摘要 | 第2-5页 |
Abstract | 第5-8页 |
中英文对照及缩略词表 | 第9-15页 |
第1章 前言 | 第15-25页 |
1.1 研究背景 | 第15-23页 |
1.1.1 喹诺酮类药物及作用机理概述 | 第15页 |
1.1.2 喹诺酮类药物的耐药机制 | 第15-21页 |
1.1.2.1 靶位DNA解旋酶和拓扑异构酶Ⅳ突变 | 第16页 |
1.1.2.2 主动外排系统过表达 | 第16-17页 |
1.1.2.3 膜通透性屏障 | 第17页 |
1.1.2.4 质粒介导的喹诺酮耐药 | 第17-21页 |
1.1.3 PMQR的流行情况 | 第21-23页 |
1.2 研究目的及意义 | 第23-24页 |
1.3 研究技术路线 | 第24-25页 |
第2章 不同来源大肠杆菌中oqxAB和qepA流行性调查 | 第25-40页 |
2.1 引言 | 第25页 |
2.2 材料与方法 | 第25-32页 |
2.2.1 材料 | 第25-27页 |
2.2.1.1 样品来源 | 第25页 |
2.2.1.2 质控菌 | 第25-26页 |
2.2.1.3 抗菌药物 | 第26页 |
2.2.1.4 培养基及细菌生化鉴定管 | 第26页 |
2.2.1.5 主要试剂 | 第26-27页 |
2.2.2 方法 | 第27-32页 |
2.2.2.1 细菌的复苏 | 第27页 |
2.2.2.2 细菌分离与保存 | 第27-28页 |
2.2.2.3 琼脂稀释法测最小抑菌浓度(MICs) | 第28-29页 |
2.2.2.4 PMQR的基因检测及鉴定 | 第29-32页 |
2.3 结果与分析 | 第32-37页 |
2.3.1 细菌的复苏和分离结果 | 第32页 |
2.3.2 敏感性测试结果 | 第32-33页 |
2.3.3 PMQR基因检测结果 | 第33-37页 |
2.4 讨论 | 第37-39页 |
2.4.1 耐药性分析 | 第37-38页 |
2.4.2 PMQR基因流行状况 | 第38-39页 |
2.5 小结 | 第39-40页 |
第3章 oqxAB和qepA传播机制研究 | 第40-69页 |
3.1 引言 | 第40页 |
3.2 材料与方法 | 第40-59页 |
3.2.1 材料 | 第40-43页 |
3.2.1.1 受试菌株 | 第40页 |
3.2.1.2 药物 | 第40页 |
3.2.1.3 培养基 | 第40-41页 |
3.2.1.4 主要试剂和试剂盒 | 第41页 |
3.2.1.5 主要溶液的配制 | 第41-43页 |
3.2.1.6 主要仪器与设备 | 第43页 |
3.2.2 方法 | 第43-59页 |
3.2.2.1 脉冲场凝胶电泳(PFGE) | 第43-46页 |
3.2.2.2 接合转移/电转化试验 | 第46-48页 |
3.2.2.3 接合子/转化子质粒复制子分型 | 第48-50页 |
3.2.2.4 oqxAB基因侧翼序列的测定 | 第50-51页 |
3.2.2.5 转化子质粒的抽提 | 第51-53页 |
3.2.2.6 oqxAB转化子质粒的酶切分析 | 第53页 |
3.2.2.7 S1-PFGE | 第53-56页 |
3.2.2.8 Southern杂交 | 第56-59页 |
3.3 结果与分析 | 第59-66页 |
3.3.1 PFGE结果 | 第59页 |
3.3.2 接合转移/电转化试验 | 第59-60页 |
3.3.2.1 接合子/电转子筛选结果 | 第59页 |
3.3.2.2 qepA阳性接合子的MIC结果 | 第59页 |
3.3.2.3 oqxAB阳性转化子的MIC结果 | 第59-60页 |
3.3.3 S1-PFGE和Southern杂交结果 | 第60页 |
3.3.4 接合子/电转子质粒的复制子分型 | 第60-63页 |
3.3.5 oqxAB质粒酶切分析 | 第63-64页 |
3.3.6 oqxAB基因环境 | 第64-66页 |
3.4 讨论 | 第66-68页 |
3.5 小结 | 第68-69页 |
第4章 oqxAB多重耐药质粒序列分析 | 第69-96页 |
4.1 引言 | 第69页 |
4.2 材料与方法 | 第69-71页 |
4.2.1 材料 | 第69页 |
4.2.2 方法 | 第69-71页 |
4.2.2.1 质粒DNA的提取 | 第69页 |
4.2.2.2 质粒全基因组的测序 | 第69-70页 |
4.2.2.3 IncX复制子的检测 | 第70-71页 |
4.3 结果与分析 | 第71-92页 |
4.3.1 质粒测序结果 | 第71页 |
4.3.2 pHNZY32序列特征分析 | 第71-83页 |
4.3.2.1 pHNZY32序列blast结果 | 第71页 |
4.3.2.2 pHNZY32的注释 | 第71-83页 |
4.3.3 质粒特征分析 | 第83-92页 |
4.3.3.1 pHNZY32质粒全图 | 第83-84页 |
4.3.3.2 pHNZY32与相似质粒全序列比较 | 第84页 |
4.3.3.3 耐药区结构 | 第84-88页 |
4.3.3.4 复制区结构 | 第88-92页 |
4.4 讨论 | 第92-95页 |
4.5 结论 | 第95-96页 |
第5章 携带qepA的IncFII质粒序列分析 | 第96-115页 |
5.1 引言 | 第96页 |
5.2 材料与方法 | 第96-98页 |
5.2.1 材料 | 第96-97页 |
5.2.2 方法 | 第97-98页 |
5.2.2.1 转化子质粒DNA的提取 | 第97页 |
5.2.2.2 质粒的全序列测定 | 第97-98页 |
5.3 结果与分析 | 第98-111页 |
5.3.1 质粒全序列测序结果 | 第98页 |
5.3.2 质粒pHN7A8序列特征分析 | 第98-106页 |
5.3.2.1 pHN3A11全序列blast结果 | 第98-100页 |
5.3.2.2 pH3A11的ORFs查找 | 第100页 |
5.3.2.3 序列注释 | 第100-106页 |
5.3.3 质粒特征分析图 | 第106-111页 |
5.3.3.1 pH3A11质粒全图 | 第106-107页 |
5.3.3.2 pH3A11与相似质粒骨架序列的比较 | 第107页 |
5.3.3.3 pHN3A11质序列的复制区、转移先导区以及多重耐药区结构分析 | 第107页 |
5.3.3.4 pHN3A11相似质粒的检测 | 第107-111页 |
5.4 讨论 | 第111-113页 |
5.5 小结 | 第113-115页 |
全文结论 | 第115-116页 |
论文创新点 | 第116-117页 |
致谢 | 第117-118页 |
参考文献 | 第118-129页 |
附录:发表文章及参加的相关学术会议 | 第129-131页 |