| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-24页 |
| 1.1 烟草青枯病概述 | 第12页 |
| 1.1.1 病症表现 | 第12页 |
| 1.1.2 病原菌及侵染 | 第12页 |
| 1.2 烟草青枯病的防治 | 第12-13页 |
| 1.3 植物根际促生细菌 | 第13-17页 |
| 1.3.1 PGPR概述 | 第13-14页 |
| 1.3.2 PGPR的促生机制 | 第14-17页 |
| 1.3.2.1 PGPR的直接促生机制 | 第14-17页 |
| 1.3.2.2 PGPR的间接促生机制 | 第17页 |
| 1.3.3 PGPR的应用 | 第17页 |
| 1.4 代尔夫特菌 | 第17-18页 |
| 1.4.1 分类及生物学特性 | 第17-18页 |
| 1.4.2 功能 | 第18页 |
| 1.5 微生物基因组学研究 | 第18-19页 |
| 1.5.1 微生物基因组学分类 | 第19页 |
| 1.5.2 意义及潜在价值 | 第19页 |
| 1.6 基因敲除技术 | 第19-21页 |
| 1.6.1 基因敲除方法 | 第19-20页 |
| 1.6.2 基因敲除技术的应用 | 第20-21页 |
| 1.7 NRPS与铁载体合成 | 第21-22页 |
| 1.7.1 NRPS简介 | 第21页 |
| 1.7.2 NRPS与铁载体的关系 | 第21-22页 |
| 1.8 本研究的立项依据、研究内容、技术路线 | 第22-24页 |
| 1.8.1 立项依据 | 第22页 |
| 1.8.2 研究内容 | 第22-23页 |
| 1.8.3 技术路线 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-37页 |
| 2.1 菌株与质粒 | 第24页 |
| 2.2 培养基 | 第24-25页 |
| 2.3 仪器及试剂 | 第25-28页 |
| 2.3.1 仪器与设备 | 第25页 |
| 2.3.2 试剂及溶液 | 第25-28页 |
| 2.3.2.1 抗生素储存液 | 第25页 |
| 2.3.2.2 DNA提取试剂 | 第25-26页 |
| 2.3.2.3 PCR试剂及引物 | 第26页 |
| 2.3.2.4 CaCl_2法制备DH5α 感受态细胞试剂 | 第26-27页 |
| 2.3.2.5 酶及各种生化试剂 | 第27页 |
| 2.3.2.6 琼脂糖凝胶电泳试剂 | 第27页 |
| 2.3.2.7 连接转化试剂 | 第27页 |
| 2.3.2.8 CAS平板试剂 | 第27-28页 |
| 2.3.2.9 CAS检测液试剂 | 第28页 |
| 2.3.2.10 铁载体类型测定试剂 | 第28页 |
| 2.4 实验方法 | 第28-37页 |
| 2.4.1 基因组测序 | 第28页 |
| 2.4.2 基因组DNA提取 | 第28-29页 |
| 2.4.3 分子系统发育分析 | 第29页 |
| 2.4.4 比较基因组分析 | 第29-30页 |
| 2.4.5 MTQ3中相关基因的敲除 | 第30-34页 |
| 2.4.5.1 目的片段的扩增 | 第30页 |
| 2.4.5.2 目的片段的电泳检测及纯化 | 第30-31页 |
| 2.4.5.3 目的片段与克隆载体的连接 | 第31页 |
| 2.4.5.4 质粒DNA提取 | 第31-32页 |
| 2.4.5.5 目的片段和质粒载体的酶切 | 第32页 |
| 2.4.5.6 DNA片段的切胶回收 | 第32-33页 |
| 2.4.5.7 酶切后的目的片段与质粒载体的连接 | 第33页 |
| 2.4.5.8 大肠杆菌DH5α 感受态细胞的制备 | 第33页 |
| 2.4.5.9 大肠杆菌感受态细胞的转化 | 第33-34页 |
| 2.4.5.10 转化子菌落PCR检测 | 第34页 |
| 2.4.5.11 目的基因的敲除 | 第34页 |
| 2.4.6 MTQ3及突变株拮抗功能验证 | 第34-35页 |
| 2.4.7 MTQ3及NRPS突变株产铁载体能力的检测 | 第35-37页 |
| 2.4.7.1 定性检测 | 第35页 |
| 2.4.7.2 定量检测 | 第35页 |
| 2.4.7.3 MTQ3产铁载体类型检测 | 第35-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-48页 |
| 3.1 MTQ3基因组测序结果与分析 | 第37-39页 |
| 3.1.1 测序数据质量分析 | 第37-38页 |
| 3.1.2 测序结果分析 | 第38-39页 |
| 3.2 MTQ3系统发育分析 | 第39-40页 |
| 3.3 比较基因组分析 | 第40-43页 |
| 3.3.1 基因组一般特征 | 第40-41页 |
| 3.3.2 代尔夫特菌基因的COG功能分类 | 第41-42页 |
| 3.3.3 NRPS基因的比较分析 | 第42-43页 |
| 3.4 MTQ3中与抗菌物质合成相关基因的敲除 | 第43-44页 |
| 3.4.1 NRPS基因的敲除 | 第43-44页 |
| 3.4.2 抗生素合成基因的敲除 | 第44页 |
| 3.5 基因敲除突变株拮抗功能的验证 | 第44-45页 |
| 3.6 MTQ3与NRPS突变株产铁载体能力的检测 | 第45-46页 |
| 3.7 MTQ3产铁载体类型的检测 | 第46-48页 |
| 4 讨论 | 第48-50页 |
| 5 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读学位期间发表的论文及成果 | 第63页 |
