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核酸与蛋白质相互作用的AFM单分子力谱研究

提要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 前言第13-45页
    1.1 基于原子力显微镜技术的单分子力谱第13-21页
        1.1.1 单分子力谱仪的原理第13-15页
        1.1.2 测量过程及力谱的获得第15-18页
        1.1.3 单链拉伸实验及判断标准第18-20页
            1.1.3.1 单链拉伸的实验第18-19页
            1.1.3.2 单链拉伸的判断标准第19-20页
        1.1.4 动态力学谱第20-21页
    1.2 单分子力谱在生物领域中的应用第21-38页
        1.2.1 DNA分子的拉伸与操纵第22-27页
            1.2.1.1 长链DNA拉伸的力学指纹谱第22-23页
            1.2.1.2 以长链DNA为探针研究DNA与DNA结合分子的相互作用第23-25页
                1.2.1.2.1 DNA-DNA结合药物分子的相互作用第23页
                1.2.1.2.2 DNA-DNA结合蛋白的相互作用第23-25页
            1.2.1.3 DNA齐聚物的拉伸与操纵第25-26页
            1.2.1.4 以DNA齐聚物为探针研究DNA与蛋白质的相互作用第26-27页
        1.2.2 蛋白质折叠结构的打开第27-29页
        1.2.3 多糖分子的构象转变第29-32页
        1.2.4 配体-受体识别作用第32-38页
            1.2.4.1 几种模型体系的体外研究第32-34页
            1.2.4.2 细胞和细菌体系的探测第34-38页
    1.3 本论文的研究思路第38-39页
    参考文献第39-45页
第二章 在外力诱导下双链DNA构象转变的本质—单股DNA与SSB蛋白的相互作用第45-63页
    2.1 引言第45-46页
    2.2 实验部分第46-49页
        2.2.1 样品制备第46-47页
        2.2.2 单分子力谱实验第47-49页
    2.3 实验结果与讨论第49-58页
        2.3.1 外力诱导下的双链DNA与SSB蛋白的相互作用第49-50页
        2.3.2 拉伸长度、停留时间、盐离子浓度对双链DNA构象转变以及SSB蛋白与单股DNA相互作用的影响第50-55页
        2.3.3 解螺旋的双链DNA与SSB蛋白的相互作用第55-58页
    2.4 本章小结第58-59页
    参考文献第59-63页
第三章 烟草花叶病毒中RNA与衣壳蛋白之间的相互作用第63-79页
    3.1 引言第63-64页
    3.2 实验部分第64-66页
        3.2.1 样品制备第64-65页
        3.2.2 单分子力谱实验第65-66页
    3.3 实验结果与讨论第66-76页
        3.3.1 烟草花叶病毒中RNA从蛋白外壳上解组装第66页
        3.3.2 验证实验第66-70页
            3.3.2.1 WLC模型拟合与poly A RNA叠加第67页
            3.3.2.2 RNA基因组中相邻AAG序列长度的统计第67-69页
            3.3.2.3 RNA水解酶对比实验第69-70页
        3.3.3 影响RNA解组装力大小的因素第70-73页
            3.3.3.1 溶液pH值对TMV中RNA与衣壳蛋白之间相互作用的影响第70-71页
            3.3.3.2 拉伸速率对TMV中RNA与衣壳蛋白之间相互作用的影响第71页
            3.3.3.3 EDTA可以削弱TMV管口处RNA与衣壳蛋白之间的相互作第71页
            用第71-73页
        3.3.4 RNA的重新组装第73-76页
    3.4 本章小结第76-77页
    参考文献第77-79页
第四章 烟草花叶病毒中RNA与衣壳蛋白解离的动力学研究第79-95页
    4.1 引言第79-80页
    4.2 实验部分第80-81页
        4.2.1 样品制备第80页
        4.2.2 单分子力谱实验第80-81页
    4.3 实验结果与讨论第81-91页
        4.3.1 在pH值为4.7和7.0条件下RNA与衣壳蛋白断裂力的加载速率依赖性第81-86页
        4.3.2 动力学参数的计算第86-87页
        4.3.3 在pH值为4.7和7.0条件下RNA与衣壳蛋白解离的机制第87-91页
    4.4 本章小结第91-92页
    参考文献第92-95页
作者简历第95页
博士期间发表的论文第95-96页
博士期间参加的学术会议第96-97页
致谢第97页

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