| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| abstract | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第15-21页 |
| 1.1 引言 | 第15-17页 |
| 1.2 课题来源及本文主要研究内容 | 第17-19页 |
| 1.3 本文组织结构 | 第19-20页 |
| 1.4 本章小结 | 第20-21页 |
| 第二章 相关工作概述 | 第21-39页 |
| 2.1 模式匹配问题的研究现状 | 第21-29页 |
| 2.1.1 精确模式匹配问题 | 第22-24页 |
| 2.1.2 近似模式匹配问题 | 第24-26页 |
| 2.1.3 带通配符和间隔约束的模式匹配问题 | 第26-29页 |
| 2.2 模式挖掘问题的研究现状 | 第29-38页 |
| 2.2.1 精确模式挖掘问题 | 第31-34页 |
| 2.2.2 近似模式挖掘问题 | 第34-38页 |
| 2.3 本章小结 | 第38-39页 |
| 第三章 基于编辑距离的近似频繁模式挖掘的研究 | 第39-57页 |
| 3.1 问题的定义 | 第39-41页 |
| 3.2 构造近似编辑距离矩阵 | 第41-44页 |
| 3.3 近似Apriori剪枝原理 | 第44-48页 |
| 3.3.1 补偿序列数maxl,editN的计算 | 第44-46页 |
| 3.3.2 确定性剪枝原理(Apriori-like性质) | 第46-48页 |
| 3.4 算法设计 | 第48-52页 |
| 3.4.1 解集合的矩阵结构MST(Pattern) | 第48-49页 |
| 3.4.2 APM方法获取模式的支持度 | 第49-51页 |
| 3.4.3 MAPA算法挖掘近似频繁模式 | 第51-52页 |
| 3.5 实验结果分析 | 第52-56页 |
| 3.5.1 带通配符间隔约束的精确频繁模式挖掘 | 第52-53页 |
| 3.5.2 带通配符间隔约束的近似频繁模式挖掘 | 第53-56页 |
| 3.6 本章小结 | 第56-57页 |
| 第四章 基于匹配得分矩阵的生物序列频繁模式挖掘 | 第57-74页 |
| 4.1 问题定义 | 第57-59页 |
| 4.2 近似匹配得分矩阵MSM | 第59-61页 |
| 4.3 S-APM算法计算模式的近似支持度 | 第61-64页 |
| 4.4 单序列频繁模式挖掘算法MAPS | 第64-65页 |
| 4.5 多序列共同频繁模式挖掘算法co-fp-miner | 第65-68页 |
| 4.5.1 Pruning剪枝规则 | 第65-66页 |
| 4.5.2 共同频繁模式挖掘算法co-fp-miner | 第66-68页 |
| 4.6 实验结果与分析 | 第68-73页 |
| 4.6.1 MAPS与ArpGap在DNA上近似挖掘的比较 | 第68-69页 |
| 4.6.2 MAPS与ArpGap在蛋白质近似挖掘上的比较 | 第69-70页 |
| 4.6.3 MAPS关于序列长度的时间和空间趋势实验 | 第70-71页 |
| 4.6.4 co-fps-miner算法在多序列模式挖掘的效果展示 | 第71-72页 |
| 4.6.5 co-fps-miner算法Pruning剪枝的有效性验证 | 第72页 |
| 4.6.6 co-fps-miner与MPP和ArpGap在多序列模式挖掘上的比较 | 第72-73页 |
| 4.7 本章小结 | 第73-74页 |
| 第五章 总结与展望 | 第74-76页 |
| 5.1 工作总结 | 第74-75页 |
| 5.2 工作展望 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-82页 |
| 攻读硕士学位期间的学术活动及成果情况 | 第82-84页 |
