摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
1 文献综述 | 第9-19页 |
1.1 蓝藻水华及形成原因 | 第9-10页 |
1.2 蓝藻水华的危害及治理 | 第10-12页 |
1.3 分子机理研究方法 | 第12-15页 |
1.3.1 基于差异基因的方法 | 第12-13页 |
1.3.2 芯片技术 | 第13页 |
1.3.3 转录组技术 | 第13页 |
1.3.4 蛋白组学研究 | 第13-15页 |
1.4 荧光定量PCR技术 | 第15-17页 |
1.5 本研究的目的及意义 | 第17-19页 |
2 材料与方法 | 第19-27页 |
2.1 材料及仪器 | 第19-21页 |
2.1.1 试验材料 | 第19页 |
2.1.2 主要仪器和试剂 | 第19-20页 |
2.1.3 主要培养基配方 | 第20-21页 |
2.1.4 主要试剂配制 | 第21页 |
2.2 研究方法 | 第21页 |
2.2.1 真菌菌丝膜的培养 | 第21页 |
2.2.2 蓝藻细胞的培养 | 第21页 |
2.3 Real Time-PCR验证云芝-F21a除藻关键差异基因 | 第21-23页 |
2.3.1 真菌菌膜总RNA的提取 | 第21-22页 |
2.3.2 Real Time-PCR验证 | 第22-23页 |
2.4 真菌蛋白质表达量高通量分析 | 第23-24页 |
2.4.1 蛋白质抽提 | 第23页 |
2.4.2 胰蛋白酶消化 | 第23页 |
2.4.3 TMT标记 | 第23-24页 |
2.4.4 HPLC分馏 | 第24页 |
2.5 LC-MS/MS定量蛋白组学分析 | 第24-25页 |
2.5.1 LC-MS/MS分析 | 第24-25页 |
2.5.2 数据库检索 | 第25页 |
2.5.3 质谱分析数据质量控制确认 | 第25页 |
2.6 生物信息学方法 | 第25-26页 |
2.6.1 注释方法 | 第25-26页 |
2.7 定量蛋白组学与转录组关联分析 | 第26页 |
2.8 纤维素酶降解蓝藻细胞及藻浓度的测定 | 第26-27页 |
3 结果与分析 | 第27-55页 |
3.1 Real Time-PCR验证 | 第27-34页 |
3.1.1 总RNA提取 | 第27-28页 |
3.1.2 定量PCR验证 | 第28-34页 |
3.2 云芝T. versicolor-F21a菌膜降解蓝藻蛋白组分析 | 第34-44页 |
3.2.1 样品的采取 | 第34页 |
3.2.2 质谱分析(MS)数据的质量控制确认 | 第34-35页 |
3.2.3 原始数据的处理和统计 | 第35页 |
3.2.4 蛋白注释分析 | 第35-37页 |
3.2.5 GO富集分析 | 第37-40页 |
3.2.6 KEGG Pathway富集分析 | 第40-41页 |
3.2.7 结构域(Doman)富集分析 | 第41-42页 |
3.2.8 亚细胞定位预测分析 | 第42-44页 |
3.3 转录组测序结果与蛋白组定量结果关联分析 | 第44-52页 |
3.3.1 蛋白组与转录组比较 | 第44-46页 |
3.3.2 Go富集分析 | 第46-49页 |
3.3.3 KEGG富集分析 | 第49-50页 |
3.3.4 蛋白结构域分析 | 第50-52页 |
3.4 转录组分析结果中分解酶基因表达与蛋白质含量关联分析 | 第52-53页 |
3.5 不同浓度纤维酶与蓝藻细胞作用 | 第53-55页 |
4 讨论 | 第55-58页 |
5 结论 | 第58-59页 |
参考文献 | 第59-65页 |
附录 | 第65-66页 |
致谢 | 第66-67页 |
作者简介 | 第67页 |