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紫球藻Lhc基因的克隆及其生物信息学和表达分析

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 绪论第10-22页
    1.1 紫球藻研究概况第10页
        1.1.1 紫球藻简介第10页
        1.1.2 紫球藻的价值及研究进展第10页
    1.2 捕光蛋白复合体的研究概况第10-21页
        1.2.1 捕光蛋白复合体的进化和分类第10-11页
        1.2.2 Chl a/ Chl b型捕光蛋白复合体的结构和功能第11-15页
        1.2.3 FCP型捕光蛋白复合体的结构和功能第15-16页
        1.2.4 藻胆体型捕光蛋白复合体的结构和功能第16-21页
        1.2.5 捕光蛋白复合体的研究进展第21页
    1.3 本实验研究目的及意义第21-22页
2 紫球藻Lhc家族基因克隆第22-33页
    2.1 材料与方法第22-29页
        2.1.1 材料第22-23页
        2.1.2 方法第23-29页
    2.2 结果与分析第29-32页
        2.2.1 紫球藻总RNA质量检测第29-30页
        2.2.2 PpLhc的PCR扩增第30页
        2.2.3 PCR产物的纯化与回收第30-31页
        2.2.4 重组菌菌液PCR第31-32页
    2.3 讨论第32-33页
        2.3.1 紫球藻PpLhc基因序列筛选第32-33页
        2.3.2 PCR条件优化第33页
3 紫球藻PpLhc基因生物信息学分析第33-52页
    3.1 材料与方法第33-34页
        3.1.1 材料第33页
        3.1.2 方法第33-34页
    3.2 结果与分析第34-50页
        3.2.1 ORF分析第34页
        3.2.2 相似性搜索第34页
        3.2.3 蛋白质理化性质分析第34-35页
        3.2.4 氨基酸序列保守结构域分析第35-36页
        3.2.5 磷酸化位点,信号肽,跨膜结构域,亚细胞定位预测和分析第36-44页
        3.2.6 疏水性/亲水性的预测和分析第44-47页
        3.2.7 二级结构预测和分析第47-48页
        3.2.8 三级结构预测和分析第48-49页
        3.2.9 PpLHC蛋白亲缘关系比对分析第49-50页
    3.3 讨论第50-52页
4 紫球藻PpLhc基因的差异表达研究第52-56页
    4.1 材料与方法第52-54页
        4.1.1 材料第52页
        4.1.2 方法第52-54页
    4.2 结果与分析第54-56页
        4.2.1 光强对紫球藻PpLhc基因的影响第54-55页
        4.2.2 光照时间对紫球藻PpLhc基因表达量的影响第55-56页
    4.3 讨论第56页
5 紫球藻PpLhc1和PpLhc4的原核表达第56-67页
    5.1 材料与方法第56-61页
        5.1.1 材料第56-57页
        5.1.2 方法第57-61页
    5.2 结果与分析第61-66页
        5.2.1 可培养细菌的PCR检测第61-62页
        5.2.2 ORF序列扩增第62-63页
        5.2.3 重组表达载体构建第63-64页
        5.2.4 PpLHC1和PpLHC4诱导表达条件优化第64页
        5.2.5 PpLHC1和PpLHC4蛋白纯化第64-66页
    5.3 讨论第66-67页
        5.3.1 表达载体及酶切位点的选择第66页
        5.3.2 表达菌株的选择第66-67页
6 紫球藻菌藻共生体系的分析第67-74页
    6.1 材料与方法第67-69页
        6.1.1 材料第67页
        6.1.2 方法第67-69页
    6.2 结果与分析第69-73页
        6.2.1 可培养细菌的PCR检测第69-70页
        6.2.2 PCR产物测序结果第70页
        6.2.3 菌株 16S rDNA序列比对及菌种确定第70-71页
        6.2.4 共生菌对PpLhc基因差异表达结果第71页
        6.2.5 共生菌对紫球藻生长情况的影响第71-72页
        6.2.6 共生菌对紫球藻光合情况的影响第72-73页
    6.3 讨论第73-74页
7 结论第74-75页
参考文献第75-78页
附录第78-80页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第80-81页
致谢第81页

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