| 中文摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 文献综述 | 第13-18页 |
| 第一章 牛支原体快速检测方法的建立 | 第18-34页 |
| 1 材料 | 第18-19页 |
| 1.1 病料 | 第18页 |
| 1.2 试剂 | 第18-19页 |
| 1.3 主要仪器 | 第19页 |
| 2 方法 | 第19-24页 |
| 2.1 牛支原体PCR检测方法的建立 | 第19-21页 |
| 2.2 牛支原体Taq Man实时荧光定量PCR检测方法的建立 | 第21-24页 |
| 3 结果 | 第24-32页 |
| 3.1 牛支原体普通PCR方法的建立 | 第24-26页 |
| 3.2 实时荧光PCR检测方法的建立 | 第26-32页 |
| 4 讨论 | 第32-34页 |
| 4.1 关于牛支原体检测方法 | 第32页 |
| 4.2 关于牛支原体PCR检测方法靶标基因选择 | 第32页 |
| 4.3 关于牛支原体快速检测方法敏感性 | 第32-34页 |
| 第二章 牛支原体贵州流行株的分离鉴定 | 第34-48页 |
| 1 材料 | 第34-35页 |
| 1.1 病料及血清样本 | 第34页 |
| 1.2 主要试剂 | 第34-35页 |
| 1.3 主要仪器 | 第35页 |
| 2 方法 | 第35-39页 |
| 2.1 临床阳性样本采集与筛选 | 第35-36页 |
| 2.2 菌株分离培养 | 第36页 |
| 2.3 牛支原体贵州分离株的鉴定 | 第36-39页 |
| 3 结果 | 第39-46页 |
| 3.1 临床阳性样本筛选 | 第39-41页 |
| 3.2 菌株分离培养及鉴定 | 第41-43页 |
| 3.3 分子生物学鉴定结果 | 第43-46页 |
| 4 讨论 | 第46-48页 |
| 4.1 关于牛支原体肺炎病例筛选 | 第46页 |
| 4.2 关于牛支原体分离培养 | 第46-47页 |
| 4.3 关于牛支原体鉴定 | 第47-48页 |
| 第三章 牛支原体贵州株GZ-2 全基因测序 | 第48-62页 |
| 1 材料 | 第48页 |
| 1.1 样本来源 | 第48页 |
| 1.2 主要试剂 | 第48页 |
| 1.3 主要仪器 | 第48页 |
| 2 方法 | 第48-49页 |
| 2.1 牛支原体贵州株GZ-2 基因组总DNA提取 | 第48-49页 |
| 2.2 牛支原体贵州株全基因DNA的质量检测 | 第49页 |
| 2.3 测序及注释方法 | 第49页 |
| 2.4 基因组组装评价方法 | 第49页 |
| 2.5 基因组组分分析方法 | 第49页 |
| 2.6 生物信息学分析方法 | 第49页 |
| 3 结果 | 第49-60页 |
| 3.1 全基因组序列DNA样品检测结果 | 第49-50页 |
| 3.2 基因组组装及评价结果 | 第50-51页 |
| 3.3 基因组组分分析结果 | 第51-52页 |
| 3.4 牛支原体同源基因及功能基因 | 第52-60页 |
| 4 讨论 | 第60-62页 |
| 4.1 关于全基因组测序效率 | 第60页 |
| 4.2 关于全基因组测序结果分析 | 第60-61页 |
| 4.3 关于可研究基因的选择 | 第61-62页 |
| 第四章 牛支原体贵州株主要功能基因分子特征分析 | 第62-82页 |
| 1 材料 | 第62页 |
| 1.1 测序序列 | 第62页 |
| 1.2 分析软件 | 第62页 |
| 2 方法 | 第62-63页 |
| 2.1 M.bovis功能蛋白理化性质分析 | 第62-63页 |
| 2.2 M.bovis功能蛋白基因序列分析 | 第63页 |
| 2.3 M.bovis功能蛋白抗原表位预测 | 第63页 |
| 3 结果 | 第63-80页 |
| 3.1 vsp家族蛋白基因分子特征分析结果 | 第63-68页 |
| 3.2 防御机制蛋白基因分子特征分析结果 | 第68-72页 |
| 3.3 粘附蛋白基因分子特征分析结果 | 第72-80页 |
| 4 讨论 | 第80-82页 |
| 4.1 关于牛支原体功能蛋白分析选择 | 第80页 |
| 4.2 牛支原体防御相关蛋白 | 第80-81页 |
| 4.3 关于VSP家族基因分子特征 | 第81-82页 |
| 全文结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-88页 |
| 附录一 牛支原体生化鉴定配制 | 第88-90页 |
| 附录二 文章发表情况 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |