前言 | 第4-5页 |
中文摘要 | 第5-8页 |
Abstract | 第8-11页 |
中英文缩略词对照表 | 第12-17页 |
绪论 | 第17-29页 |
一、组蛋白赖氨酸去甲基化酶(KDMs) | 第17-18页 |
二、KDM2 的结构和正常功能及其抑制剂概况 | 第18-20页 |
1.KDM2 的结构和正常功能 | 第18-19页 |
2.KDM2 抑制剂 | 第19-20页 |
三、KDM2A 的作用特性和疾病 | 第20-23页 |
1.KDM2A 的结构功能 | 第20-21页 |
2.KDM2A 在基因组功能维持中的作用 | 第21页 |
3.KDM2A 在肿瘤中的作用 | 第21-22页 |
4.KDM2A 在干细胞分化和血糖调节等中的作用 | 第22-23页 |
四、KDM2B 的作用特性和疾病 | 第23-29页 |
1.KDM2B 的结构特征 | 第23页 |
2.KDM2B 在细胞增殖和衰老死亡中的作用 | 第23-24页 |
3.KDM2B 促进成纤维细胞持续表达 | 第24-25页 |
4.KDM2B 与发育 | 第25-26页 |
5.KDM2B 与肿瘤 | 第26-27页 |
6.KDM2B 与其他疾病 | 第27-29页 |
第一章 乳腺癌组织中 KDMs 的拷贝数、mRNA 表达和患者生存期之间的关系 | 第29-45页 |
1.1 实验材料 | 第29页 |
1.1.1 实验数据资料 | 第29页 |
1.1.2 实验设备 | 第29页 |
1.2 实验方法 | 第29-32页 |
1.2.1 癌症中重要靶标的基因组辨别(GISTIC) | 第30页 |
1.2.2 Spearman 检验 | 第30页 |
1.2.3 Kendall 检验 | 第30-31页 |
1.2.4 Pearson 检验 | 第31页 |
1.2.5 对数秩检验(log-rank test) | 第31-32页 |
1.3 实验结果 | 第32-41页 |
1.3.1 乳腺癌组织中 KDMs 拷贝数改变 | 第32-34页 |
1.3.2 KDMs 在乳腺癌组织中的 mRNA 表达水平 | 第34-38页 |
1.3.3 KDM2A mRNA 表达水平与乳腺癌患者生存期之间的相关性 | 第38-41页 |
1.4 讨论 | 第41-45页 |
第二章 KDM2A 亚型对乳腺癌细胞恶性表型的影响 | 第45-71页 |
2.1 实验仪器设备 | 第45-47页 |
2.2 实验试剂 | 第47-49页 |
2.3 实验方法 | 第49-59页 |
2.3.1 qRT-PCR 检测 KDMs 在乳腺癌细胞系中 mRNA 表达水平 | 第49-51页 |
2.3.2 Western Blot 检测 KDM2A 在乳腺癌细胞中蛋白水平表达 | 第51-54页 |
2.3.3 MTT 实验检测沉默 KDM2A 后对乳腺癌细胞生长的影响 | 第54-55页 |
2.3.4 软琼脂克隆实验检测沉默 KDM2A 对乳腺癌细胞克隆形成能力的影响 | 第55-56页 |
2.3.5 通过 shRNA 转染 ZR75-1、T47D、MCF10A、SUM52 和SUM225 细胞沉默 KDM2A | 第56-58页 |
2.3.6 Transwell 侵袭实验检测细胞侵袭能力 | 第58-59页 |
2.3.7 通过 siRNA 瞬时转染 ZR75-1 沉默 KDM2A 的长、短亚型 | 第59页 |
2.4 实验结果 | 第59-68页 |
2.4.1 KDM2A 在 18 种乳腺癌细胞系中的 mRNA 表达水平 | 第59-60页 |
2.4.2 KDM2A 长、短亚型在 DNA、mRNA 和蛋白水平的比较 | 第60-63页 |
2.4.3 沉默 KDM2A 抑制乳腺癌细胞 ZR75-1 和 T47D 的增殖 | 第63-64页 |
2.4.4 沉默 KDM2A 抑制乳腺癌细胞 ZR75-1 和 T47D 的克隆形成和侵袭能力 | 第64-65页 |
2.4.5 沉默 KDM2A 短亚型抑制乳腺癌细胞 ZR75-1 和 T47D 的增殖 | 第65-68页 |
2.5 讨论 | 第68-71页 |
第三章 乳腺癌细胞中 KDM2A 靶标基因的筛查 | 第71-81页 |
3.1 实验仪器设备 | 第71-72页 |
3.2 实验试剂 | 第72-74页 |
3.3 实验方法 | 第74-76页 |
3.3.1 RNA 高通量测序(RNA-Seq) | 第74页 |
3.3.2 qRT-PCR 验证差异表达基因 | 第74-76页 |
3.4 实验结果 | 第76-79页 |
3.4.1 乳腺癌细胞中 KDM2A 靶标基因的筛查 | 第76-78页 |
3.4.2 Spearman 检测乳腺癌组织中差异基因与 KDM2A 表达的相关性 | 第78-79页 |
3.5 讨论 | 第79-81页 |
结论 | 第81-83页 |
课题创新性总结 | 第83-85页 |
参考文献 | 第85-93页 |
作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第93-95页 |
后记和致谢 | 第95页 |