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Bacillus sp.CDB3 ars1中抗砷基因功能鉴定及新抗砷基因的生物信息学分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
1 绪论第13-26页
    1.1 引言第13页
    1.2 砷的化学组成和历史第13-14页
    1.3 砷在微生物体内的转化第14页
    1.4 砷的生态学第14-15页
    1.5 砷的应用第15页
    1.6 砷的毒性第15-16页
    1.7 微生物抗砷第16-24页
        1.7.1 氧化第16页
        1.7.2 砷吸收量的控制第16页
        1.7.3 砷的迸出第16-17页
        1.7.4 微生物常见的抗砷蛋白第17-23页
        1.7.5 其它抗砷基因第23-24页
    1.8 本研究的目的和意义第24页
    1.9 本研究的内容和技术路线第24-26页
2 ACR3类膜蛋白ArsY与ArsA相互作用的初探第26-37页
    2.1 材料第27-28页
        2.1.1 菌株和质粒第27页
        2.1.2 主要试剂第27页
        2.1.3 主要仪器第27-28页
    2.2 方法第28-30页
        2.2.1 培养基及主要试剂的制备第28页
        2.2.2 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第28-29页
        2.2.3 大肠杆菌质粒的少量制备第29页
        2.2.4 DNA片断及质粒的纯化第29页
        2.2.5 DNA的酶切及连接第29页
        2.2.6 菌落PCR第29页
        2.2.7 琼脂糖凝胶电泳分析第29页
        2.2.8 抗砷实验第29-30页
        2.2.9 DNA序列合成第30页
    2.3 结果第30-34页
        2.3.1 arsA基因敲除质粒的构建第30-32页
        2.3.2 CDB3 ars1抗砷操纵子中arsA基因的生物信息学分析第32-34页
        2.3.3 arsA基因的缺失对AW3110菌株抗砷能力的影响第34页
    2.4 讨论第34-35页
        2.4.1 基因功能验证的方法第34-35页
        2.4.2 arsA基因在细胞抗砷机制中的功能第35页
    2.5 本章小结第35-37页
3 Bacillus sp. CDB3 arsD非调节基因的验证及arsT基因的功能分析第37-53页
    3.1 材料第37-39页
        3.1.1 菌株和质粒第37-38页
        3.1.2 主要试剂第38页
        3.1.3 主要仪器第38-39页
    3.2 方法第39页
        3.2.1 引物设计第39页
        3.2.2 DNA测序方法第39页
    3.3 结果第39-50页
        3.3.1 arsDA基因敲除质粒的构建第39-42页
        3.3.2 arsT基因敲除质粒的构建第42-46页
        3.3.3 ArsD的生物信息学分析第46-47页
        3.3.4 CDB3 ArsD非调节蛋白的验证第47-48页
        3.3.5 ArsT的生物信息学分析第48-49页
        3.3.6 arsT基因的缺失对抗砷能力的影响第49-50页
    3.4 讨论第50-51页
    3.5 本章小结第51-53页
4 Bacillus sp. CDB3 ars1新基因orf7和orf8的功能分析第53-67页
    4.1 材料第53-54页
        4.1.1 菌株和质粒第53-54页
        4.1.2 主要试剂第54页
        4.1.3 主要仪器第54页
    4.2 方法第54-55页
        4.2.1 引物设计第55页
        4.2.2 RNA提取第55页
        4.2.3 RT-PCR第55页
        4.2.4 PCR反应第55页
    4.3 结果第55-65页
        4.3.1 orf7,orf8和arsC基因敲除质粒的构建第55-60页
        4.3.2 RT-PCR对转pAR27大肠杆菌中8-gene转录子表达的验证第60-61页
        4.3.3 orf7和orf8突变株对大肠杆菌抗砷能力的影响第61-62页
        4.3.4 orf8基因产物是否是抗砷还原酶的验证第62-65页
        4.3.5 orf8基因可提高异源菌株对砷的抗性第65页
    4.4 讨论第65-66页
    4.5 本章小结第66-67页
5 新抗砷基因的筛选及其功能分析第67-75页
    5.1 材料与方法第67页
    5.2 结果第67-73页
        5.2.1 抗砷操纵子中新抗砷基因的筛选及初步分析第67-72页
        5.2.2 抗砷操纵子中可能的抗砷基因的功能分类第72-73页
    5.3 讨论第73-74页
    5.4 本章小结第74-75页
结论第75-76页
参考文献第76-85页
附录第85-97页
攻读学位期间发表的学术论文第97-98页
致谢第98-99页

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