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不同来源大肠杆菌中喹诺酮外排泵基因oqxAB和qepA的传播机制研究

摘要第2-5页
Abstract第5-8页
中英文对照及缩略词表第9-15页
第1章 前言第15-25页
    1.1 研究背景第15-23页
        1.1.1 喹诺酮类药物及作用机理概述第15页
        1.1.2 喹诺酮类药物的耐药机制第15-21页
            1.1.2.1 靶位DNA解旋酶和拓扑异构酶Ⅳ突变第16页
            1.1.2.2 主动外排系统过表达第16-17页
            1.1.2.3 膜通透性屏障第17页
            1.1.2.4 质粒介导的喹诺酮耐药第17-21页
        1.1.3 PMQR的流行情况第21-23页
    1.2 研究目的及意义第23-24页
    1.3 研究技术路线第24-25页
第2章 不同来源大肠杆菌中oqxAB和qepA流行性调查第25-40页
    2.1 引言第25页
    2.2 材料与方法第25-32页
        2.2.1 材料第25-27页
            2.2.1.1 样品来源第25页
            2.2.1.2 质控菌第25-26页
            2.2.1.3 抗菌药物第26页
            2.2.1.4 培养基及细菌生化鉴定管第26页
            2.2.1.5 主要试剂第26-27页
        2.2.2 方法第27-32页
            2.2.2.1 细菌的复苏第27页
            2.2.2.2 细菌分离与保存第27-28页
            2.2.2.3 琼脂稀释法测最小抑菌浓度(MICs)第28-29页
            2.2.2.4 PMQR的基因检测及鉴定第29-32页
    2.3 结果与分析第32-37页
        2.3.1 细菌的复苏和分离结果第32页
        2.3.2 敏感性测试结果第32-33页
        2.3.3 PMQR基因检测结果第33-37页
    2.4 讨论第37-39页
        2.4.1 耐药性分析第37-38页
        2.4.2 PMQR基因流行状况第38-39页
    2.5 小结第39-40页
第3章 oqxAB和qepA传播机制研究第40-69页
    3.1 引言第40页
    3.2 材料与方法第40-59页
        3.2.1 材料第40-43页
            3.2.1.1 受试菌株第40页
            3.2.1.2 药物第40页
            3.2.1.3 培养基第40-41页
            3.2.1.4 主要试剂和试剂盒第41页
            3.2.1.5 主要溶液的配制第41-43页
            3.2.1.6 主要仪器与设备第43页
        3.2.2 方法第43-59页
            3.2.2.1 脉冲场凝胶电泳(PFGE)第43-46页
            3.2.2.2 接合转移/电转化试验第46-48页
            3.2.2.3 接合子/转化子质粒复制子分型第48-50页
            3.2.2.4 oqxAB基因侧翼序列的测定第50-51页
            3.2.2.5 转化子质粒的抽提第51-53页
            3.2.2.6 oqxAB转化子质粒的酶切分析第53页
            3.2.2.7 S1-PFGE第53-56页
            3.2.2.8 Southern杂交第56-59页
    3.3 结果与分析第59-66页
        3.3.1 PFGE结果第59页
        3.3.2 接合转移/电转化试验第59-60页
            3.3.2.1 接合子/电转子筛选结果第59页
            3.3.2.2 qepA阳性接合子的MIC结果第59页
            3.3.2.3 oqxAB阳性转化子的MIC结果第59-60页
        3.3.3 S1-PFGE和Southern杂交结果第60页
        3.3.4 接合子/电转子质粒的复制子分型第60-63页
        3.3.5 oqxAB质粒酶切分析第63-64页
        3.3.6 oqxAB基因环境第64-66页
    3.4 讨论第66-68页
    3.5 小结第68-69页
第4章 oqxAB多重耐药质粒序列分析第69-96页
    4.1 引言第69页
    4.2 材料与方法第69-71页
        4.2.1 材料第69页
        4.2.2 方法第69-71页
            4.2.2.1 质粒DNA的提取第69页
            4.2.2.2 质粒全基因组的测序第69-70页
            4.2.2.3 IncX复制子的检测第70-71页
    4.3 结果与分析第71-92页
        4.3.1 质粒测序结果第71页
        4.3.2 pHNZY32序列特征分析第71-83页
            4.3.2.1 pHNZY32序列blast结果第71页
            4.3.2.2 pHNZY32的注释第71-83页
        4.3.3 质粒特征分析第83-92页
            4.3.3.1 pHNZY32质粒全图第83-84页
            4.3.3.2 pHNZY32与相似质粒全序列比较第84页
            4.3.3.3 耐药区结构第84-88页
            4.3.3.4 复制区结构第88-92页
    4.4 讨论第92-95页
    4.5 结论第95-96页
第5章 携带qepA的IncFII质粒序列分析第96-115页
    5.1 引言第96页
    5.2 材料与方法第96-98页
        5.2.1 材料第96-97页
        5.2.2 方法第97-98页
            5.2.2.1 转化子质粒DNA的提取第97页
            5.2.2.2 质粒的全序列测定第97-98页
    5.3 结果与分析第98-111页
        5.3.1 质粒全序列测序结果第98页
        5.3.2 质粒pHN7A8序列特征分析第98-106页
            5.3.2.1 pHN3A11全序列blast结果第98-100页
            5.3.2.2 pH3A11的ORFs查找第100页
            5.3.2.3 序列注释第100-106页
        5.3.3 质粒特征分析图第106-111页
            5.3.3.1 pH3A11质粒全图第106-107页
            5.3.3.2 pH3A11与相似质粒骨架序列的比较第107页
            5.3.3.3 pHN3A11质序列的复制区、转移先导区以及多重耐药区结构分析第107页
            5.3.3.4 pHN3A11相似质粒的检测第107-111页
    5.4 讨论第111-113页
    5.5 小结第113-115页
全文结论第115-116页
论文创新点第116-117页
致谢第117-118页
参考文献第118-129页
附录:发表文章及参加的相关学术会议第129-131页

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