| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略符号 | 第13-14页 |
| 引言 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-33页 |
| 1 猪肠道微生物区系的特点及影响因素 | 第15-16页 |
| 1.1 生长阶段 | 第15页 |
| 1.2 肠道部位 | 第15页 |
| 1.3 日粮组成 | 第15-16页 |
| 2 日粮纤维对猪肠道微生物区系影响的研究进展 | 第16-18页 |
| 2.1 纤维类型对猪肠道微生物菌群的影响 | 第16-18页 |
| 2.1.1 纤维类型对菌群多样性的影响 | 第16-17页 |
| 2.1.2 纤维类型对菌群数量的影响 | 第17页 |
| 2.1.3 纤维类型对发酵模式的影响 | 第17-18页 |
| 2.2 纤维类型对发酵产物的影响 | 第18页 |
| 3 分子生物技术在动物肠道微生物菌群结构研究中的应用 | 第18-25页 |
| 3.1 T-RFLP分析 | 第19-20页 |
| 3.1.1 T-RFLP技术的基本原理 | 第19页 |
| 3.1.2 T-RFLP技术的影响因素 | 第19-20页 |
| 3.1.3 T-RFLP技术在动物肠道微生物研究中的应用 | 第20页 |
| 3.2 定量PCR | 第20-22页 |
| 3.2.1 定量PCR的基本原理及特点 | 第20-21页 |
| 3.2.2 定量PCR技术在动物肠道微生物研究中的应用 | 第21-22页 |
| 3.3 高通量测序技术 | 第22-25页 |
| 3.3.1 高通量测序技术的基本原理 | 第22页 |
| 3.3.2 高通量测序平台的特点 | 第22-23页 |
| 3.3.3 高通量测序技术在动物肠道微生物研究中的应用 | 第23-25页 |
| 4 研究目的和内容 | 第25-27页 |
| 4.1 研究目的 | 第25页 |
| 4.2 研究内容 | 第25-27页 |
| 参考文献 | 第27-33页 |
| 第二章 小麦麸和大豆皮日粮及添加细胞壁降解酶对猪肠道微生物多样性和挥发性脂肪酸浓度的影响 | 第33-49页 |
| 1 材料与方法 | 第33-38页 |
| 1.1 试剂和仪器 | 第33页 |
| 1.2 试验设计 | 第33-34页 |
| 1.3 试验日粮配制 | 第34页 |
| 1.4 试验动物 | 第34页 |
| 1.5 样品采集与处理 | 第34-36页 |
| 1.6 测定指标与方法 | 第36-37页 |
| 1.6.1 CTAB法提取肠道微生物总DNA | 第36页 |
| 1.6.2 16S rRNA基因可变区扩增 | 第36页 |
| 1.6.3 琼脂糖凝胶回收纯化 | 第36-37页 |
| 1.7 数据处理与分析 | 第37-38页 |
| 1.7.1 营养成分消化量 | 第37页 |
| 1.7.2 DNA序列数据处理 | 第37-38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-46页 |
| 2.1 DNA序列和微生物多样性 | 第38-40页 |
| 2.2 回肠食糜样品中微生物的菌群结构 | 第40-41页 |
| 2.3 粪便样品中微生物的菌群结构 | 第41-44页 |
| 2.4 非淀粉多糖的消化量 | 第44页 |
| 2.5 挥发性脂肪酸的浓度 | 第44-46页 |
| 3 讨论 | 第46-48页 |
| 3.1 纤维来源和酶制剂对猪肠道微生物多样性和菌群结构的影响 | 第46-48页 |
| 3.2 纤维来源和酶制剂对猪肠道内VFA浓度的影响 | 第48页 |
| 4 小结 | 第48-49页 |
| 第三章 西兰花茎叶粉和米糠日粮及添加细胞壁降解酶对猪肠道微生物多样性和挥发性脂肪酸浓度的影响 | 第49-65页 |
| 1 材料与方法 | 第49-51页 |
| 1.1 试剂和仪器 | 第49页 |
| 1.2 试验设计 | 第49页 |
| 1.3 试验日粮配制 | 第49-51页 |
| 1.4 试验动物 | 第51页 |
| 1.5 样品采集与处理 | 第51页 |
| 1.6 测定指标与方法 | 第51页 |
| 1.7 数据处理与分析 | 第51页 |
| 1.7.1 营养成分消化量 | 第51页 |
| 1.7.2 DNA序列数据处理 | 第51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-60页 |
| 2.1 DNA序列和微生物多样性 | 第51-53页 |
| 2.2 回肠食糜样品中微生物的菌群结构 | 第53-54页 |
| 2.3 粪便样品中微生物的菌群结构 | 第54-59页 |
| 2.4 非淀粉多糖的消化量 | 第59页 |
| 2.5 挥发性脂肪酸的浓度 | 第59-60页 |
| 3 讨论 | 第60-63页 |
| 3.1 纤维来源和酶制剂对猪肠道微生物多样性和菌群结构的影响 | 第61-63页 |
| 3.2 纤维来源和酶制剂对猪肠道内VFA浓度的影响 | 第63页 |
| 4 小结 | 第63-65页 |
| 第四章 高通量测序和T-RFLP法用于分析猪肠道微生物菌群多样性的结果比较 | 第65-77页 |
| 1 材料与方法 | 第65-67页 |
| 1.1 测定指标与方法 | 第65-66页 |
| 1.1.1 肠道微生物总DNA的提取 | 第65页 |
| 1.1.2 肠道微生物16S rRNA基因扩增 | 第65-66页 |
| 1.1.3 限制性内切酶酶切 | 第66页 |
| 1.1.4 毛细管电泳检测酶切产物 | 第66页 |
| 1.2 数据处理与分析 | 第66-67页 |
| 1.2.1 DNA序列数据处理 | 第66页 |
| 1.2.2 末端限制性片段数据处理 | 第66-67页 |
| 2 结果与分析 | 第67-70页 |
| 2.1 T-RFLP技术检测所得猪肠道微生物菌群的多样性 | 第67页 |
| 2.2 T-RFLP技术检测所得猪回肠食糜样品中微生物T-RFs的相对含量 | 第67-69页 |
| 2.3 T-RFLP技术检测所得猪粪便样品中微生物T-RFs的相对含量 | 第69-70页 |
| 3 讨论 | 第70-75页 |
| 3.1 两种技术检测所得猪肠道微生物菌群多样性的结果比较 | 第70-71页 |
| 3.2 两种技术检测所得猪肠道微生物菌群组成结构的结果比较 | 第71-75页 |
| 4 小结 | 第75-77页 |
| 全文结论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-89页 |
| 附录一 高通量测序和T-RFLP技术测定猪肠道微生物菌群多样性的原始数据 | 第89-91页 |
| 致谢 | 第91-93页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第93页 |
