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鸡胚性分化早期性别差异表达miRNA的靶基因研究

摘要第8-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略词表第11-12页
1 前言第12-20页
    1.1 研究背景第12-13页
    1.2 文献综述第13-19页
        1.2.1 miRNA的生物合成及其作用机制第13-14页
            1.2.1.1 miRNA的生物合成第13页
            1.2.1.2 miRNA的作用机制第13-14页
        1.2.2 miRNA靶基因的预测第14-19页
            1.2.2.1 生物信息学方法预测miRNA靶基因第14-17页
            1.2.2.2 生物实验方法预测miRNA靶基因第17-19页
        1.2.3 miRNA靶基因的鉴定第19页
    1.3 研究的目的和意义第19-20页
2 材料与方法第20-38页
    2.1 材料第20-26页
        2.1.1 样品第20页
        2.1.2 细胞系和质粒第20-21页
        2.1.3 所用试剂和试剂盒第21-24页
            2.1.3.1 主要试剂和试剂盒第21-22页
            2.1.3.2 主要溶液的配制第22-24页
        2.1.4 主要仪器设备第24-25页
        2.1.5 生物信息学分析相关的软件和数据库第25-26页
    2.2 方法第26-38页
        2.2.1 总RNA的提取及质量检测第26-27页
        2.2.2 时间表达谱分析第27-28页
            2.2.2.1 相关引物的设计第27页
            2.2.2.2 cDNA第一链的合成第27页
            2.2.2.3 miRNA的扩增及检测第27-28页
            2.2.2.4 定量检测分析第28页
        2.2.3 空间表达谱分析第28-32页
            2.2.3.1 探针的合成以及纯化第28-30页
            2.2.3.2 斑点杂交检测探针标记效率和量第30页
            2.2.3.3 胚胎干粉的制备以及Fab片段的预吸附第30-31页
            2.2.3.4 WISH程序第31-32页
        2.2.4 靶基因ATRX 3’UTR双荧光素酶报告基因载体的构建第32-35页
            2.2.4.1 靶基因3’UTR的扩增第32-33页
            2.2.4.2 靶基因3’UTR与载体psiCHECK~(TM)-2的连接及测序第33-35页
        2.2.5 细胞培养及转染第35-36页
            2.2.5.1 鸡成纤维细胞系(UMNSAH/DF-1)的培养第35页
            2.2.5.2 细胞转染第35-36页
        2.2.6 双荧光素酶报告基因的检测第36页
        2.2.7 靶基因ATRX的时间表达谱分析第36-38页
3 结果与分析第38-50页
    3.1 RNA提取及质量检测结果第38页
    3.2 时间表达谱分析第38-41页
    3.3 空间表达模式分析第41-43页
        3.3.1 斑点杂交结果第41页
        3.3.2 gga-miR-92的表达第41-43页
    3.4 gga-miR-92靶基因预测及分析的结果第43-46页
    3.5 双荧光素酶报告基因载体的构建结果第46-48页
        3.5.1 ATRX 3’UTR序列的扩增第46页
        3.5.2 pUM-T-ATRX 3’UTR重组质粒的鉴定第46-47页
        3.5.3 psiCHECK~(TM)-2-ATRX 3’UTR重组质粒的鉴定第47-48页
    3.6 双荧光素酶报告基因的检测结果第48-49页
    3.7 ATRX时间表达谱结果第49-50页
4 讨论第50-54页
    4.1 miRNA的表达谱分析第50-51页
    4.2 生物信息学预测鸡miRNA靶基因第51-52页
    4.3 靶基因的鉴定分析第52-53页
    4.4 miR-92与ATRX在鸡雄性性腺发育中的可能调控功能第53-54页
5 小结第54-55页
    5.1 本研究所取得的结果第54页
    5.2 本研究的创新点和特色第54页
    5.3 下一步需要研究的问题第54-55页
附录第55-57页
参考文献第57-62页
致谢第62页

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