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海带(Saccharina japonica)内参基因筛选及部分管家基因的系统进化分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
1 文献综述第12-31页
    1.1 海带研究概述第12-16页
        1.1.1 生物学特性第12-15页
        1.1.2 海带的应用价值第15-16页
    1.2 基因表达量测定的主要方法第16-17页
    1.3 实时荧光定量 PCR 技术概述第17-21页
        1.3.1 实时荧光定量 PCR 简介第17-18页
        1.3.2 qPCR 的原理第18-19页
        1.3.3 qPCR 检测方法第19-21页
        1.3.4 qPCR 定量方法第21页
    1.4 内参基因概述第21-26页
        1.4.1 内参基因具备条件第22页
        1.4.2 内参基因的筛选方法第22-23页
        1.4.3 植物中 qPCR 内参基因筛选及海带中内参基因应用的研究进展第23-26页
    1.5 七个管家基因(actin,EF1α,GAPDH,α-tubulin,β-tubulin, UBA52,UBA80)简介第26-30页
        1.5.1 actin 基因第26-27页
        1.5.2 EF1α基因第27-28页
        1.5.3 GAPDH 基因第28页
        1.5.4 α-Tubulin,β-Tubulin 基因第28-29页
        1.5.5 UBA52、UBA80 基因第29-30页
    1.6 本研究的目的及意义第30-31页
2 材料与方法第31-40页
    2.1 实验材料与主要试剂第31-33页
        2.1.1 实验材料第31页
        2.1.2 实验中的主要试剂及其配方第31-33页
        2.1.3 系统进化分析中所涉及的序列信息第33页
    2.2 实验方法第33-40页
        2.2.1 总 RNA 的提取及 cDNA 第一链的合成第33-35页
            2.2.1.1 配子体总 RNA 的提取第33-34页
            2.2.1.2 孢子体总 RNA 的提取第34页
            2.2.1.3 cDNA 第一链的合成第34-35页
        2.2.2 内参基因的克隆第35-37页
            2.2.2.1 海带内参候选基因的确定及克隆第35-36页
            2.2.2.2 引物设计第36页
            2.2.2.3 PCR 反应第36-37页
            2.2.2.4 目标条带测序第37页
            2.2.2.5 测序结果分析第37页
        2.2.3 内参基因筛选第37-39页
            2.2.3.1 引物设计第37-38页
            2.2.3.2 普通 PCR 检测扩增产物第38-39页
            2.2.3.3 引物扩增效率的测定第39页
            2.2.3.4 荧光定量 PCR第39页
            2.2.3.5 数据处理第39页
        2.2.4 部分管家基因的系统进化分析第39-40页
3 结果及分析第40-71页
    3.1 内参基因克隆结果第40-46页
        3.1.1 RNA 提取结果第40-41页
        3.1.2 PCR 扩增结果第41页
        3.1.3 克隆结果的分析第41-46页
    3.2 部分内参基因的系统发育分析结果第46-51页
        3.2.1 Actin 的系统进化分析第46-47页
        3.2.2 EF1α的系统进化分析第47-48页
        3.2.3 GAPDH 基因的系统进化分析第48-49页
        3.2.4 α-Tubulin,β-Tubulin 的系统进化分析第49-51页
    3.3 海带不同组织部位内参基因筛选的结果第51-60页
        3.3.1 RNA 的提取第51-52页
        3.3.2 引物特异性分析第52-54页
        3.3.3 引物扩增效率的检测第54-55页
        3.3.4 不同组织部位内参基因稳定性分析第55-60页
        3.3.5 海带不同组织部位内参筛选小结第60页
    3.4 海带不同生长时期内参基因的筛选第60-68页
        3.4.1 RNA 的提取第60-61页
        3.4.2 引物特异性分析第61-63页
        3.4.3 不同时期内参基因稳定性分析第63-67页
        3.4.4 海带不同生长时期内参筛选小结第67-68页
    3.5 海带不同组织部位和不同生长时期内参基因总评第68-70页
    3.6 关于在海带不同时期内参基因筛选中用 18S 校正其他内参基因表达量的研究第70-71页
4 讨论第71-75页
    4.1 海带总 RNA 提取方法的改进第71页
    4.2 cDNA 第一链反转录体系的优化第71-72页
    4.3 内参基因的克隆及系统进化分析第72-73页
    4.4 海带内参基因的筛选第73-75页
    4.5 基因多拷贝现象对内参基因表达量的影响第75页
5 小结第75-77页
参考文献第77-84页
附录第84-91页
致谢第91-92页
个人简历第92-93页

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