| 内容摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 研究综述 | 第15-31页 |
| 第一节 肝细胞癌研究现状 | 第15-20页 |
| 第二节 肝细胞癌肿瘤标志物研究进展 | 第20-23页 |
| 第三节 长链非编码RNA在肝细胞癌研究中的进展 | 第23-26页 |
| 第四节 高通量测序技术 | 第26-29页 |
| 第五节 本文研究思路 | 第29-31页 |
| 第二章 长链非编码RNA在肝细胞癌中的预后作用 | 第31-62页 |
| 第一节 研究背景 | 第31-36页 |
| 第二节 材料和方法 | 第36-40页 |
| 2.2.1 实验数据的获得 | 第36页 |
| 2.2.2 lncRNA挖掘及预处理 | 第36页 |
| 2.2.3 lncRNA筛选 | 第36-37页 |
| 2.2.4 模型建立 | 第37页 |
| 2.2.5 测试集与验证集数据处理 | 第37-38页 |
| 2.2.6 KM分析 | 第38页 |
| 2.2.7 病例筛选 | 第38页 |
| 2.2.8 比较分析 | 第38-39页 |
| 2.2.9 相关性分析 | 第39页 |
| 2.2.10 功能富集分析 | 第39-40页 |
| 第三节 结果 | 第40-56页 |
| 2.3.1 病例信息统计 | 第40-41页 |
| 2.3.2 lncRNA组合预测模型 | 第41-42页 |
| 2.3.3 训练集病人风险值 | 第42-43页 |
| 2.3.4 KM分析 | 第43-44页 |
| 2.3.5 训练集ROC分析 | 第44-45页 |
| 2.3.6 测试集、TCGA数据集与验证集生存曲线 | 第45-47页 |
| 2.3.7 重新分组TCGA病例信息统计 | 第47-48页 |
| 2.3.8 多因素Cox回归分析 | 第48-49页 |
| 2.3.9 各病理因素对风险值模型的影响 | 第49-54页 |
| 2.3.10 功能注释及富集分析 | 第54-55页 |
| 2.3.11 预后lncRNA相关KEGG通路 | 第55-56页 |
| 第四节 讨论 | 第56-62页 |
| 第三章 肝细胞癌进展与长链非编码RNA功能模块有关 | 第62-78页 |
| 第一节 研究背景 | 第62-65页 |
| 第二节 材料和方法 | 第65-67页 |
| 3.2.1 数据下载及预处理 | 第65页 |
| 3.2.2 差异lncRNA与mRNA筛选与相关性分析 | 第65页 |
| 3.2.3 lncRNA-PCG共表达网络构建 | 第65-66页 |
| 3.2.4 lncRNA功能模块挖掘 | 第66页 |
| 3.2.5 功能模块注释 | 第66-67页 |
| 第三节 结果 | 第67-76页 |
| 3.3.1 肝细胞癌不同阶段差异表达lncRNA与PCG | 第67-70页 |
| 3.3.2 肝细胞癌分期特异性lncRNA-PCG网络 | 第70-71页 |
| 3.3.3 特定时期lncRNA功能模块挖掘 | 第71-72页 |
| 3.3.4 共表达模块功能分析 | 第72-76页 |
| 第四节 讨论 | 第76-78页 |
| 第四章 病毒整合影响肝癌中长链非编码RNA调控 | 第78-92页 |
| 第一节 研究背景 | 第78-80页 |
| 第二节 材料与方法 | 第80-83页 |
| 4.2.1 数据收集 | 第80-81页 |
| 4.2.2 HBV整合位点统计 | 第81页 |
| 4.2.3 lncRNA注释 | 第81页 |
| 4.2.4 整合lncRNA差异性分析 | 第81-82页 |
| 4.2.5 特异性HBV易感型lncRNA相关性分析 | 第82页 |
| 4.2.6 功能注释 | 第82-83页 |
| 第三节 结果 | 第83-90页 |
| 4.3.1 数据统计 | 第83页 |
| 4.3.2 整合位点分布 | 第83-85页 |
| 4.3.3 整合相关lncRNA注释 | 第85-87页 |
| 4.3.4 特异性HBV易感型lncRNA功能注释 | 第87-90页 |
| 第四节 讨论 | 第90-92页 |
| 第五章 疾病长链非编码RNA数据库 | 第92-110页 |
| 第一节 研究背景 | 第92-94页 |
| 第二节 材料和方法 | 第94-98页 |
| 5.2.1 癌症相关lncRNA和circularRNA的文献检索 | 第94页 |
| 5.2.2 文献筛选标准及记录信息 | 第94-95页 |
| 5.2.3 疾病分类信息获取 | 第95页 |
| 5.2.4 可靠性评分标准 | 第95-96页 |
| 5.2.5 相关性分析 | 第96页 |
| 5.2.6 数据库构建和网页设计 | 第96-98页 |
| 第三节 结果 | 第98-109页 |
| 5.3.1 LncRNADiseasev2.0统计信息 | 第98-99页 |
| 5.3.2 数据库主要功能之主页 | 第99-100页 |
| 5.3.3 数据库主要功能之检索 | 第100-102页 |
| 5.3.4 数据库主要功能之浏览 | 第102-104页 |
| 5.3.5 数据库主要功能之详细信息 | 第104-106页 |
| 5.3.6 数据库主要功能之下载与上传 | 第106-109页 |
| 第四节 讨论 | 第109-110页 |
| 第六章 结论与展望 | 第110-114页 |
| 第一节 结论 | 第110-113页 |
| 第二节 展望 | 第113-114页 |
| 附录一 | 第114-121页 |
| 附录二 | 第121-122页 |
| 参考文献 | 第122-132页 |
| 后记 | 第132页 |
