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R语言在藓类形态与遗传变异研究中的应用--以大灰藓为例

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 研究综述第12-24页
    1.1 大灰藓及研究概况第12-17页
        1.1.1 大灰藓的形态和分类地位第12-13页
        1.1.2 早期灰藓属分类研究第13-15页
        1.1.3 近代灰藓属研究概况第15-16页
        1.1.4 大灰藓和水稻遗传关系研究第16页
        1.1.5 以大灰藓为对象的其他方面研究第16-17页
    1.2 基于ISSR标记的种群遗传结构和遗传多样性研究第17-19页
        1.2.1 ISSR分子标记技术简介第17页
        1.2.2 苔藓植物遗传多样性特点第17-19页
    1.3 苔藓植物形态变异特点的研究第19-20页
    1.4 植物形态变异及多样性分析的数学方法第20-24页
        1.4.1 聚类分析第20页
        1.4.2 主成分分析第20-21页
        1.4.3 最小生成树法第21-22页
        1.4.4 排序、聚类、最小生成树相结合的方法第22页
        1.4.5 R语言及其在植物遗传多样性上应用第22-23页
        1.4.6 本文的研究目的和意义第23-24页
第二章 材料与实验方法第24-29页
    2.1 材料来源第24-26页
    2.2 实验方法第26-29页
        2.2.1 实验器材第26页
        2.2.2 大灰藓形态观察及形态学指标第26-27页
        2.2.3 ISSR实验方法及分析步骤第27-29页
第三章 数据分析方法第29-40页
    3.1 聚类分析第29-34页
        3.1.1 聚类分析原理第29页
        3.1.2 聚类分析中对象间相似关系测度第29-30页
        3.1.3 聚类策略第30-31页
        3.1.4 聚类分析的R语言实现第31-34页
    3.2 主成分分析第34-36页
        3.2.1 主成分分析的概念第34页
        3.2.2 主成分分析的R语言实现第34-36页
    3.3 聚类和排序结果同图展示的R语言实现第36-37页
    3.4 最小生成树的R语言实现第37-38页
    3.5 群体遗传分化和多样性研究第38页
    3.6 大灰藓形态变异的遗传背景分析第38-40页
第四章 大灰藓部分种群遗传分化和多样性第40-58页
    4.1 大灰藓部分种群ISSR扩增条带多样性分析第40-42页
    4.2 基于ISSR标记的大灰藓复合体遗传分化第42-58页
        4.2.1 聚类分析结果第42-49页
        4.2.2 主成分分析结果第49-54页
        4.2.3 结合排序和聚类方法的结果显示第54-55页
        4.2.4 最小生成树第55-58页
第五章 大灰藓形态变异数据分析第58-67页
    5.1 大灰藓形态与遗传变异的相关性第58页
    5.2 大灰藓形态分化与地理来源的相关性第58-62页
    5.3 大灰藓群体形态分化特点第62-67页
第六章 总结与讨论第67-72页
    6.1 有关R语言在苔藓植物形态与遗传变异研究上的价值第67-68页
    6.2 有关大灰藓的遗传多样性第68-70页
    6.3 大灰藓形态、遗传变异相关性及其地理背景第70-72页
参考文献第72-78页
附图第78-91页
致谢第91页

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