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综合KDMs的基因组和功能分析确定乳腺癌中可致癌的KDM2A亚型

前言第4-5页
中文摘要第5-8页
Abstract第8-11页
中英文缩略词对照表第12-17页
绪论第17-29页
    一、组蛋白赖氨酸去甲基化酶(KDMs)第17-18页
    二、KDM2 的结构和正常功能及其抑制剂概况第18-20页
        1.KDM2 的结构和正常功能第18-19页
        2.KDM2 抑制剂第19-20页
    三、KDM2A 的作用特性和疾病第20-23页
        1.KDM2A 的结构功能第20-21页
        2.KDM2A 在基因组功能维持中的作用第21页
        3.KDM2A 在肿瘤中的作用第21-22页
        4.KDM2A 在干细胞分化和血糖调节等中的作用第22-23页
    四、KDM2B 的作用特性和疾病第23-29页
        1.KDM2B 的结构特征第23页
        2.KDM2B 在细胞增殖和衰老死亡中的作用第23-24页
        3.KDM2B 促进成纤维细胞持续表达第24-25页
        4.KDM2B 与发育第25-26页
        5.KDM2B 与肿瘤第26-27页
        6.KDM2B 与其他疾病第27-29页
第一章 乳腺癌组织中 KDMs 的拷贝数、mRNA 表达和患者生存期之间的关系第29-45页
    1.1 实验材料第29页
        1.1.1 实验数据资料第29页
        1.1.2 实验设备第29页
    1.2 实验方法第29-32页
        1.2.1 癌症中重要靶标的基因组辨别(GISTIC)第30页
        1.2.2 Spearman 检验第30页
        1.2.3 Kendall 检验第30-31页
        1.2.4 Pearson 检验第31页
        1.2.5 对数秩检验(log-rank test)第31-32页
    1.3 实验结果第32-41页
        1.3.1 乳腺癌组织中 KDMs 拷贝数改变第32-34页
        1.3.2 KDMs 在乳腺癌组织中的 mRNA 表达水平第34-38页
        1.3.3 KDM2A mRNA 表达水平与乳腺癌患者生存期之间的相关性第38-41页
    1.4 讨论第41-45页
第二章 KDM2A 亚型对乳腺癌细胞恶性表型的影响第45-71页
    2.1 实验仪器设备第45-47页
    2.2 实验试剂第47-49页
    2.3 实验方法第49-59页
        2.3.1 qRT-PCR 检测 KDMs 在乳腺癌细胞系中 mRNA 表达水平第49-51页
        2.3.2 Western Blot 检测 KDM2A 在乳腺癌细胞中蛋白水平表达第51-54页
        2.3.3 MTT 实验检测沉默 KDM2A 后对乳腺癌细胞生长的影响第54-55页
        2.3.4 软琼脂克隆实验检测沉默 KDM2A 对乳腺癌细胞克隆形成能力的影响第55-56页
        2.3.5 通过 shRNA 转染 ZR75-1、T47D、MCF10A、SUM52 和SUM225 细胞沉默 KDM2A第56-58页
        2.3.6 Transwell 侵袭实验检测细胞侵袭能力第58-59页
        2.3.7 通过 siRNA 瞬时转染 ZR75-1 沉默 KDM2A 的长、短亚型第59页
    2.4 实验结果第59-68页
        2.4.1 KDM2A 在 18 种乳腺癌细胞系中的 mRNA 表达水平第59-60页
        2.4.2 KDM2A 长、短亚型在 DNA、mRNA 和蛋白水平的比较第60-63页
        2.4.3 沉默 KDM2A 抑制乳腺癌细胞 ZR75-1 和 T47D 的增殖第63-64页
        2.4.4 沉默 KDM2A 抑制乳腺癌细胞 ZR75-1 和 T47D 的克隆形成和侵袭能力第64-65页
        2.4.5 沉默 KDM2A 短亚型抑制乳腺癌细胞 ZR75-1 和 T47D 的增殖第65-68页
    2.5 讨论第68-71页
第三章 乳腺癌细胞中 KDM2A 靶标基因的筛查第71-81页
    3.1 实验仪器设备第71-72页
    3.2 实验试剂第72-74页
    3.3 实验方法第74-76页
        3.3.1 RNA 高通量测序(RNA-Seq)第74页
        3.3.2 qRT-PCR 验证差异表达基因第74-76页
    3.4 实验结果第76-79页
        3.4.1 乳腺癌细胞中 KDM2A 靶标基因的筛查第76-78页
        3.4.2 Spearman 检测乳腺癌组织中差异基因与 KDM2A 表达的相关性第78-79页
    3.5 讨论第79-81页
结论第81-83页
课题创新性总结第83-85页
参考文献第85-93页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第93-95页
后记和致谢第95页

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