利用芯片筛选木薯干旱与乙烯响应相关基因
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 目录 | 第6-9页 |
| 1 序言 | 第9-20页 |
| 1.1 植物器官脱落 | 第9-10页 |
| 1.1.1 脱落对植物的影响 | 第9页 |
| 1.1.2 脱落的调控 | 第9-10页 |
| 1.2 干旱胁迫与植物抗旱 | 第10-11页 |
| 1.3 植物激素乙烯 | 第11-15页 |
| 1.3.1 乙烯与植物生长 | 第11-12页 |
| 1.3.2 乙烯与植物非生物胁迫的响应 | 第12-14页 |
| 1.3.3 乙烯在脱落过程中的作用 | 第14-15页 |
| 1.4 芯片技术 | 第15-16页 |
| 1.4.1 芯片技术简介 | 第15-16页 |
| 1.4.2 芯片技术的应用 | 第16页 |
| 1.5 木薯概述 | 第16-18页 |
| 1.5.1 木薯概况 | 第16-17页 |
| 1.5.2 木薯研究进展 | 第17-18页 |
| 1.6 Fv/Fm的引入 | 第18页 |
| 1.7 研究内容 | 第18页 |
| 1.8 研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 1.9 技术路线 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-28页 |
| 2.1 材料 | 第20-22页 |
| 2.1.1 仪器与设备 | 第20页 |
| 2.1.2 芯片平台 | 第20页 |
| 2.1.3 主要使用的数据库 | 第20页 |
| 2.1.4 主要试剂盒 | 第20页 |
| 2.1.5 主要化学试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.6 实验材料的培养与处理 | 第21-22页 |
| 2.1.6.1 芯片杂交材料的培养 | 第21页 |
| 2.1.6.2 乙烯测定材料的培养 | 第21页 |
| 2.1.6.3 样品采集 | 第21-22页 |
| 2.2 方法 | 第22-28页 |
| 2.2.1 利用芯片筛选差异表达基因 | 第22-27页 |
| 2.2.1.1 RNA提取 | 第22-23页 |
| 2.2.1.2 RNA的甲醛变性电泳检测 | 第23页 |
| 2.2.1.3 总RNA的浓度检测 | 第23-24页 |
| 2.2.1.4 样品RNA进行荧光标记 | 第24页 |
| 2.2.1.5 芯片信号扫描 | 第24页 |
| 2.2.1.6 生物信息学分析 | 第24-25页 |
| 2.2.1.7 除去RNA中的基因组DNA | 第25页 |
| 2.2.1.8 cDNA合成 | 第25-26页 |
| 2.2.1.9 Real-time PCR | 第26-27页 |
| 2.2.2 干旱胁迫时木薯内源乙烯测定 | 第27-28页 |
| 2.2.2.1 乙烯测定样品的处理 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-40页 |
| 3.1 各采样点的植株形态 | 第28-29页 |
| 3.2 Fv/Fm的测定结果 | 第29-30页 |
| 3.3 乙烯测定结果 | 第30-31页 |
| 3.3.1 干旱胁迫对木薯功能叶内源乙烯的影响 | 第30页 |
| 3.3.2 干旱胁迫对木薯离层内源乙烯的影响 | 第30-31页 |
| 3.4 木薯总RNA提取 | 第31-32页 |
| 3.5 反转录cDNA合成 | 第32-33页 |
| 3.6 芯片的结果 | 第33-34页 |
| 3.7 干旱胁迫响应基因类型 | 第34-37页 |
| 3.8 乙烯处理非离区响应基因类型 | 第37页 |
| 3.9 乙烯处理离区响应基因类型 | 第37页 |
| 3.10 交集分析 | 第37-38页 |
| 3.11 Real-time PCR验证体系 | 第38-40页 |
| 4 讨论 | 第40-46页 |
| 4.1 芯片技术应用与非模式生物 | 第40页 |
| 4.2 生物信息学的辅助 | 第40-41页 |
| 4.3 生理学与分子生物学之间的相互补充 | 第41-42页 |
| 4.4 木薯RNA提取的注意事项 | 第42页 |
| 4.5 乙烯作用下离层形成可能的关键基因 | 第42-43页 |
| 4.6 干旱胁迫时可能引起落叶的基因通路 | 第43-46页 |
| 4.7 正在进行的工作 | 第46页 |
| 参考文献 | 第46-52页 |
| 附录 | 第52-63页 |
| 1. 主要试剂配方 | 第52页 |
| 2. 基因功能分类统计 | 第52-60页 |
| 2.1 干旱胁迫上调基因分类统计 | 第53-54页 |
| 2.2 干旱胁迫下调基因分类统计 | 第54-55页 |
| 2.3 乙烯处理非离区上调基因分类统计 | 第55-56页 |
| 2.4 乙烯处理非离区下调基因分类统计 | 第56-57页 |
| 2.5 乙烯处理离区上调基因分类统计 | 第57-58页 |
| 2.6 乙烯处理离区下调基因分类统计 | 第58-59页 |
| 2.7 离区特异上调表达基因分类统计 | 第59-60页 |
| 3. Real-time PCR | 第60-63页 |
| 3.1 部分溶解曲线 | 第60-61页 |
| 3.2 干旱响应基因的验证 | 第61-62页 |
| 3.3 干旱与乙烯共表达的基因验证 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
