| 摘要 | 第9-13页 |
| Abstract | 第13-17页 |
| 缩略词表（Abbreviation） | 第18-19页 |
| 第1章 文献综述 | 第19-41页 |
| 前言 | 第19页 |
| 1 鸵鸟人工养殖及疾病防控 | 第19-21页 |
| 1.1 我国人工鸵鸟养殖的发展概况 | 第19-21页 |
| 1.2 鸵鸟疾病防控现状 | 第21页 |
| 2 微量元素硼的生物学效应研究进展 | 第21-24页 |
| 2.1 硼对动物体的影响 | 第21-24页 |
| 2.1.1 硼的营养作用及其新陈代谢 | 第21-23页 |
| 2.1.2 硼对动物体的毒性作用 | 第23-24页 |
| 2.2 硼对癌细胞增殖及凋亡的调节 | 第24页 |
| 3 雏鸵鸟、胸腺与硼的关系 | 第24-25页 |
| 4 胸腺发育相关基因研究进展 | 第25-28页 |
| 4.1 Foxn1基因与胸腺发育 | 第26-28页 |
| 4.2 BMPs家族与胸腺发育 | 第28页 |
| 5 免疫及炎症应答相关通路研究进展 | 第28-40页 |
| 5.1 MAPK信号通路 | 第28-32页 |
| 5.1.1 Ras-ERK信号通路 | 第29-30页 |
| 5.1.2 JNK信号通路 | 第30-31页 |
| 5.1.3 p38MAPK信号通路 | 第31-32页 |
| 5.2 钙依赖性信号通路 | 第32-33页 |
| 5.3 PI3K/AKT信号通路 | 第33-35页 |
| 5.4 热应激蛋白与免疫应答 | 第35-36页 |
| 5.4.1 Hsp70 | 第35页 |
| 5.4.2 Hsp40 | 第35-36页 |
| 5.5 细胞凋亡信号通路 | 第36-40页 |
| 5.5.1 外源性凋亡信号通路 | 第36-37页 |
| 5.5.2 内源性凋亡信号通路 | 第37页 |
| 5.5.3 钙离子介导的凋亡通路 | 第37-38页 |
| 5.5.4 凋亡抑制蛋白IAP和FLIP | 第38-39页 |
| 5.5.5 存活因子PI3K和PKA | 第39-40页 |
| 6 选题目的与意义 | 第40-41页 |
| 第2章 硼对雏鸵鸟胸腺生长发育相关基因的影响 | 第41-77页 |
| 1 引言 | 第41-42页 |
| 2 材料与方法 | 第42-54页 |
| 2.1 实验材料 | 第42-45页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第42页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第42-43页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第43-44页 |
| 2.1.4 试剂配置 | 第44-45页 |
| 2.2 实验方法 | 第45-54页 |
| 2.2.1 取材 | 第45页 |
| 2.2.2 HE染色 | 第45页 |
| 2.2.3 免疫组织化学 | 第45页 |
| 2.2.4 TUNEL技术 | 第45-46页 |
| 2.2.5 免疫荧光化学 | 第46-47页 |
| 2.2.6 荧光定量PCR | 第47-48页 |
| 2.2.7 Western Blot | 第48-50页 |
| 2.2.8 RACE测序 | 第50-54页 |
| 3 结果 | 第54-72页 |
| 3.1 硼对雏鸵鸟胸腺组织结构的影响 | 第54-57页 |
| 3.2 硼对雏鸵鸟胸腺细胞凋亡的影响 | 第57-60页 |
| 3.3 鸵鸟Foxn1基因的克隆和序列分析 | 第60-65页 |
| 3.3.1 鸵鸟Foxn1基因的RACE扩增结果 | 第60-65页 |
| 3.4 硼对雏鸵鸟胸腺内Foxn1蛋白表达的影响 | 第65-68页 |
| 3.5 硼对雏鸵鸟胸腺内BMP信号通路的影响作用 | 第68-72页 |
| 4 讨论 | 第72-76页 |
| 4.1 硼对 90d雏鸵鸟胸腺组织结构的影响 | 第72页 |
| 4.2 硼对 90d雏鸵鸟胸腺淋巴细胞凋亡的影响 | 第72-73页 |
| 4.3 硼对鸵鸟Foxn1基因的影响 | 第73-74页 |
| 4.4 硼对鸵鸟胸腺发育相关基因BMP2/BMP4的影响作用 | 第74-76页 |
| 5 结论 | 第76-77页 |
| 第3章 雏鸵鸟胸腺应答硼刺激的RNA-Seq分析 | 第77-128页 |
| 1 引言 | 第77-78页 |
| 2 材料与方法 | 第78-87页 |
| 2.1 实验材料 | 第78页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第78页 |
| 2.1.2 仪器设备 | 第78页 |
| 2.2 实验方法 | 第78-87页 |
| 2.2.1 RNA-Seq实验简介 | 第78-79页 |
| 2.2.2 转录组信息分析简介 | 第79-82页 |
| 2.2.3 转录组信息分析方法简述 | 第82-87页 |
| 3 结果 | 第87-119页 |
| 3.1 转录组测序评估 | 第87-92页 |
| 3.1.1 转录组测序质量评估 | 第87页 |
| 3.1.2 碱基组成与质量分析 | 第87-89页 |
| 3.1.3 过滤信息统计分析 | 第89-90页 |
| 3.1.4 转录组测序饱和度分析 | 第90-91页 |
| 3.1.5 转录组测序随机性分析 | 第91-92页 |
| 3.2 转录组比对统计分析 | 第92页 |
| 3.2.1 比对核糖体 | 第92页 |
| 3.2.2 比对鸵鸟参考基因组 | 第92页 |
| 3.3 转录组基因统计分析 | 第92-95页 |
| 3.3.1 基因表达结果统计 | 第92-93页 |
| 3.3.2 基因覆盖度统计 | 第93-94页 |
| 3.3.3 表达量丰度分析 | 第94-95页 |
| 3.4 转录组差异分析 | 第95-119页 |
| 3.4.1 重复性检验 | 第95-96页 |
| 3.4.2 样品关系概况 | 第96-98页 |
| 3.4.3 成对差异基因统计分析 | 第98-100页 |
| 3.4.4 差异表达基因的GO功能分析 | 第100-111页 |
| 3.4.5 差异表达基因的KEGG pathway分析 | 第111-119页 |
| 4 讨论 | 第119-127页 |
| 4.1 雏鸵鸟胸腺转录组学测序质量评估 | 第120页 |
| 4.2 雏鸵鸟胸腺转录组学差异基因GO功能注释分析 | 第120-121页 |
| 4.3 雏鸵鸟胸腺转录组学差异基因KEGG pathway的富集分析 | 第121-127页 |
| 5 结论 | 第127-128页 |
| 第4章 硼对鸵鸟机体免疫及炎症相关通路的影响 | 第128-155页 |
| 1 引言 | 第128页 |
| 2 材料与方法 | 第128-129页 |
| 2.1 实验材料 | 第128-129页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第128页 |
| 2.1.2 仪器设备 | 第128-129页 |
| 2.2 实验方法 | 第129页 |
| 2.2.1 RNA-Seq测序及分析 | 第129页 |
| 2.2.2 荧光定量PCR技术 | 第129页 |
| 2.2.3 Western Blot技术 | 第129页 |
| 3 结果 | 第129-149页 |
| 3.1 硼对鸵鸟机体内MAPK信号通路的影响 | 第129-135页 |
| 3.2 硼对鸵鸟机体内钙离子信号通路的影响 | 第135-139页 |
| 3.3 硼对鸵鸟机体内B/T细胞受体信号通路的影响 | 第139-142页 |
| 3.4 硼对鸵鸟机体内Toll样受体通路的影响 | 第142-145页 |
| 3.5 硼对热休克蛋白(HSP)活性的影响 | 第145-149页 |
| 4 讨论 | 第149-154页 |
| 4.1 硼对MAPK信号通路的影响 | 第149-151页 |
| 4.2 硼对钙离子信号通路的影响 | 第151-152页 |
| 4.3 硼对T/B细胞受体信号通路的影响 | 第152-153页 |
| 4.4 硼对Toll样受体信号通路的影响 | 第153页 |
| 4.5 硼对热应激蛋白Hsp70和Hsp40表达水平的影响 | 第153-154页 |
| 5 结论 | 第154-155页 |
| 第5章 硼对鸵鸟胸腺细胞增殖及凋亡通路的影响 | 第155-164页 |
| 1 引言 | 第155-156页 |
| 2 材料与方法 | 第156页 |
| 2.1 实验材料 | 第156页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第156页 |
| 2.1.2 仪器设备 | 第156页 |
| 2.2 实验方法 | 第156页 |
| 2.2.1 RNA-Seq测序及分析 | 第156页 |
| 2.2.2 荧光定量PCR技术 | 第156页 |
| 3 结果 | 第156-161页 |
| 3.1 硼对鸵鸟机体内细胞凋亡通路的影响 | 第156-160页 |
| 3.1.1 硼对外源性细胞凋亡通路的影响 | 第157-158页 |
| 3.1.2 硼对存活因子及凋亡相关因子表达水平的影响 | 第158-160页 |
| 3.1.3 硼对钙离子诱导的细胞凋亡的影响 | 第160页 |
| 3.2 硼对鸵鸟机体内癌症信号通路的影响 | 第160-161页 |
| 4 讨论 | 第161-163页 |
| 4.1 硼对鸵鸟机体内细胞凋亡信号通路的影响 | 第161-163页 |
| 4.2 硼对鸵鸟机体内癌症信号通路的影响 | 第163页 |
| 5 结论 | 第163-164页 |
| 第6章 全文结论 | 第164-166页 |
| 参考文献 | 第166-186页 |
| 致谢 | 第186-187页 |
| 附录1 个人简历 | 第187-188页 |
| 附录2 博士期间发表的论文 | 第188-190页 |
