第19-22页
    2.3 拉马克学习机制第22-24页
    2.4 班德文效应第24-25页
    2.5 信息熵第25-26页
    2.6 本章小结第26-27页
第三章 分子对接数学模型第27-34页
    3.1 互补匹配原则第27-28页
    3.2 数学模型第28-33页
        3.2.1 打分函数第29-31页
        3.2.2 构象搜索算法第31-33页
    3.3 本章小结第33-34页
第四章 基于信息熵的改进拉马克算法及其在分子对接模型优化中的应用第34-55页
    4.1 拉马克遗传算法第34页
    4.2 分子对接模型第34-36页
        4.2.1 数学模型第34-35页
        4.2.2 模型转化第35-36页
    4.3 基于信息熵的多种群拉马克遗传算法第36-44页
        4.3.1 拉马克遗传算法运算流程第36-37页
        4.3.2 算法改进第37-44页
    4.4 仿真实验第44-54页
        4.4.1 实验目的第44页
        4.4.2 PDB蛋白分子文件结构第44页
        4.4.3 仿真程序第44-49页
        4.4.4 实验环境及参数设置第49页
        4.4.5 结果分析第49-54页
    4.5 本章小结第54-55页
第五章 基于拉马克-班德文混合学习机制的分子对接模型第55-74页
    5.1 拉马克学习与班德文学习两种机制的对比第55-56页
    5.2 拉马克学习、班德文效应的结合方法第56-58页
    5.3 算法流程第58-61页
    5.4 仿真实验第61-72页
        5.4.1 实验目的第61页
        5.4.2 仿真程序第61-63页
        5.4.3 实验环境及参数设置第63页
        5.4.4 结果分析第63-72页
    5.5 本章小结第72-74页
第六章 总结与展望第74-76页
    6.1 工作总结第74-75页
    6.2 进一步研究方向第75-76页
致谢第76-77页
参考文献第77-82页

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