| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 缩略词表 | 第8-12页 |
| 1 前言 | 第12-20页 |
| 1.1 甘蔗脱叶性的研究概况 | 第12-13页 |
| 1.2 植物激素对植物器官脱落的调控 | 第13-15页 |
| 1.2.1 生长素对植物器官脱落的调控 | 第13页 |
| 1.2.2 乙烯对植物器官脱落的调控 | 第13-14页 |
| 1.2.3 脱落酸对植物器官脱落的调控 | 第14页 |
| 1.2.4 赤霉素对植物器官脱落的调控 | 第14-15页 |
| 1.2.5 细胞分裂素对植物器官脱落的调控 | 第15页 |
| 1.2.6 油菜素甾醇对植物器官脱落的调控 | 第15页 |
| 1.2.7 茉莉酸对植物器官脱落的调控 | 第15页 |
| 1.3 酶类对植物器官脱落的调控 | 第15-17页 |
| 1.3.1 纤维素酶对植物器官脱落的调控 | 第15-16页 |
| 1.3.2 果胶酶对植物器官脱落的调控机制 | 第16页 |
| 1.3.3 其他酶类对植物器官脱落的调控机制 | 第16-17页 |
| 1.4 Ca~(2+)对植物器官脱落的调控机制 | 第17页 |
| 1.5 转录组学概述 | 第17-18页 |
| 1.6 研究的目的与意义 | 第18-19页 |
| 1.7 技术路线 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-28页 |
| 2.1 试验材料 | 第20-22页 |
| 2.1.1 甘蔗脱叶性指标筛选与评价的试验材料 | 第20-22页 |
| 2.1.2 转录组测序和表达谱构建的植物材料 | 第22页 |
| 2.2 试验设计 | 第22-23页 |
| 2.3 测定项目及方法 | 第23-28页 |
| 2.3.1 脱叶性相关指标的测定方法 | 第23-24页 |
| 2.3.1.1 总节数(TIN)、自然落叶数(SDN)和自然落叶率(SDFR) | 第23页 |
| 2.3.1.2 茎径(SD)的测定 | 第23页 |
| 2.3.1.3 叶鞘痕长度(LSR)和叶鞘倾角(ASR)的测定 | 第23-24页 |
| 2.3.1.4 总脱叶力(TDF)和平均每叶脱叶力(MDF)的测定 | 第24页 |
| 2.3.2 转录组测序和表达谱的分析方法 | 第24-28页 |
| 2.3.2.1 RNA提取和质量检测 | 第24页 |
| 2.3.2.2 RNA-seq测序 | 第24-25页 |
| 2.3.2.3 de novo组装 | 第25-26页 |
| 2.3.2.4 ORF(Open Reading Frame)预测 | 第26页 |
| 2.3.2.5 功能注释 | 第26页 |
| 2.3.2.6 构建甘蔗叶鞘表达谱 | 第26页 |
| 2.3.2.7 差异基因分析 | 第26页 |
| 2.3.2.8 差异基因的功能注释 | 第26页 |
| 2.3.2.9 差异基因的表达模式聚类 | 第26-27页 |
| 2.3.2.10 差异基因的显著性富集 | 第27页 |
| 2.3.2.11 qRT-PCR验证 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-67页 |
| 3.1 甘蔗脱叶性的量化表征与评价 | 第28-43页 |
| 3.1.1 甘蔗脱叶性的定量评价指标 | 第28-32页 |
| 3.1.2 甘蔗品种的脱叶性评价 | 第32-38页 |
| 3.1.3 甘蔗种质资源后代的脱叶性评价 | 第38-43页 |
| 3.2 不同脱叶性甘蔗品系的叶鞘转录组和表达谱分析 | 第43-67页 |
| 3.2.1 甘蔗叶鞘RNA质量检测 | 第43页 |
| 3.2.2 转录组测序与组装 | 第43-44页 |
| 3.2.3 Unigene的功能注释 | 第44-49页 |
| 3.2.4 显著差异基因的分布 | 第49-50页 |
| 3.2.5 显著差异基因的GO功能分析 | 第50-55页 |
| 3.2.6 显著差异基因KEGG注释 | 第55-56页 |
| 3.2.7 差异基因的表达模式聚类 | 第56-59页 |
| 3.2.8 显著差异基因的功能富集分析 | 第59-62页 |
| 3.2.9 甘蔗叶片脱落的相关基因 | 第62-65页 |
| 3.2.10 qRT-PCR验证差异表达基因 | 第65-67页 |
| 4 讨论 | 第67-72页 |
| 4.1 甘蔗脱叶性的定量评价可行性 | 第67-68页 |
| 4.2 甘蔗品种和种质资源后代的脱叶性 | 第68-69页 |
| 4.3 甘蔗叶鞘的转录组测序和表达谱 | 第69-72页 |
| 5 结论与创新点 | 第72-74页 |
| 5.1 主要结论 | 第72页 |
| 5.2 创新点 | 第72-73页 |
| 5.3 研究展望 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-85页 |
| 附录 | 第85-87页 |
| 攻读硕士学位期间承担的科研项目 | 第87-88页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第88页 |
