| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第6-9页 |
| 1.1 课题的背景 | 第6-7页 |
| 1.2 课题研究内容 | 第7-8页 |
| 1.3 本文结构 | 第8-9页 |
| 第二章 小鼠基因诱变项目信息系统技术基础 | 第9-27页 |
| 2.1 小鼠基因诱变项目的相关生物学技术 | 第9-11页 |
| 2.1.1 模式生物与实验小鼠 | 第9页 |
| 2.1.2 基因诱变与PB技术原理 | 第9-10页 |
| 2.1.3 使用PB技术在小鼠体内产生基因插入诱变的过程 | 第10-11页 |
| 2.2 实验室信息管理系统相关技术研究 | 第11-13页 |
| 2.2.1 实验室信息管理系统(Laboratory Information ManagementSystem) | 第11页 |
| 2.2.2 实验室信息系统架构分类 | 第11-12页 |
| 2.2.3 基于Web技术的实验室信息管理系统的组成构件 | 第12-13页 |
| 2.3 实验室信息系统集成 | 第13-16页 |
| 2.3.1 企业应用集成 | 第14-16页 |
| 2.4 基因组学数据库管理技术 | 第16-26页 |
| 2.4.1 基因组学数据管理的挑战 | 第16-17页 |
| 2.4.2 应对挑战的技术 | 第17-18页 |
| 2.4.3 图数据模型 | 第18-20页 |
| 2.4.4 基于图模型的语义的信息检索技术 | 第20-21页 |
| 2.4.5 图数据库系统 | 第21-22页 |
| 2.4.6 Neo4J图数据库系统 | 第22-23页 |
| 2.4.7 RDF数据库系统 | 第23-26页 |
| 2.5 本章小结 | 第26-27页 |
| 第三章 实验小鼠信息管理系统设计与构建 | 第27-47页 |
| 3.1 实验小鼠信息系统 | 第27页 |
| 3.2 功能需求 | 第27-30页 |
| 3.2.1 PB诱变产新与保种需求 | 第27-29页 |
| 3.2.2 用户权限管理 | 第29-30页 |
| 3.3 实验小鼠信息系统设计与实现 | 第30-46页 |
| 3.3.1 MausDB实验小鼠表型研究管理系统 | 第30-31页 |
| 3.3.2 软件架构的改造 | 第31-35页 |
| 3.3.3 小鼠基因型聚合酶链式反应(PCR)检测工作流管理 | 第35-40页 |
| 3.3.4 基于角色—域的访问权限管理子系统 | 第40-45页 |
| 3.3.5 基于Web的报表界面 | 第45-46页 |
| 3.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 MP-PBmice系统插入点数据分析自动化 | 第47-59页 |
| 4.1 插入突变点定位原理 | 第47-49页 |
| 4.1.1 反向聚合酶链式反应实验 | 第47页 |
| 4.1.2 基因组图谱 | 第47-48页 |
| 4.1.3 基因组注释 | 第48页 |
| 4.1.4 DNA序列比对 | 第48-49页 |
| 4.2 MP-PBmice插入点数据分析 | 第49-58页 |
| 4.2.1 MP-PBmice插入突变定位流程 | 第49-50页 |
| 4.2.2 手工Blast定位过程 | 第50-52页 |
| 4.2.3 自动化Blast定位与注释信息采集系统 | 第52-53页 |
| 4.2.4 基于消息队列的分布式系统集成 | 第53-56页 |
| 4.2.5 基因组注释数据库索引优化 | 第56-58页 |
| 4.3 本章小结 | 第58-59页 |
| 第五章 基于图数据库的PBmi ce数据库语义检索系统 | 第59-67页 |
| 5.1 PBmice数据库检索需求 | 第59-61页 |
| 5.2 语义检索系统技术方案论证 | 第61-63页 |
| 5.2.1 PBmice数据库语义检索系统架构的概要设计 | 第61-62页 |
| 5.2.2 语义Web技术与属性图技术的比较 | 第62-63页 |
| 5.3 PBmice数据库语义检索系统架构设计 | 第63-66页 |
| 5.3.1 Neo4J嵌入式部署 | 第64页 |
| 5.3.2 基于令牌的身份认证机制 | 第64-65页 |
| 5.3.3 可视化的人机交互界面 | 第65-66页 |
| 5.4 本章小结 | 第66-67页 |
| 第六章 总结 | 第67-68页 |
| 6.1 PBmice实验小鼠基因诱变项目信息系统优化工作总结 | 第67页 |
| 6.2 不足与展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
